隨著全球觀賞魚貿(mào)易市場的蓬勃發(fā)展,捕撈力度和壓力的逐年增加以及生態(tài)環(huán)境棲息地的不斷惡化,亞馬遜河流域的盤麗魚屬魚類(Symphysodon)野生資源因此遭受到了比較嚴重的破壞。本文采用了分子生物學(xué)的手段首次對野生棕七彩神仙魚和野生綠七彩神仙魚的線粒體基因組全序列進行了分析,旨在探討盤麗魚屬魚類之間的系統(tǒng)發(fā)育進化關(guān)系,為該屬魚類的遺傳進化提供更多的參考理論依據(jù)。具體研究內(nèi)容如下:1.野生棕七彩神仙魚和野生綠七彩神仙魚線粒體基因組全序列測定采用第二代測序的方法,獲得野生棕七彩神仙魚和野生綠七彩神仙魚的mtDNA全序列長度分別為16543bp和16545bp,其線粒體結(jié)構(gòu)都包括13個蛋白質(zhì)編碼基因、2個rRNA基因、22個tRNA基因和1個D-loop非編碼區(qū)。在堿基構(gòu)成上,H鏈編碼的12個蛋白質(zhì)編碼基因都表現(xiàn)出顯著的反G偏倚現(xiàn)象。通過與已知的該屬野生黑格爾七彩神仙魚的線粒體基因組序列進行比對分析,3種野生種類的同源蛋白質(zhì)編碼基因起始密碼子均相同:CO1編碼蛋白基因以GTG為起始密碼子,而其余的12個編碼蛋白基因的起始密碼子都是標(biāo)準的ATG起始密碼子;終止密碼子卻不盡相同,即完整的TAA和T...

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1野生棕七彩神仙魚線粒體基因組結(jié)構(gòu)

11圖1-1野生棕七彩神仙魚線粒體基因組結(jié)構(gòu)Fig1-1.StructureofmitochondrialgenomeofSymphysodonharaldi1.2.2野生棕七彩神仙魚線粒體基因組的組成與結(jié)構(gòu)野生棕七彩神仙魚線粒體基因組的堿基組成中，運用軟件進....

圖.趁從鑲通，誣福

SeC（UCA）Ala（UGC）Asn（GUU）CysTyr（GUA）Ser（UGA）

圖1-2野生棕七彩神仙魚tRNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測圖

Glu（UUC）Thr（UGU）Pro（UGG）圖1-2野生棕七彩神仙魚tRNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測圖Fig1-2.PredictedsecondarystructuresofmitochondrialtRNAofSymphysodonharaldi1.2.....

圖2-1野生綠七彩神仙魚線粒體基因組結(jié)構(gòu)

上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文野生黑格爾七彩神仙魚這3種魚的線粒體基因組全序列放在NCBI生物信息數(shù)據(jù)庫中搜索后，發(fā)現(xiàn)在已知的序列中相似度最高的是中北美一種慈鯛魚-花身副麗魚（Parachromismanaquensis），其NCBI登錄號為KP728467，相似的程度都為88....

本文編號：3940304