中華絨螯蟹育種群體遺傳特征分析及性早熟相關(guān)SNP標(biāo)記篩選
發(fā)布時(shí)間:2023-08-29 22:55
中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)俗稱(chēng)河蟹,主要分布于中國(guó)長(zhǎng)江、遼河、甌江等水域,但群體自然分布以長(zhǎng)江流域?yàn)橹。多年?lái),由于各水系中華絨螯蟹無(wú)序引種和培育苗種的盲目放流,加上人工養(yǎng)殖群體向自然水體的逃逸,打破了各水系中華絨螯蟹的天然分布格局,各水系群體間的基因交流非常頻繁,由此產(chǎn)生了中華絨螯蟹的種質(zhì)混雜問(wèn)題。因此,進(jìn)行長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育已成當(dāng)務(wù)之急。本研究采用微衛(wèi)星技術(shù)分析了選育過(guò)程中所構(gòu)建的3個(gè)育種基礎(chǔ)群體的遺傳特征,以期為后期深入開(kāi)展長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育積累有益資料。近年來(lái),在各地的養(yǎng)殖過(guò)程中普遍發(fā)生一齡蟹的性早熟現(xiàn)象。性早熟直接導(dǎo)致河蟹生長(zhǎng)緩慢甚至停滯,個(gè)體小,死亡率高,嚴(yán)重制約了河蟹養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,給生產(chǎn)帶來(lái)了巨大損失。本研究在假設(shè)蛻皮抑制激素基因(MIH基因)變異與中華絨螯蟹性早熟之間存在相關(guān)性的基礎(chǔ)上,嘗試鑒定MIH基因調(diào)控區(qū)和編碼區(qū)的SNPs位點(diǎn),然后對(duì)鑒定出的所有SNPs位點(diǎn)在性早熟蟹和正?坌分羞M(jìn)行基因分型,并對(duì)兩個(gè)群體中差異顯著的SNPs位點(diǎn)與中華絨螯蟹性早熟的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了分析。 為進(jìn)行長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育,本研究利用1...
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜及性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
1.1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜
1.2 中華絨螯蟹性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
1.2.1 外在因素
1.2.1.1 溫度
1.2.1.2 鹽度
1.2.1.3 光照
1.2.1.4 營(yíng)養(yǎng)
1.2.1.5 放養(yǎng)密度
1.2.2 內(nèi)在因素
1.2.2.1 種質(zhì)和性別
1.2.2.2 神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)
1.2.2.3 類(lèi)固醇激素
1.2.2.4 肝胰腺
2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
2.1 DNA分子標(biāo)記技術(shù)簡(jiǎn)介
2.2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
2.2.1 水產(chǎn)動(dòng)物遺傳多樣性分析
2.2.2 水產(chǎn)動(dòng)物種質(zhì)鑒定
2.2.3 水產(chǎn)動(dòng)物親緣關(guān)系研究
2.2.4 水產(chǎn)動(dòng)物親子鑒定
2.2.5 水產(chǎn)動(dòng)物遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
2.2.6 水產(chǎn)動(dòng)物QTL定位
2.2.7 水產(chǎn)動(dòng)物分子標(biāo)記輔助育種
2.3 展望
3 研究設(shè)想
第二章 中華絨螯蟹3個(gè)育種基礎(chǔ)群體遺傳特征的微衛(wèi)星分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
1.1.1 材料獲取
1.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 微衛(wèi)星引物
1.3 方法
1.3.1 DNA模板制備
1.3.2 基因組DNA的檢測(cè)及濃度測(cè)定
1.3.3 PCR擴(kuò)增與SSR引物篩選
1.3.4 PCR產(chǎn)物的檢測(cè)
1.3.4.1 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.3.4.2 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)
1.3.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 各基因位點(diǎn)的遺傳多態(tài)
2.2 Hardy-Weinberg平衡
2.3 3個(gè)群體間的遺傳分化
3 討論
3.1 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體的遺傳多樣性
3.2 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體雜合子缺失現(xiàn)象的原因分析
3.3 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體的遺傳結(jié)構(gòu)
第三章 中華絨螯蟹MIH基因變異及其與性早熟的關(guān)聯(lián)性分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 SNPs篩選
1.3 MIH基因分型
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 調(diào)控區(qū)結(jié)果
2.1.1 鑒定的SNPs
2.1.2 SNPs位點(diǎn)在性早熟及正常河蟹群體中的分布
2.1.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
2.2 編碼區(qū)結(jié)果
2.2.1 鑒定的SNPs
2.2.2 SNPs位點(diǎn)在性早熟及正常河蟹群體中的分布
2.2.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
本文編號(hào):3844448
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜及性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
1.1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜
1.2 中華絨螯蟹性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
1.2.1 外在因素
1.2.1.1 溫度
1.2.1.2 鹽度
1.2.1.3 光照
1.2.1.4 營(yíng)養(yǎng)
1.2.1.5 放養(yǎng)密度
1.2.2 內(nèi)在因素
1.2.2.1 種質(zhì)和性別
1.2.2.2 神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)
1.2.2.3 類(lèi)固醇激素
1.2.2.4 肝胰腺
2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
2.1 DNA分子標(biāo)記技術(shù)簡(jiǎn)介
2.2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
2.2.1 水產(chǎn)動(dòng)物遺傳多樣性分析
2.2.2 水產(chǎn)動(dòng)物種質(zhì)鑒定
2.2.3 水產(chǎn)動(dòng)物親緣關(guān)系研究
2.2.4 水產(chǎn)動(dòng)物親子鑒定
2.2.5 水產(chǎn)動(dòng)物遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
2.2.6 水產(chǎn)動(dòng)物QTL定位
2.2.7 水產(chǎn)動(dòng)物分子標(biāo)記輔助育種
2.3 展望
3 研究設(shè)想
第二章 中華絨螯蟹3個(gè)育種基礎(chǔ)群體遺傳特征的微衛(wèi)星分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料與儀器
1.1.1 材料獲取
1.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.2 微衛(wèi)星引物
1.3 方法
1.3.1 DNA模板制備
1.3.2 基因組DNA的檢測(cè)及濃度測(cè)定
1.3.3 PCR擴(kuò)增與SSR引物篩選
1.3.4 PCR產(chǎn)物的檢測(cè)
1.3.4.1 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)
1.3.4.2 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)
1.3.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
2 結(jié)果與分析
2.1 各基因位點(diǎn)的遺傳多態(tài)
2.2 Hardy-Weinberg平衡
2.3 3個(gè)群體間的遺傳分化
3 討論
3.1 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體的遺傳多樣性
3.2 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體雜合子缺失現(xiàn)象的原因分析
3.3 3個(gè)育種基礎(chǔ)群體的遺傳結(jié)構(gòu)
第三章 中華絨螯蟹MIH基因變異及其與性早熟的關(guān)聯(lián)性分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 SNPs篩選
1.3 MIH基因分型
1.4 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 調(diào)控區(qū)結(jié)果
2.1.1 鑒定的SNPs
2.1.2 SNPs位點(diǎn)在性早熟及正常河蟹群體中的分布
2.1.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
2.2 編碼區(qū)結(jié)果
2.2.1 鑒定的SNPs
2.2.2 SNPs位點(diǎn)在性早熟及正常河蟹群體中的分布
2.2.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝
本文編號(hào):3844448
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3844448.html
最近更新
教材專(zhuān)著