圓筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)是長江中上游及其支流的特有魚類。近年來,隨著水電工程、環(huán)境污染、過度捕撈、外來物種入侵等多因素的干擾,使水生生物多樣性面臨巨大的挑戰(zhàn)。三峽大壩蓄水水位的不斷提高,向家壩水利工程的投入使用,都嚴重影響長江上游魚類的棲息地和生物量,圓筒吻鮈的群體數(shù)量也相應減少。為了對圓筒吻鮈的生物資源提供有效保護,必須對其遺傳結(jié)構(gòu)有充分的了解。本文采用兩種分子標記(線粒體DNA分子標記和微衛(wèi)星標記)探討長江上游宜賓(YB)、萬州(WZ)、江津(JJ)和合江(HJ)四個圓筒吻鮈群體的遺傳結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果主要如下：(1)分析了122尾圓筒吻鮈的線粒體Cyt b序列,共檢測出22個單倍型,62個變異位點,圓筒吻鮈種群平均單倍型多樣性指數(shù)為0.716,平均核營酸多樣性指數(shù)為0.01006,單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)最高的均為宜賓群體。分析112尾圓筒吻鮈的控制區(qū)序列,共檢測出30個單倍型,60個變異位點,平均單倍型多樣性指數(shù)為0.840,其中單倍型多樣性最高的為宜賓群體,平均核苷酸多樣性指數(shù)為0.01278,核苷酸多樣性指數(shù)最高的為萬州群體。合江(HJ...

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2-1基于線粒體DNACytb基因構(gòu)建的圓筒吻的Cy

西南大學碩ｉｆｃ學位論文??Ｈａｐ＿＿ｌ、Ｈａｐ＿２位于圖中最基礎(chǔ)的位置，推測其可能為較原始的單倍型，其他單??倍型均由上述兩個單倍型經(jīng)一步或者多步突變而形成。??

圖３－１微衛(wèi)星多態(tài)弓Ｉ物篩選??Ｆｉｇ．?３－１?Ｔｈｅ?ＰＡＧＥ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｒｔｉｅｉｒ?ａｃｃｒｏｄｉｎｇ?ｓｉｎｇｌｅ?ｐｒｉｍｅｒ?ｓｅｔ?ＰＣＲ??

°Ｃ、５８．４１：、巧．２°Ｃ、：５９．７’Ｃ和６０°Ｃ。部分引物多態(tài)篩選和Ｈ重ＰＣ民結(jié)果如??下圖所示（圖３－１）。最終實驗結(jié)果確定組合Ａ的最佳退火溫度為５０’Ｃ、組合Ｂ??的最佳退火溫度為５ｒｃ、姐合Ｃ的最佳退火溫度為５ｒｃ。??．?ｌｒ：ｊ．?＂？一ｈｂｗ??１?２?．屬?....

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西南大學碩ｉｆｃ學位論文??Ｈａｐ＿＿ｌ、Ｈａｐ＿２位于圖中最基礎(chǔ)的位置，推測其可能為較原始的單倍型，其他單??倍型均由上述兩個單倍型經(jīng)一步或者多步突變而形成。??

圖３－１微衛(wèi)星多態(tài)弓Ｉ物篩選??Ｆｉｇ．?３－１?Ｔｈｅ?ＰＡＧＥ?ｒｅｓｕｌｔｓ?ｏｆ?ｒｔｉｅｉｒ?ａｃｃｒｏｄｉｎｇ?ｓｉｎｇｌｅ?ｐｒｉｍｅｒ?ｓｅｔ?ＰＣＲ??

°Ｃ、５８．４１：、巧．２°Ｃ、：５９．７’Ｃ和６０°Ｃ。部分引物多態(tài)篩選和Ｈ重ＰＣ民結(jié)果如??下圖所示（圖３－１）。最終實驗結(jié)果確定組合Ａ的最佳退火溫度為５０’Ｃ、組合Ｂ??的最佳退火溫度為５ｒｃ、姐合Ｃ的最佳退火溫度為５ｒｃ。??．?ｌｒ：ｊ．?＂？一ｈｂｗ??１?２?．屬?....

本文編號：3954233