草魚unc45b基因的全長克
發(fā)布時(shí)間:2023-05-11 05:13
試驗(yàn)一草魚unc45b基因的全長克隆、生物信息學(xué)分析及組織差異表達(dá)UNC45b(unc-45 myosin chaperone b)是肌球蛋白的分子伴侶,在肌纖維形成過程中調(diào)控肌球蛋白(粗肌絲)的折疊、組裝和積累,對(duì)維持肌節(jié)穩(wěn)定和肌肉發(fā)育起著重要作用。本實(shí)驗(yàn)采用c DNA末端快速擴(kuò)增法首次克隆獲得草魚unc45b基因全長序列,對(duì)其編碼蛋白質(zhì)序列的特性進(jìn)行預(yù)測和分析,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測草魚各組織unc45b基因的差異表達(dá)。結(jié)果表明,草魚unc45b基因全長3163bp,含60 bp的5’端非編碼區(qū)、298 bp的3’端非編碼區(qū)及長2865 bp編碼934個(gè)氨基酸的開放閱讀框。草魚unc45b基因編碼的氨基酸序列與斑馬魚、斑點(diǎn)叉尾鮰、墨西哥麗脂鯉、尼羅羅非魚和大西洋鮭unc45b的氨基酸序列同源性分別達(dá)92%、86%、86%、82%和81%;生物信息學(xué)分析顯示草魚unc45b蛋白分子質(zhì)量103,699.8Da,理論等電點(diǎn)7.39,為親水性非分泌蛋白,不含信號(hào)肽;其二級(jí)、三級(jí)結(jié)構(gòu)包括α-螺旋(α-helix)和環(huán)(loop)。組織差異表達(dá)結(jié)果顯示unc45b基因在草魚血液、肝臟、...
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1. 普通草魚和脆化草魚
2. 肌肉
2.1 肌肉品質(zhì)
2.2 肌原纖維
2.3 伴侶蛋白與肌節(jié)裝配與降解
2.4 熱激蛋白 90 (Hsp90)
2.5 Unc45蛋白
2.6 CHIP蛋白
2.7 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
3. 絲裂原活化蛋白激酶 (MAP K)
4. 本論文研究的目的、內(nèi)容和意義
4.1 草魚unc45b基因的全長克隆、生物信息學(xué)分析及組織差異表達(dá)
4.2 脆化草魚肌節(jié)裝配相關(guān)基因unc45b的時(shí)空表達(dá)
第一章 草魚unc45b基因的全長克隆、生物信息學(xué)分析及組織差異表達(dá)
1. 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 unc45b基因全長克隆與序列分析
2.2 Unc45b氨基酸序列同源性比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
2.3 Unc45b蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.4 草魚unc45b基因的組織差異表達(dá)
3. 討論
3.1 草魚Unc45b基因與氨基酸同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3.2 草魚Unc45b蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
3.3 草魚unc45b基因組織差異表達(dá)
3.4 Unc45b蛋白功能
4. 小結(jié)
第二章 脆化草魚肌節(jié)裝配相關(guān)基因unc45b的時(shí)空表達(dá)
1. 材料與方法
1.1 材料來源
1.2 養(yǎng)殖實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 養(yǎng)殖管理
1.4 樣品采集
1.5 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
1.6 各組織總RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄
1.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR測定草魚unc45b基因不同時(shí)期的表達(dá)
2. 結(jié)果
2.1 0周、4 周、8 周、12周各時(shí)間點(diǎn)魚體體重
2.2 定量反應(yīng)體系檢測
2.3 草魚不同組織unc45b基因的時(shí)空表達(dá)分析 (組內(nèi)分析)
2.4 蠶豆對(duì)草魚不同組織unc45b基因表達(dá)的影響 (組間分析)
3. 討論
3.1 蠶豆對(duì)草魚生長的影響
3.2 unc45b基因的功能
3.3 unc45b基因表達(dá)的組織特異性
3.4 草魚骨骼肌和心肌組織unc45b基因的時(shí)空表達(dá)及蠶豆的促表達(dá)作用
3.5 草魚肝臟和皮膚組織 unc45b 基因的時(shí)空表達(dá)
4. 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
論文發(fā)表
致謝
本文編號(hào):3814231
【文章頁數(shù)】:64 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
引言
1. 普通草魚和脆化草魚
2. 肌肉
2.1 肌肉品質(zhì)
2.2 肌原纖維
2.3 伴侶蛋白與肌節(jié)裝配與降解
2.4 熱激蛋白 90 (Hsp90)
2.5 Unc45蛋白
2.6 CHIP蛋白
2.7 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
3. 絲裂原活化蛋白激酶 (MAP K)
4. 本論文研究的目的、內(nèi)容和意義
4.1 草魚unc45b基因的全長克隆、生物信息學(xué)分析及組織差異表達(dá)
4.2 脆化草魚肌節(jié)裝配相關(guān)基因unc45b的時(shí)空表達(dá)
第一章 草魚unc45b基因的全長克隆、生物信息學(xué)分析及組織差異表達(dá)
1. 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 方法
2.結(jié)果
2.1 unc45b基因全長克隆與序列分析
2.2 Unc45b氨基酸序列同源性比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
2.3 Unc45b蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
2.4 草魚unc45b基因的組織差異表達(dá)
3. 討論
3.1 草魚Unc45b基因與氨基酸同源性比較及系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建
3.2 草魚Unc45b蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
3.3 草魚unc45b基因組織差異表達(dá)
3.4 Unc45b蛋白功能
4. 小結(jié)
第二章 脆化草魚肌節(jié)裝配相關(guān)基因unc45b的時(shí)空表達(dá)
1. 材料與方法
1.1 材料來源
1.2 養(yǎng)殖實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 養(yǎng)殖管理
1.4 樣品采集
1.5 實(shí)驗(yàn)試劑與儀器
1.6 各組織總RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄
1.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR測定草魚unc45b基因不同時(shí)期的表達(dá)
2. 結(jié)果
2.1 0周、4 周、8 周、12周各時(shí)間點(diǎn)魚體體重
2.2 定量反應(yīng)體系檢測
2.3 草魚不同組織unc45b基因的時(shí)空表達(dá)分析 (組內(nèi)分析)
2.4 蠶豆對(duì)草魚不同組織unc45b基因表達(dá)的影響 (組間分析)
3. 討論
3.1 蠶豆對(duì)草魚生長的影響
3.2 unc45b基因的功能
3.3 unc45b基因表達(dá)的組織特異性
3.4 草魚骨骼肌和心肌組織unc45b基因的時(shí)空表達(dá)及蠶豆的促表達(dá)作用
3.5 草魚肝臟和皮膚組織 unc45b 基因的時(shí)空表達(dá)
4. 小結(jié)
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
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致謝
本文編號(hào):3814231
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