基于微衛(wèi)星標(biāo)記的青蝦親子鑒定技術(shù)建立及生長相關(guān)位點(diǎn)的篩選
發(fā)布時間:2024-03-20 20:01
青蝦,學(xué)名日本沼蝦(Macrobrachium nipponense),俗稱河蝦,是我國重要淡水養(yǎng)殖品種之一。由于青蝦等甲殼類動物在生長發(fā)育過程中會經(jīng)歷多次蛻殼,常用的體外標(biāo)記會隨著蛻殼而丟失,同時由于青蝦個體小而且離水極易死亡,體內(nèi)標(biāo)記也難以使用,個體標(biāo)記和識別是青蝦選育面臨的主要困難之一。使用DNA分子標(biāo)記進(jìn)行親緣關(guān)系分析可以克服蛻殼的制約,對青蝦的損傷也很小,因此建立一種基于DNA分子標(biāo)記的青蝦親子鑒定技術(shù)具有重要意義。微衛(wèi)星具有多態(tài)性高、共顯性遺傳等優(yōu)點(diǎn),目前在水產(chǎn)動物親子鑒定和數(shù)量性狀相關(guān)基因研究中得到廣泛應(yīng)用,但迄今未見微衛(wèi)星應(yīng)用于青蝦親子鑒定的報道。本文從本實(shí)驗(yàn)室已開發(fā)的微衛(wèi)星中篩選得到適用于親子鑒定的微衛(wèi)星組合,對3個全同胞家系進(jìn)行親子鑒定分析,并評估微衛(wèi)星標(biāo)記的鑒別能力,建立青蝦親子鑒定技術(shù),同時為給青蝦的性狀相關(guān)分子標(biāo)記的篩選提供一定參考數(shù)據(jù),本文通過對微衛(wèi)星位點(diǎn)與青蝦體長、體重的相關(guān)性進(jìn)行分析,初步篩選與生長性狀相關(guān)的微衛(wèi)星位點(diǎn)。從本實(shí)驗(yàn)室已開發(fā)的微衛(wèi)星位點(diǎn)中,選擇30對多態(tài)性較高的微衛(wèi)星引物進(jìn)行進(jìn)一步篩選,通過對太湖野生群體16個隨機(jī)個體的DNA檢測,挑選條帶清...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 分子標(biāo)記概述及其在甲殼動物中的應(yīng)用
1 分子標(biāo)記概述
1.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
1.2 擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)
1.3 微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記(SSR)
1.4 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
1.5 其他分子標(biāo)記
2 分子標(biāo)記在甲殼類動物遺傳育種中的應(yīng)用
2.1 遺傳多樣性分析
2.2 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
2.3 經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記篩選
2.4 親緣關(guān)系鑒定
2.4.1 親緣關(guān)系鑒定的原理
2.4.2 可用于親緣關(guān)系鑒定的標(biāo)記
2.4.3 親緣關(guān)系鑒定概率
第二節(jié) 本研究的目的意義
第二章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的青蝦親子鑒定技術(shù)建立
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用青蝦
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
1.3 主要試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法及操作
2.1 青蝦基因組DNA提取
2.2 基因組DNA電泳檢測
2.3 微衛(wèi)星引物合成
2.4 PCR引物的擴(kuò)增反應(yīng)及電泳檢測
2.5 聚丙烯酰胺凝膠的制備及電泳
2.6 聚內(nèi)烯酰胺凝膠的染色
2.7 微衛(wèi)星引物篩選
2.8 親子鑒定分析
3 結(jié)果與分析
3.1 微衛(wèi)星分型
3.2 家系遺傳多樣性分析
3.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)排除率及模擬鑒定率分析
3.4 家系鑒定率
4 討論
4.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)的選擇
4.2 模擬分析與家系鑒定
4.3 建立青蝦親子鑒定技術(shù)的意義
第三章 青蝦生長性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的初步篩選
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用青蝦
1.2 主要儀器與試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法及操作
2.1 青蝦DNA的提取
2.2 微衛(wèi)星引物的合成
2.3 PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物檢測
2.4 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果
3.1 性狀的表型值分布
3.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性
3.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)與體長、體重的相關(guān)分析
4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
碩士期間發(fā)表的文章或?qū)@?br>
本文編號:3933227
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ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 分子標(biāo)記概述及其在甲殼動物中的應(yīng)用
1 分子標(biāo)記概述
1.1 限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)
1.2 擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(AFLP)
1.3 微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記(SSR)
1.4 單核苷酸多態(tài)性(SNP)
1.5 其他分子標(biāo)記
2 分子標(biāo)記在甲殼類動物遺傳育種中的應(yīng)用
2.1 遺傳多樣性分析
2.2 遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
2.3 經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記篩選
2.4 親緣關(guān)系鑒定
2.4.1 親緣關(guān)系鑒定的原理
2.4.2 可用于親緣關(guān)系鑒定的標(biāo)記
2.4.3 親緣關(guān)系鑒定概率
第二節(jié) 本研究的目的意義
第二章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記的青蝦親子鑒定技術(shù)建立
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用青蝦
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器設(shè)備
1.3 主要試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法及操作
2.1 青蝦基因組DNA提取
2.2 基因組DNA電泳檢測
2.3 微衛(wèi)星引物合成
2.4 PCR引物的擴(kuò)增反應(yīng)及電泳檢測
2.5 聚丙烯酰胺凝膠的制備及電泳
2.6 聚內(nèi)烯酰胺凝膠的染色
2.7 微衛(wèi)星引物篩選
2.8 親子鑒定分析
3 結(jié)果與分析
3.1 微衛(wèi)星分型
3.2 家系遺傳多樣性分析
3.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)排除率及模擬鑒定率分析
3.4 家系鑒定率
4 討論
4.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)的選擇
4.2 模擬分析與家系鑒定
4.3 建立青蝦親子鑒定技術(shù)的意義
第三章 青蝦生長性狀相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記的初步篩選
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用青蝦
1.2 主要儀器與試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法及操作
2.1 青蝦DNA的提取
2.2 微衛(wèi)星引物的合成
2.3 PCR擴(kuò)增和產(chǎn)物檢測
2.4 統(tǒng)計分析
3 結(jié)果
3.1 性狀的表型值分布
3.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性
3.3 微衛(wèi)星位點(diǎn)與體長、體重的相關(guān)分析
4 討論
全文結(jié)論
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附錄
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本文編號:3933227
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