中華絨螯蟹DAZAP2通過(guò)Hippo信號(hào)通路調(diào)節(jié)抗菌肽表達(dá)的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-14 00:07
我國(guó)是水產(chǎn)養(yǎng)殖大國(guó),近年來(lái)隨著養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大,養(yǎng)殖病害日益凸顯,如何有效預(yù)防病害的發(fā)生、提升養(yǎng)殖品種抗病性能,是目前水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的重要課題。免疫系統(tǒng)是個(gè)體抵御外來(lái)病原入侵的有效防線(xiàn),對(duì)養(yǎng)殖品種免疫機(jī)制的深入研究,不僅有助于我們更好地理解養(yǎng)殖對(duì)象的免疫反應(yīng)機(jī)理,也將為細(xì)菌性疾病防控提供科學(xué)依據(jù)。本論文首先基于中華絨螯蟹全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù)和大量轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)獲得了EsDAZAP2的部分開(kāi)放閱讀框(ORF)序列,通過(guò)RACE技術(shù)擴(kuò)增得到EsDAZAP2基因cDNA全長(zhǎng)。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)DAZAP2在不同物種間相對(duì)保守,且均具有特征功能域和基序。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)EsDAZAP2在中華絨螯蟹不同組織中均有表達(dá),金黃色葡萄球菌和副溶血弧菌均能誘導(dǎo)EsDAZAP2在血細(xì)胞中的顯著表達(dá)上調(diào),暗示該基因可能與免疫反應(yīng)有關(guān)。為明確EsDAZAP2是否參與中華絨螯蟹固有免疫反應(yīng),我們通過(guò)RNAi技術(shù)敲降了EsDAZAP2基因并細(xì)菌刺激,結(jié)果發(fā)現(xiàn)EsDAZAP2敲降的中華絨螯蟹具有更高的細(xì)菌易感性,血淋巴中細(xì)菌的cfu也有極顯著上升,表明EsDAZAP2在中華絨螯蟹抗菌免疫反應(yīng)過(guò)程中具有重要作用。作為細(xì)胞內(nèi)蛋...
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 甲殼動(dòng)物的先天免疫的組成及其相關(guān)抗菌因子
1.1 前言
1.2 第一道防線(xiàn):角質(zhì)層和上皮
1.3 模式識(shí)別
1.4 凝集素
1.5 血細(xì)胞和造血作用
1.6 抗病毒反應(yīng)
1.7 RNA干擾或注射dsRNA誘導(dǎo)抗病毒活性
1.8 凝血反應(yīng)
1.9 抗菌蛋白
1.10 酚氧化酶原激活系統(tǒng)
1.11 結(jié)論
第二節(jié) 調(diào)控甲殼動(dòng)物先天免疫的主要信號(hào)通路
2.1 Toll信號(hào)通路
2.2 Imd信號(hào)通路
2.3 JAK/STAT信號(hào)通路
第三節(jié) Hippo信號(hào)通路的研究進(jìn)展
3.1 Hippo信號(hào)通路的核心組成部分
3.2 Hippo信號(hào)通路的功能
第四節(jié) 本課題研究目的、意義及研究方案
5.1 研究目的及意義
5.2 研究方案
第二章 EsDAZAP2 參與中華絨螯蟹的先天免疫反應(yīng)
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 中華絨螯蟹的飼養(yǎng)
2.2 細(xì)菌刺激
2.3 RNA的提取
2.4 模板的制備
2.5 基因克隆
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.8 RNA干擾
2.9 存活率實(shí)驗(yàn)
2.10 細(xì)菌清除實(shí)驗(yàn)
2.11 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 EsDAZAP2 基因全長(zhǎng)的獲得
3.2 EsDAZAP2 基因的生物信息學(xué)分析
3.3 EsDAZAP2 基因的各組織表達(dá)模式
3.4 EsDAZAP2 基因的不同菌刺激表達(dá)模式
3.5 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)中華絨螯蟹存活率的影響
3.6 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)中華絨螯蟹血細(xì)胞清除細(xì)菌能力的影響
3.7 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)抗菌肽表達(dá)的影響
3.8 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)三種入核因子的影響
第四節(jié) 討論
第三章 酵母雙雜交文庫(kù)的構(gòu)建以及篩選EsDAZAP2 相互作用的蛋白
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 中華絨螯蟹血細(xì)胞RNA的提取
2.2 初級(jí)文庫(kù)的構(gòu)建
2.3 次級(jí)文庫(kù)的構(gòu)建
2.4 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建
2.5 酵母雙雜交mating篩庫(kù)
2.6 免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
2.7 免疫印跡Western Blot
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 初級(jí)文庫(kù)質(zhì)量鑒定
3.2 次級(jí)文庫(kù)質(zhì)量鑒定
3.3 酵母轉(zhuǎn)化效率
3.4 誘餌蛋白的自激活檢測(cè)
3.5 EsDAZAP與 EsSav相互作用
第四節(jié) 討論
第四章 Hippo信號(hào)通路參與調(diào)節(jié)抗菌肽
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 基因克隆
2.2 Western Blot
2.3 免疫熒光
2.4 RNA干擾
2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 Hippo通路成員的鑒定
3.2 細(xì)菌刺激對(duì)EsHpo磷酸化以及EsYki細(xì)胞定位的影響
3.3 干擾EsHpo對(duì) EsYki細(xì)胞定位的影響
3.4 干擾EsHpo對(duì)中華絨螯蟹的存活率及細(xì)菌清除能力的影響
3.5 干擾EsHpo對(duì)抗菌肽的影響
