采用高通量轉(zhuǎn)錄組測序和實(shí)時定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)技術(shù),在分子水平揭示養(yǎng)殖密度對斑節(jié)對蝦肌肉品質(zhì)形成的影響機(jī)制。選取養(yǎng)殖密度100尾/m²、300尾/m²的斑節(jié)對蝦為實(shí)驗(yàn)材料,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序和qRT-PCR驗(yàn)證。結(jié)果表明:所有樣本Q20和Q30的最小值均大于90%,測序數(shù)據(jù)均滿足生物信息學(xué)分析的要求;不同密度養(yǎng)殖條件下,斑節(jié)對蝦的差異表達(dá)基因?yàn)?78個;將差異基因序列與7個數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,得到不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦中與肌肉品質(zhì)相關(guān)的差異基因分布在膠原蛋白代謝、蛋白水解、蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞蛋白代謝、細(xì)胞骨架組織、肌肉連接及葡萄糖代謝途徑;qRT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致。

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

圖1不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦間基因差異表達(dá)分析火山圖

以不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦中基因Reads數(shù)之比為差異倍數(shù)，繪制火山圖，可以直觀顯示Pval和log2（差異倍數(shù)）之間的關(guān)系，縱坐標(biāo)為差異顯著性，-lg(Pval）越大，差異越顯著；P<0.05和|log2（差異倍數(shù)）|>1即為差異表達(dá)的基因。由圖1可知，不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦有7....

圖2不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦肌肉中與代謝途徑相關(guān)的差異基因

2.4不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦肌肉中與品質(zhì)相關(guān)的差異基因不同密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦的差異基因涉及蛋白質(zhì)代謝、肌肉發(fā)育和生長、碳水化合物代謝途徑。由圖2可知，100尾/m2和300尾/m2密度養(yǎng)殖的斑節(jié)對蝦肌肉中存在4個與膠原蛋白相關(guān)的差異基因，包括2個上調(diào)基因和2個下調(diào)基因。與蛋白水....

本文編號：3933256