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大菱鲆生長(zhǎng)性狀相關(guān)SNP位點(diǎn)的篩選鑒定及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-08 21:49
  大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)是原產(chǎn)于歐洲沿海的一種名貴的比目魚。自我國1992年從英國引進(jìn)以來,因其生長(zhǎng)速度快、肉質(zhì)鮮美、易馴化以及抗逆性強(qiáng)等特點(diǎn),迅速成為北方海水養(yǎng)殖的主要經(jīng)濟(jì)魚類。然而,近幾年,隨著工廠化養(yǎng)殖水平的不斷提高,大菱鲆養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)出現(xiàn)一些問題。由于大菱鲆育種工作主要依賴國外引進(jìn)親本,親本資源有限,加上累代養(yǎng)殖以及近親交配,使得大菱鲆種質(zhì)資源退化嚴(yán)重,嚴(yán)重制約了大菱鲆養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。因此對(duì)大菱鲆進(jìn)行遺傳改良,選育具有優(yōu)良生長(zhǎng)性狀的大菱鲆新品種是發(fā)展大菱鲆養(yǎng)殖業(yè)的當(dāng)務(wù)之急。隨著生物技術(shù)的不斷創(chuàng)新與進(jìn)步,分子標(biāo)記技術(shù)被運(yùn)用到育種工作中來,利用傳統(tǒng)育種加上分子標(biāo)記輔助育種的模式已經(jīng)成為魚類育種的有效手段。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是微衛(wèi)星標(biāo)記之后的第三代的分子標(biāo)記技術(shù)。SNP標(biāo)記在基因組中密度高,遺傳穩(wěn)定性好并且易于自動(dòng)化分析,因此被廣泛地應(yīng)用于動(dòng)植物的遺傳育種中。本研究以實(shí)驗(yàn)室前期利用數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)定位作圖篩選獲得的100個(gè)與大菱鲆生長(zhǎng)性狀相關(guān)的候選單核苷酸多態(tài)(SNP)位點(diǎn)為基礎(chǔ)...

【文章頁數(shù)】:73 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)圖

圖2-1基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)圖

3.1基因組DNA質(zhì)量及濃度檢測(cè)提取的大菱鲆鰭條組織的基因組DNA用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),部分樣品的電泳檢測(cè)結(jié)果見圖2-1。圖中可見基因組DNA條帶明亮且無明顯的拖帶現(xiàn)象,完整性較好,符合SNP位點(diǎn)分型的條件。利用超微量紫外光分光光度計(jì)檢測(cè)樣品DNA的濃度和....


圖2-2SNP位點(diǎn)變異類型統(tǒng)計(jì)圖

圖2-2SNP位點(diǎn)變異類型統(tǒng)計(jì)圖

圖2-2SNP位點(diǎn)變異類型統(tǒng)計(jì)圖Figure2-2DistributionofSNPvariationsSNP位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)分析大菱鲆四個(gè)家系生長(zhǎng)性狀(體重和體長(zhǎng))數(shù)據(jù)見表2-2。利用一般線性模型LM)對(duì)SNP位點(diǎn)的基因型和生長(zhǎng)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果見....


圖4-1大菱鲆各組織總RNA電泳圖

圖4-1大菱鲆各組織總RNA電泳圖

圖4-1大菱鲆各組織總RNA電泳圖Figure4-1ElectrophorctogramoftotalRNAoftissueinturbot3.2大菱鲆NOTCH1基因cDNA片段克隆取大菱鲆心臟組織的RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以此為模板,....


圖4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比對(duì)結(jié)果

圖4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比對(duì)結(jié)果

39圖4-2大菱鲆NOTCH1基因序列比對(duì)結(jié)果Figure4-2SequencealignmentresultsofNOTCH1geneinturbot表4-3大菱鲆NOTCH1基因序列在NCBI數(shù)據(jù)庫同源比對(duì)結(jié)果Table4-3Homo....



本文編號(hào):3922433

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