隨著經(jīng)濟(jì)發(fā)展和世界人口的激增,全球能源和糧食消耗急劇增加。資源缺乏,生態(tài)環(huán)境惡化,耕地面積不斷減少種種問題也隨之而來。微藻的養(yǎng)殖受地域和季節(jié)影響較小,且不占用耕地。微藻資源的開發(fā)和利用順應(yīng)著社會的發(fā)展需要。富油新綠藻(Neochloris oleoabundans)具有高產(chǎn)油能力,有作為食品新資源生產(chǎn)食用油的潛力,但有關(guān)這種產(chǎn)油微藻的生物學(xué)特性在分子水平上的研究還十分不足。研究微藻葉綠體基因組有助于分類學(xué)研究、基因工程應(yīng)用以及微藻資源在食品領(lǐng)域的開發(fā)和利用。本文首次對富油新綠藻的葉綠體分離條件進(jìn)行優(yōu)化,提取出其葉綠體基因組并進(jìn)行測序,將獲得的基因組序列與幾種產(chǎn)油微綠藻的葉綠體基因組進(jìn)行生物信息學(xué)分析和比較。本文的研究對于加深富油新綠藻分類學(xué)等生物學(xué)基礎(chǔ)的認(rèn)識、產(chǎn)油微藻在食用油基因工程研究以及生物活性物質(zhì)在微藻葉綠體中高效表達(dá)提供研究基礎(chǔ)。本文的主要研究內(nèi)容及結(jié)果如下:(1)通過優(yōu)化percoll密度梯度離心法對富油新綠藻葉綠體進(jìn)行分離,確定了percoll密度組合為10%、35%、50%,結(jié)合恰當(dāng)?shù)碾x心機操作可以達(dá)到最好的分離效果。(2)通過對富油新綠藻的葉綠體基因組測序、序列組裝、基...

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 微藻及其應(yīng)用
        1.1.1 微藻
        1.1.2 微藻應(yīng)用現(xiàn)狀
        1.1.3 微藻應(yīng)用研究存在的問題
    1.2 葉綠體基因組的研究進(jìn)展
        1.2.1 葉綠體
        1.2.2 葉綠體基因組
        1.2.3 微藻葉綠體基因組研究的意義
        1.2.4 葉綠體基因組測序技術(shù)
    1.3 幾種產(chǎn)油微綠藻的研究進(jìn)展
        1.3.1 生物學(xué)基礎(chǔ)研究
        1.3.2 應(yīng)用研究
    1.4 選題意義與主要研究內(nèi)容
        1.4.1 選題意義
        1.4.2 主要研究內(nèi)容
2 富油新綠藻的葉綠體分離和葉綠體基因組提取
    2.1 材料與設(shè)備
        2.1.1 富油新綠藻藻種
        2.1.2 主要儀器與設(shè)備
        2.1.3 實驗試劑
    2.2 實驗方法
        2.2.1 富油新綠藻的培養(yǎng)與收獲
        2.2.2 富油新綠藻葉綠體分離中Percoll密度梯度優(yōu)化
        2.2.3 富油新綠藻葉綠體基因組提取
        2.2.4 瓊脂糖凝膠電泳檢測
        2.2.5 DNA總量測定
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 富油新綠藻葉綠體研磨效果觀察
        2.3.2 離心加速度篩選
        2.3.3 富油新綠藻葉綠體分離中percoll密度梯度分離液優(yōu)化
        2.3.4 富油新綠藻的葉綠體基因提取
        2.3.5 富油新綠藻cpDNA總量測定
    2.4 討論
    2.5 小結(jié)
3 富油新綠藻葉綠體基因組結(jié)構(gòu)拼接與解析
    3.1 材料與設(shè)備
        3.1.1 實驗材料
    3.2 實驗方法
        3.2.1 建庫測序
        3.2.2 基因組組裝及其圖譜繪制
        3.2.3 基因預(yù)測與注釋
        3.2.4 簡單重復(fù)序列分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 富油新綠藻葉綠體基因組基因組成及結(jié)構(gòu)特征
        3.3.2 富油新綠藻葉綠體基因組簡單重復(fù)序列分析
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
4 幾種產(chǎn)油微藻葉綠體基因比較分析
    4.1 材料與方法
        4.1.1 基因序列
        4.1.2 基因序列的共線性分析
        4.1.3 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
        4.1.4 密碼子偏好性分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 共線性分析
        4.2.2 系統(tǒng)發(fā)育樹
        4.2.3 索氏小球藻密碼子偏好性分析
        4.2.4 富油新綠藻密碼子偏好性分析
    4.3 討論
    4.4 小結(jié)
5 結(jié)論與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 創(chuàng)新點
    5.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介



本文編號：3834175