3.6 干擾EsHpo對(duì) Dorsal入核的影響
3.7 干擾EsYki對(duì) EsCact轉(zhuǎn)錄水平的影響
第四節(jié) 討論
第五章 EsDAZAP2與EsSav相互作用并參與調(diào)控Hippo信號(hào)通路
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 樣品處理
2.2 Western Blot
2.3 免疫熒光
2.4 RNA干擾
2.5 免疫共沉淀
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 干擾EsDAZAP2對(duì)EsHpo磷酸化的影響
3.2 干擾EsDAZAP2對(duì)EsYki細(xì)胞定位的影響
3.3 EsDAZAP2與EsSav相互作用的結(jié)構(gòu)域
第四節(jié) 討論
本研究的結(jié)論、特色與創(chuàng)新點(diǎn)
1.本研究的結(jié)論
2.特色
3.創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間完成與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號(hào):3816799
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 甲殼動(dòng)物的先天免疫的組成及其相關(guān)抗菌因子
1.1 前言
1.2 第一道防線(xiàn):角質(zhì)層和上皮
1.3 模式識(shí)別
1.4 凝集素
1.5 血細(xì)胞和造血作用
1.6 抗病毒反應(yīng)
1.7 RNA干擾或注射dsRNA誘導(dǎo)抗病毒活性
1.8 凝血反應(yīng)
1.9 抗菌蛋白
1.10 酚氧化酶原激活系統(tǒng)
1.11 結(jié)論
第二節(jié) 調(diào)控甲殼動(dòng)物先天免疫的主要信號(hào)通路
2.1 Toll信號(hào)通路
2.2 Imd信號(hào)通路
2.3 JAK/STAT信號(hào)通路
第三節(jié) Hippo信號(hào)通路的研究進(jìn)展
3.1 Hippo信號(hào)通路的核心組成部分
3.2 Hippo信號(hào)通路的功能
第四節(jié) 本課題研究目的、意義及研究方案
5.1 研究目的及意義
5.2 研究方案
第二章 EsDAZAP2 參與中華絨螯蟹的先天免疫反應(yīng)
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 中華絨螯蟹的飼養(yǎng)
2.2 細(xì)菌刺激
2.3 RNA的提取
2.4 模板的制備
2.5 基因克隆
2.6 生物信息學(xué)分析
2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.8 RNA干擾
2.9 存活率實(shí)驗(yàn)
2.10 細(xì)菌清除實(shí)驗(yàn)
2.11 免疫熒光實(shí)驗(yàn)
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 EsDAZAP2 基因全長(zhǎng)的獲得
3.2 EsDAZAP2 基因的生物信息學(xué)分析
3.3 EsDAZAP2 基因的各組織表達(dá)模式
3.4 EsDAZAP2 基因的不同菌刺激表達(dá)模式
3.5 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)中華絨螯蟹存活率的影響
3.6 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)中華絨螯蟹血細(xì)胞清除細(xì)菌能力的影響
3.7 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)抗菌肽表達(dá)的影響
3.8 EsDAZAP2 基因的干擾對(duì)三種入核因子的影響
第四節(jié) 討論
第三章 酵母雙雜交文庫(kù)的構(gòu)建以及篩選EsDAZAP2 相互作用的蛋白
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 中華絨螯蟹血細(xì)胞RNA的提取
2.2 初級(jí)文庫(kù)的構(gòu)建
2.3 次級(jí)文庫(kù)的構(gòu)建
2.4 誘餌質(zhì)粒的構(gòu)建
2.5 酵母雙雜交mating篩庫(kù)
2.6 免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)
2.7 免疫印跡Western Blot
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 初級(jí)文庫(kù)質(zhì)量鑒定
3.2 次級(jí)文庫(kù)質(zhì)量鑒定
3.3 酵母轉(zhuǎn)化效率
3.4 誘餌蛋白的自激活檢測(cè)
3.5 EsDAZAP與 EsSav相互作用
第四節(jié) 討論
第四章 Hippo信號(hào)通路參與調(diào)節(jié)抗菌肽
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 基因克隆
2.2 Western Blot
2.3 免疫熒光
2.4 RNA干擾
2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 Hippo通路成員的鑒定
3.2 細(xì)菌刺激對(duì)EsHpo磷酸化以及EsYki細(xì)胞定位的影響
3.3 干擾EsHpo對(duì) EsYki細(xì)胞定位的影響
3.4 干擾EsHpo對(duì)中華絨螯蟹的存活率及細(xì)菌清除能力的影響
3.5 干擾EsHpo對(duì)抗菌肽的影響
3.6 干擾EsHpo對(duì) Dorsal入核的影響
3.7 干擾EsYki對(duì) EsCact轉(zhuǎn)錄水平的影響
第四節(jié) 討論
第五章 EsDAZAP2與EsSav相互作用并參與調(diào)控Hippo信號(hào)通路
第一節(jié) 前言
第二節(jié) 材料與方法
2.1 樣品處理
2.2 Western Blot
2.3 免疫熒光
2.4 RNA干擾
2.5 免疫共沉淀
第三節(jié) 結(jié)果
3.1 干擾EsDAZAP2對(duì)EsHpo磷酸化的影響
3.2 干擾EsDAZAP2對(duì)EsYki細(xì)胞定位的影響
3.3 EsDAZAP2與EsSav相互作用的結(jié)構(gòu)域
第四節(jié) 討論
本研究的結(jié)論、特色與創(chuàng)新點(diǎn)
1.本研究的結(jié)論
2.特色
3.創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
攻讀博士學(xué)位期間完成與發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號(hào):3816799
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