為了比較不同養(yǎng)殖環(huán)境下羅非魚腸道菌群結(jié)構(gòu)和相對(duì)豐度變化規(guī)律,選取稻田和池塘兩種養(yǎng)殖環(huán)境下的羅非魚為研究對(duì)象,定期測(cè)定實(shí)驗(yàn)期間的水質(zhì)指標(biāo)(溶氧、水溫、pH值和氨氮),取養(yǎng)殖202d的羅非魚,通過16SrRNA高通量測(cè)序檢測(cè)其腸道微生物,并分析不同養(yǎng)殖環(huán)境下羅非魚腸道菌群的變化規(guī)律。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,養(yǎng)殖水質(zhì)參數(shù)均在正常范圍內(nèi),但不同養(yǎng)殖環(huán)境的水質(zhì)參數(shù)存在差異,可能會(huì)導(dǎo)致羅非魚腸道微生物的結(jié)構(gòu)組成和多樣性發(fā)生變化。在兩種不同養(yǎng)殖環(huán)境下,梭桿菌門(Fusobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)3個(gè)菌群相對(duì)豐度均較高。藍(lán)菌門(Cyanobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和放線菌門(Actinobacteria)物種豐富度存在顯著性差異,其中藍(lán)菌門在稻田組的羅非魚腸道菌群中所占比例高于池塘組,而擬桿菌門和放線菌門在池塘組的羅非魚腸道菌群中所占比例高于稻田組;在屬水平下,Cetobacterium,Paeniclostrdium和Romboutsia等菌屬在稻田組羅非魚腸道菌群相對(duì)豐度較高,池塘組羅非魚腸道菌群相對(duì)豐度較高...

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及養(yǎng)殖
    1.2 取樣方法
    1.3 PCR擴(kuò)增及基因文庫構(gòu)建
        1.3.1 基因組DNA的提取和PCR擴(kuò)增
        1.3.2 PCR產(chǎn)物的混樣和純化
        1.3.3 基因文庫構(gòu)建
    1.4 測(cè)序分析
        1.4.1 數(shù)據(jù)處理
        1.4.2 OUTs聚類和物種注釋
2 結(jié)果與分析
    2.1 水質(zhì)變化情況
    2.2 腸道菌群α多樣性分析結(jié)果
    2.3 腸道菌群結(jié)構(gòu)
        2.3.1 門水平下的腸道菌群結(jié)構(gòu)
        2.3.2 屬水平下的腸道菌群結(jié)構(gòu)
3 討論
    3.1 水質(zhì)參數(shù)的影響
    3.2 腸道菌群結(jié)構(gòu)



本文編號(hào)：3824453