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中華絨螯蟹育種群體遺傳特征分析及性早熟相關(guān)SNP標(biāo)記篩選

發(fā)布時間:2023-08-29 22:55
  中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)俗稱河蟹,主要分布于中國長江、遼河、甌江等水域,但群體自然分布以長江流域為主。多年來,由于各水系中華絨螯蟹無序引種和培育苗種的盲目放流,加上人工養(yǎng)殖群體向自然水體的逃逸,打破了各水系中華絨螯蟹的天然分布格局,各水系群體間的基因交流非常頻繁,由此產(chǎn)生了中華絨螯蟹的種質(zhì)混雜問題。因此,進(jìn)行長江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育已成當(dāng)務(wù)之急。本研究采用微衛(wèi)星技術(shù)分析了選育過程中所構(gòu)建的3個育種基礎(chǔ)群體的遺傳特征,以期為后期深入開展長江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育積累有益資料。近年來,在各地的養(yǎng)殖過程中普遍發(fā)生一齡蟹的性早熟現(xiàn)象。性早熟直接導(dǎo)致河蟹生長緩慢甚至停滯,個體小,死亡率高,嚴(yán)重制約了河蟹養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,給生產(chǎn)帶來了巨大損失。本研究在假設(shè)蛻皮抑制激素基因(MIH基因)變異與中華絨螯蟹性早熟之間存在相關(guān)性的基礎(chǔ)上,嘗試鑒定MIH基因調(diào)控區(qū)和編碼區(qū)的SNPs位點,然后對鑒定出的所有SNPs位點在性早熟蟹和正?坌分羞M(jìn)行基因分型,并對兩個群體中差異顯著的SNPs位點與中華絨螯蟹性早熟的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了分析。 為進(jìn)行長江水系中華絨螯蟹優(yōu)良品系選育,本研究利用1...

【文章頁數(shù)】:68 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜及性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
        1.1 中華絨螯蟹種質(zhì)混雜
        1.2 中華絨螯蟹性早熟機(jī)制研究進(jìn)展
            1.2.1 外在因素
                1.2.1.1 溫度
                1.2.1.2 鹽度
                1.2.1.3 光照
                1.2.1.4 營養(yǎng)
                1.2.1.5 放養(yǎng)密度
            1.2.2 內(nèi)在因素
                1.2.2.1 種質(zhì)和性別
                1.2.2.2 神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)
                1.2.2.3 類固醇激素
                1.2.2.4 肝胰腺
    2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用
        2.1 DNA分子標(biāo)記技術(shù)簡介
        2.2 DNA分子標(biāo)記技術(shù)在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應(yīng)用
            2.2.1 水產(chǎn)動物遺傳多樣性分析
            2.2.2 水產(chǎn)動物種質(zhì)鑒定
            2.2.3 水產(chǎn)動物親緣關(guān)系研究
            2.2.4 水產(chǎn)動物親子鑒定
            2.2.5 水產(chǎn)動物遺傳連鎖圖譜構(gòu)建
            2.2.6 水產(chǎn)動物QTL定位
            2.2.7 水產(chǎn)動物分子標(biāo)記輔助育種
        2.3 展望
    3 研究設(shè)想
第二章 中華絨螯蟹3個育種基礎(chǔ)群體遺傳特征的微衛(wèi)星分析
    1 材料與方法
        1.1 實驗材料與儀器
        1.1.1 材料獲取
            1.1.2 實驗儀器
        1.2 微衛(wèi)星引物
        1.3 方法
            1.3.1 DNA模板制備
            1.3.2 基因組DNA的檢測及濃度測定
            1.3.3 PCR擴(kuò)增與SSR引物篩選
            1.3.4 PCR產(chǎn)物的檢測
                1.3.4.1 瓊脂糖凝膠電泳檢測
                1.3.4.2 聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測
            1.3.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 各基因位點的遺傳多態(tài)
        2.2 Hardy-Weinberg平衡
        2.3 3個群體間的遺傳分化
    3 討論
        3.1 3個育種基礎(chǔ)群體的遺傳多樣性
        3.2 3個育種基礎(chǔ)群體雜合子缺失現(xiàn)象的原因分析
        3.3 3個育種基礎(chǔ)群體的遺傳結(jié)構(gòu)
第三章 中華絨螯蟹MIH基因變異及其與性早熟的關(guān)聯(lián)性分析
    1 材料與方法
        1.1 實驗材料
        1.2 SNPs篩選
        1.3 MIH基因分型
        1.4 統(tǒng)計分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 調(diào)控區(qū)結(jié)果
            2.1.1 鑒定的SNPs
            2.1.2 SNPs位點在性早熟及正常河蟹群體中的分布
            2.1.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
        2.2 編碼區(qū)結(jié)果
            2.2.1 鑒定的SNPs
            2.2.2 SNPs位點在性早熟及正常河蟹群體中的分布
            2.2.3 基因型與性早熟之間的關(guān)聯(lián)性
3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果
致謝



本文編號:3844448

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