四種殼色馬氏珠母貝群體遺傳多樣性分析和分子標(biāo)記研究
發(fā)布時(shí)間:2024-03-23 21:53
馬氏珠母貝(Pinctada martensii Dunker)又稱合浦珠母貝,是我國(guó)生產(chǎn)海水珍珠的重要經(jīng)濟(jì)貝類(lèi)之一,既可作肉貝又可用于生產(chǎn)海水珍珠,生產(chǎn)的南海珍珠享譽(yù)世界。而近年來(lái),由于環(huán)境條件惡化及不科學(xué)的養(yǎng)殖繁育方式等導(dǎo)致種質(zhì)資源嚴(yán)重退化,珍珠產(chǎn)量及質(zhì)量下降,企業(yè)經(jīng)濟(jì)受損嚴(yán)重,因此迫切需要對(duì)馬氏珠母貝進(jìn)行遺傳多樣性分析,優(yōu)化選育、遺傳改良、分子標(biāo)記選育及保護(hù)其種質(zhì)資源等方面的研究。本研究采用EST-SSR微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)、相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性標(biāo)記技術(shù)(SRAP-c DNA)、單核苷酸多態(tài)性標(biāo)記(SNP)技術(shù)等分析了四種殼色馬氏珠母貝群體的遺傳多樣性、篩選出殼色相關(guān)分子標(biāo)記和殼色相關(guān)基因酪氨酸酶基因的SNP位點(diǎn)及在四種殼色群體中的表達(dá)量差異。旨在為經(jīng)過(guò)8代的群體繼代選育獲得的四種殼色馬氏珠母貝群體的種質(zhì)鑒定和殼色選育提供分子理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1、本研究采用10對(duì)微衛(wèi)星引物,對(duì)四種殼色馬氏珠母貝群體的遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示:(1)10個(gè)位點(diǎn)共檢測(cè)到45個(gè)等位基因,各位點(diǎn)平均等位基因數(shù)4.5個(gè),四種殼色馬氏珠母貝群體的平均等位基因(Na)為3.54
【文章頁(yè)數(shù)】:97 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 馬氏珠母貝的研究進(jìn)展
1.1.1 馬氏珠母貝簡(jiǎn)介
1.1.2 馬氏珠母貝的遺傳育種
1.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.2.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記發(fā)展歷程
1.2.2 微衛(wèi)星在遺傳育種領(lǐng)域的應(yīng)用
1.3 SRAP分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.3.1 SRAP分子標(biāo)記的概念及原理
1.3.2 SRAP分子標(biāo)記的應(yīng)用
1.4 SNP分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.4.1 SNP分子標(biāo)記及特點(diǎn)
1.4.2 SNP篩選檢測(cè)方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶簡(jiǎn)介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能與活性中心結(jié)構(gòu)
1.5.3 酪氨酸酶的應(yīng)用及研究進(jìn)展
1.6 研究?jī)?nèi)容及意義
2 四種殼色馬氏珠母貝EST-SSR遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.2.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.2 數(shù)據(jù)結(jié)果分析
2.3 討論
2.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體內(nèi)遺傳多樣性分析
2.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體哈迪溫伯格平衡
2.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體間的遺傳分化
3 四種殼色馬氏珠母貝外套膜基因的SRAP-cDNA差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料來(lái)源
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.2.1 外套膜組織RNA檢測(cè)結(jié)果
3.2.2 以cDNA的為模板SRAP-cDNA引物PCR擴(kuò)增檢測(cè)結(jié)果
3.2.3 SRAP-cDNA引物篩選
3.2.4 SRAP-cDNA引物驗(yàn)證
3.2.5 瓊脂糖膠回收
3.2.6 克隆測(cè)序結(jié)果
3.3 討論
3.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體的SRAP-cDNA表達(dá)差異
3.3.2 差異條帶的同源性序列
3.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體的鑒定標(biāo)記
4 馬氏珠母貝酪氨酸酶基因SNP位點(diǎn)篩選和表達(dá)量分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖檢測(cè)
4.2.2 熒光定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物
4.2.3 酪氨酸酶基因擴(kuò)增序列和峰值圖
4.2.4 測(cè)序分析
4.2.5 SNP位點(diǎn)基因型分析
4.2.6 SNP位點(diǎn)等位基因頻率分析
