隨著全球觀賞魚(yú)貿(mào)易市場(chǎng)的蓬勃發(fā)展,捕撈力度和壓力的逐年增加以及生態(tài)環(huán)境棲息地的不斷惡化,亞馬遜河流域的盤麗魚(yú)屬魚(yú)類(Symphysodon)野生資源因此遭受到了比較嚴(yán)重的破壞。本文采用了分子生物學(xué)的手段首次對(duì)野生棕七彩神仙魚(yú)和野生綠七彩神仙魚(yú)的線粒體基因組全序列進(jìn)行了分析,旨在探討盤麗魚(yú)屬魚(yú)類之間的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化關(guān)系,為該屬魚(yú)類的遺傳進(jìn)化提供更多的參考理論依據(jù)。具體研究?jī)?nèi)容如下:1.野生棕七彩神仙魚(yú)和野生綠七彩神仙魚(yú)線粒體基因組全序列測(cè)定采用第二代測(cè)序的方法,獲得野生棕七彩神仙魚(yú)和野生綠七彩神仙魚(yú)的mtDNA全序列長(zhǎng)度分別為16543bp和16545bp,其線粒體結(jié)構(gòu)都包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、2個(gè)rRNA基因、22個(gè)tRNA基因和1個(gè)D-loop非編碼區(qū)。在堿基構(gòu)成上,H鏈編碼的12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因都表現(xiàn)出顯著的反G偏倚現(xiàn)象。通過(guò)與已知的該屬野生黑格爾七彩神仙魚(yú)的線粒體基因組序列進(jìn)行比對(duì)分析,3種野生種類的同源蛋白質(zhì)編碼基因起始密碼子均相同:CO1編碼蛋白基因以GTG為起始密碼子,而其余的12個(gè)編碼蛋白基因的起始密碼子都是標(biāo)準(zhǔn)的ATG起始密碼子;終止密碼子卻不盡相同,即完整的TAA和T...

【文章頁(yè)數(shù)】：51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1野生棕七彩神仙魚(yú)線粒體基因組結(jié)構(gòu)

11圖1-1野生棕七彩神仙魚(yú)線粒體基因組結(jié)構(gòu)Fig1-1.StructureofmitochondrialgenomeofSymphysodonharaldi1.2.2野生棕七彩神仙魚(yú)線粒體基因組的組成與結(jié)構(gòu)野生棕七彩神仙魚(yú)線粒體基因組的堿基組成中，運(yùn)用軟件進(jìn)....

圖.趁從鑲通，誣福

SeC（UCA）Ala（UGC）Asn（GUU）CysTyr（GUA）Ser（UGA）

圖1-2野生棕七彩神仙魚(yú)tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)圖

Glu（UUC）Thr（UGU）Pro（UGG）圖1-2野生棕七彩神仙魚(yú)tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)圖Fig1-2.PredictedsecondarystructuresofmitochondrialtRNAofSymphysodonharaldi1.2.....

圖2-1野生綠七彩神仙魚(yú)線粒體基因組結(jié)構(gòu)

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文野生黑格爾七彩神仙魚(yú)這3種魚(yú)的線粒體基因組全序列放在NCBI生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索后，發(fā)現(xiàn)在已知的序列中相似度最高的是中北美一種慈鯛魚(yú)-花身副麗魚(yú)（Parachromismanaquensis），其NCBI登錄號(hào)為KP728467，相似的程度都為88....

本文編號(hào)：3940304