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赤點石斑神經壞死病毒感染GF-1和SSN-1細胞的microRNA組與轉錄組研究

發(fā)布時間:2024-04-03 05:21
  魚類神經壞死病毒(Nervous necrosis virus,NNV)也稱為β野田病毒(betanodavirus),是野田病毒(Nodaviridae)家族的一員。NNV感染導致的疾病稱為病毒性神經壞死癥(viral nervous necrosis,VNN)或者病毒性腦病和視網膜病(viral encephalopathy and retinopathy,VER),最初分離自患病的海洋魚類,現(xiàn)在已在120多種不同的養(yǎng)殖和野生魚類中被報道,嚴重危害著水產養(yǎng)殖業(yè)。近年來,越來越多的證據(jù)表明NNV開始在淡水魚類中流行,感染實驗也表明很多淡水魚類容易受到NNV感染。雖然各國學者在NNV感染的預防和治療方面投入了大量的研究,但對NNV致病的分子機制還沒有完全闡明。通過研究赤點石斑神經壞死病毒(Red-spotted grouper nervous necrosis virus,RGNNV)感染敏感細胞系的microRNA(miRNA)表達譜和轉錄組測序,可以獲得大量RGNNV和宿主相互作用的信息,這些結果將有助于了解RGNNV的復制和致病機制,進而為VER的綜合防控提供新的策略。雖然目前已...

【文章頁數(shù)】:214 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-1魚類野田病毒結構示意圖(引自:ViralZone)

圖1-1魚類野田病毒結構示意圖(引自:ViralZone)

圖1-1魚類野田病毒結構示意圖(引自:ViralZone)Fig.1-1SchematicdiagramofthestructureofBetanodavirus毒切面示意圖;右圖為魚類野田病毒外殼示意圖:球形,無囊膜,T=3的二十面自:Viralzone....


圖1-2赤點石斑神經壞死病毒基因組結構示意圖

圖1-2赤點石斑神經壞死病毒基因組結構示意圖

赤點石斑神經壞死病毒感染GF-1和SSN-1細胞的microRNA組與轉錄組研究圖1-1魚類野田病毒結構示意圖(引自:ViralZone)Fig.1-1SchematicdiagramofthestructureofBetanodavirus是魚....


圖2-1小RNA文庫構建流程(引自Biomaker)

圖2-1小RNA文庫構建流程(引自Biomaker)

USA)進行文庫構建。由于SmallRNA的5'端有磷酸基團,3'端有羥基,利用NALigase1和T4RNALigase2(truncated)分別在smallRNA3'端和5'端連接上,反轉錄合成cDNA,PCR擴增,使用15%PAG....


圖2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)

圖2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)

圖2-2polyA加尾法qRT-PCR原理(引自GeneCopoeia)Fig.2-2SchematicofpolyAtaledqRT-PCR.10qRT-PCR驗證差異表達miRNA由于成熟的miRNA(maturemiRNA)長度僅為2....



本文編號:3946780

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