殺魚愛德華氏菌(Edwardsiella piscicida)是一種對水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)極大危害的致病菌,其致病過程是一系列致病基因時(shí)空順序表達(dá)的結(jié)果。Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS)和Ⅵ型分泌系統(tǒng)(T6SS)是目前已知的重要的毒力因子,而EsrA-EsrB雙組分系統(tǒng)對T3SS及T6SS表達(dá)有關(guān)鍵調(diào)控作用,但EsrB單獨(dú)在E.piscicida中對下游的調(diào)控還不明確。本文運(yùn)用RNA-seq技術(shù)對DMEM培養(yǎng)條件下的E.piscicida EIB202的轉(zhuǎn)錄譜進(jìn)行分析,篩選出618個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄水平在△esrB中下調(diào),而388個(gè)基因在其中上調(diào)。EsrB除了能上調(diào)T3SS和T6SS之外,還能上調(diào)鐵攝取相關(guān)基因,這說明鐵也參與了該病原菌毒力調(diào)控基因的表達(dá)。Fur蛋白為鐵攝取調(diào)節(jié)子。在轉(zhuǎn)錄水平上,fur在WT中的表達(dá)量比在AesrB中顯著上調(diào)4倍以上,表明EsrB對Fur具有上調(diào)作用。作為一種全局調(diào)控因子(global regulator),Fur嚴(yán)格抑制許多基因的表達(dá),保證鐵轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)受到鐵濃度的嚴(yán)格調(diào)控。本實(shí)驗(yàn)運(yùn)用ChIP-seq技術(shù),考察了E.piscicida EIB202中Fur在全基因組范圍內(nèi)的結(jié)合位...

【文章頁數(shù)】：72 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．４不同病原菌中Ｔ３ＳＳ基因簇對化圖ＩＫＩ??Ｆｉｇ．?１．４?Ｇｅｎｅｔｉｃ?ｏｒｇａｎｉｚａ?

主細(xì)胞的胞質(zhì)中行使其功能。作為病原菌中重要的分泌系統(tǒng)，Ｔ３ＳＳ的功能是將毒力蛋??白分泌至宿主中，從而擾亂宿主細(xì)胞的一系列生理生化功能。在許多常見的重要的病原??菌中都編碼有功能的Ｔ３ＳＳ，有些菌甚至含有幾套Ｔ３ＳＳ?（圖１．４）。Ｔａｎ等人的研究確定了??￡．知加Ｃ／沁ＰＰＤ１....

圖1.5T6SS結(jié)構(gòu)模型}67}

?內(nèi)徑為４?ｎｍ，能允許伸展?fàn)顟B(tài)下的分泌蛋白通過，而過于狹窄的ＶｇｒＧ的Ｈ能讓蛋白通過，因此可能在Ｈｅｐ管組裝的＂針頭＂刺穿宿主細(xì)胞膜＾心后解離，通過Ｈｅｐ通道進(jìn)入到宿主細(xì)胞中�；魜y弧菌的Ｔ化Ｓ的保守組分ＶＣＡ０１０９尾部基板的組分ｇｐ２５蛋白具有序列的相似性，因此可能具有溶菌酶....

圖３．１突變株文庫的構(gòu)建流程??Ｆｉｇ．?３．１?Ｗｏｒｋｆｌｏｗ?ｏｆ?ｍｕｌ；ａｎｔ?ｌｉｂｒａｒｙ?ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ．??

３．３．１轉(zhuǎn)座子插入突變株文庫的構(gòu)建??突變株的構(gòu)建采用接合方式，供體菌株為ＳＭ１０如ｚ＞：：ｐＭＫＧＲ，受體菌株為殺魚愛??德華氏菌拉Ｂ２０２ＡＰ?（圖３．：１）?口７］。??突＇楚株?巧陽?Ｕｍｕ?ＰＣＫ擴(kuò)増?測Ｉ書??〇－口－?－面一而??１??Ｇ制ｉ??□?Ｉ確巧位點(diǎn)的炎....

圖3.3Episeicida與V.alginoiyticus鐵載體合成轉(zhuǎn)運(yùn)基因簇的比對Fig.3.3AlignmentofsiderophorerelatedgeneclusterbetweenEpiscicidaandY.alginolyticus

表；３．３?￡■．／ｊ／ｓｒＺｃ／舶與Ｋ?每扣０／抑’ｃｗｓ鐵載體基因鎭蛋白的同源度??Ｔａｂｌｅ?３．３?Ｈｏｍｏｌｏｇｙ?ｏｆ?ｓｉｄｅｒｏｐｈｏｒｅ?ｐｒｏ化ｉｎｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?左．／７／ｓｃ／ｃ／抓?ａｎｄ?Ｋ?幻／各／ｎｏ／ｊ＾ｆ／ｃｗ??Ｐｒｏ?化?ｉｎ?Ｐｖｓ?....

本文編號：3942374