4.2.7 多重比較及關(guān)聯(lián)性分析
4.2.8 SNP位點(diǎn)多態(tài)性分析
4.2.9 四種殼色馬氏珠母貝群體酪氨酸酶基因相對(duì)表達(dá)量
4.3 討論
4.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體總體的SNP位點(diǎn)差異分析
4.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體間的SNP位點(diǎn)差異分析
4.3.3 不同殼色馬氏珠母貝群體總體SNP位點(diǎn)基因型分布規(guī)律討論
4.3.4 SNP位點(diǎn)多態(tài)性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表達(dá)量分析
5 結(jié)論
論文的創(chuàng)新點(diǎn)
有待解決的問(wèn)題
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3936518
【文章頁(yè)數(shù)】:97 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 馬氏珠母貝的研究進(jìn)展
1.1.1 馬氏珠母貝簡(jiǎn)介
1.1.2 馬氏珠母貝的遺傳育種
1.2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.2.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記發(fā)展歷程
1.2.2 微衛(wèi)星在遺傳育種領(lǐng)域的應(yīng)用
1.3 SRAP分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.3.1 SRAP分子標(biāo)記的概念及原理
1.3.2 SRAP分子標(biāo)記的應(yīng)用
1.4 SNP分子標(biāo)記的功能特征和應(yīng)用
1.4.1 SNP分子標(biāo)記及特點(diǎn)
1.4.2 SNP篩選檢測(cè)方法
1.5 酪氨酸酶基因
1.5.1 酪氨酸酶簡(jiǎn)介
1.5.2 酪氨酸酶生理功能與活性中心結(jié)構(gòu)
1.5.3 酪氨酸酶的應(yīng)用及研究進(jìn)展
1.6 研究?jī)?nèi)容及意義
2 四種殼色馬氏珠母貝EST-SSR遺傳多樣性分析
2.1 材料與方法
2.1.1 材料
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.1.4 數(shù)據(jù)處理與分析
2.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
2.2.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.2.2 數(shù)據(jù)結(jié)果分析
2.3 討論
2.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體內(nèi)遺傳多樣性分析
2.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體哈迪溫伯格平衡
2.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體間的遺傳分化
3 四種殼色馬氏珠母貝外套膜基因的SRAP-cDNA差異分析
3.1 材料與方法
3.1.1 材料來(lái)源
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.2.1 外套膜組織RNA檢測(cè)結(jié)果
3.2.2 以cDNA的為模板SRAP-cDNA引物PCR擴(kuò)增檢測(cè)結(jié)果
3.2.3 SRAP-cDNA引物篩選
3.2.4 SRAP-cDNA引物驗(yàn)證
3.2.5 瓊脂糖膠回收
3.2.6 克隆測(cè)序結(jié)果
3.3 討論
3.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體的SRAP-cDNA表達(dá)差異
3.3.2 差異條帶的同源性序列
3.3.3 四種殼色馬氏珠母貝群體的鑒定標(biāo)記
4 馬氏珠母貝酪氨酸酶基因SNP位點(diǎn)篩選和表達(dá)量分析
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
4.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4 數(shù)據(jù)處理
4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.2.1 酪氨酸酶基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖檢測(cè)
4.2.2 熒光定量PCR擴(kuò)增產(chǎn)物
4.2.3 酪氨酸酶基因擴(kuò)增序列和峰值圖
4.2.4 測(cè)序分析
4.2.5 SNP位點(diǎn)基因型分析
4.2.6 SNP位點(diǎn)等位基因頻率分析
4.2.7 多重比較及關(guān)聯(lián)性分析
4.2.8 SNP位點(diǎn)多態(tài)性分析
4.2.9 四種殼色馬氏珠母貝群體酪氨酸酶基因相對(duì)表達(dá)量
4.3 討論
4.3.1 四種殼色馬氏珠母貝群體總體的SNP位點(diǎn)差異分析
4.3.2 四種殼色馬氏珠母貝群體間的SNP位點(diǎn)差異分析
4.3.3 不同殼色馬氏珠母貝群體總體SNP位點(diǎn)基因型分布規(guī)律討論
4.3.4 SNP位點(diǎn)多態(tài)性分析
4.3.5 酪氨酸酶基因表達(dá)量分析
5 結(jié)論
論文的創(chuàng)新點(diǎn)
有待解決的問(wèn)題
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3936518
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