蝦虎魚亞目(Gobioidei)隸屬于脊索動(dòng)物門(Chordata)、輻鰭魚綱(Actinopterygii)、鱸形目(Perciformes),是鱸形目中最大的一個(gè)類群,包括270多個(gè)屬,2000多種,占鱸形目的23%。蝦虎魚類廣泛分布于熱帶、亞熱帶和溫帶地區(qū)的淡水或近岸海水中,多底棲生,好穴居。由于蝦虎魚類在極短的時(shí)間內(nèi)快速分化為多個(gè)物種,所以準(zhǔn)確地重建它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系很困難,而這一現(xiàn)象在其他物種的系統(tǒng)演化研究上也很常見。目前對(duì)于蝦虎魚亞目的系統(tǒng)發(fā)育的研究主要基于形態(tài)學(xué)特征或少數(shù)幾個(gè)線粒體或核基因標(biāo)記,所得到的結(jié)論相互不一致。隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,當(dāng)前的系統(tǒng)發(fā)育研究已不再囿于有限的分子標(biāo)記,以逐步進(jìn)入到基于基因組規(guī)模進(jìn)行分析的階段�；蚪M數(shù)據(jù)容易獲取,但讀長短、片段多,數(shù)據(jù)處理和分析難度大。對(duì)于大量的核基因標(biāo)記,如何從中篩選出系統(tǒng)發(fā)育信號(hào)強(qiáng)、適用于不同系統(tǒng)發(fā)育問題研究的分子標(biāo)記尤為重要。分子標(biāo)記篩選標(biāo)準(zhǔn)一直是研究的熱點(diǎn),然而現(xiàn)有的研究主要是根據(jù)模擬數(shù)據(jù)或者少數(shù)幾個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行的,很少在大規(guī)模的實(shí)際數(shù)據(jù)中進(jìn)行過驗(yàn)證。因此,對(duì)多位點(diǎn)分子標(biāo)記篩選策略亟待作一個(gè)全面而深入的研究。針對(duì)以上...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1基于最大似然法1000個(gè)重復(fù)抽樣所建的蝦虎魚亞目及其外群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

圖1-1基于最大似然法1000個(gè)重復(fù)抽樣所建的蝦虎魚亞目及其外群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。除了圓點(diǎn)所在的節(jié)點(diǎn)自舉支持值為70外，其余所有節(jié)點(diǎn)的支持值均為100。Fig.1-1ThephylogenyofGobioideianditsoutgroupsbasedo....

圖1-2基于694個(gè)基因樹所重建的蝦虎魚及其外群的系統(tǒng)發(fā)育物種樹

35圖1-2基于694個(gè)基因樹所重建的蝦虎魚及其外群的系統(tǒng)發(fā)育物種樹。其中a，b分別是根據(jù)MP-EST和STAR所重建的物種樹

圖2-2根據(jù)5種指標(biāo)篩選出的基因所重建的一致樹

圖2-2根據(jù)5種指標(biāo)篩選出的基因所重建的一致樹。(a，b)分別表示配對(duì)距離值最小和最大的100個(gè)基因序列所推斷的一致樹；(c，d)分別表示相對(duì)組成變異性值最小和最大的100個(gè)基因序列所推斷的一致樹；(e，f)分別表示stemminess值最小和最大的....

圖2-3分子鐘與基因長度的關(guān)系

圖2-3分子鐘與基因長度的關(guān)系。Fig.2-3Relationshipbetweenmolecularclock-likenessandsequencelength.

本文編號(hào)：3926793