軍曹魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及基于基因組信息的微衛(wèi)星標記初篩
發(fā)布時間:2024-02-15 15:04
軍曹魚(Rachycentron canadum),隸屬于鱸形目(Perciformes)、海鱺科(Rachycentridae),是一種暖水性遠洋洄游魚類,因其肉質細嫩、味道鮮美、生長速度快等特性,已成為我國南方重要的海水養(yǎng)殖對象,F(xiàn)有軍曹魚的分子標記數(shù)目有限,國內對其養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性研究也相對較少。為了進一步做好軍曹魚的選育工作,本研究對北海(BH)、陵水(LS)、硇洲(NZ)、徐聞(XW)和三亞(SY)的5個軍曹魚養(yǎng)殖群體,共174個軍曹魚個體進行遺傳多樣性分析,并基于新近完成的軍曹魚全基因組測序結果,開展軍曹魚微衛(wèi)星序列搜索和篩選等工作。主要結果如下:1、12個微衛(wèi)星標記在5個軍曹魚養(yǎng)殖群體中共檢測到129個等位基因;各軍曹魚養(yǎng)殖群體的平均等位基因數(shù)為3.833~6.750,平均有效等位基因數(shù)為2.284~3.645,平均觀測雜合度與平均期望雜合度分別是0.481~0.635和0.533~0.681,平均多態(tài)信息含量為0.463~0.630;哈迪-溫伯格檢測顯示,各軍曹魚養(yǎng)殖群體在多個微衛(wèi)星位點上均顯著偏離平衡(P<0.05);軍曹魚養(yǎng)殖群體間的遺傳分化指數(shù)(F
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3899946
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圖1-1軍曹魚采樣點衛(wèi)星地圖
廣東海洋大學碩士學位論文7圖1-1軍曹魚采樣點衛(wèi)星地圖Figure1-1SatellitemapofsamplingpointofCobia
圖2-1基于Nei’s遺傳距離構建的5個軍曹魚群體的UPGMA系統(tǒng)進化樹
軍曹魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及基于基因組信息的微衛(wèi)星標記初篩16表2-55個軍曹魚養(yǎng)殖群體的AMOVA分析Table2-5AMOVAanalysisinthefiveculturedpopulationofcobia變異來源Sourceofvariation自由度d.f.平方和Sum....
圖3-14個軍曹魚群體的UPGMA系統(tǒng)進化樹
廣東海洋大學碩士學位論文23表3-4軍曹魚養(yǎng)殖群體的AMOVA分析Table3-4AnalysisofAMOVAinfourculturedpopulation變異來源Sourceofvariation自由度d.f.平方和Sumofsquares方差組分Variancecompo....
圖4-1基于軍曹魚養(yǎng)殖群體間的遺傳距離構建的NJ進化樹
軍曹魚養(yǎng)殖群體遺傳多樣性及基于基因組信息的微衛(wèi)星標記初篩28圖4-1基于軍曹魚養(yǎng)殖群體間的遺傳距離構建的NJ進化樹Figure4-1Theneighborjoiningphylogenetictreebasedongeneticdistances4.4討論和小結通過對BH、LS、....
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