長(zhǎng)牡蠣快速生長(zhǎng)品系選育及重要功能基因與生長(zhǎng)和糖原含量相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-05-08 00:49
長(zhǎng)牡蠣(Crassostrea gigas)又稱太平洋牡蠣,是世界上養(yǎng)殖范圍最廣、產(chǎn)量最大的海產(chǎn)經(jīng)濟(jì)貝類,也是我國(guó)重要的傳統(tǒng)養(yǎng)殖品種。目前我國(guó)長(zhǎng)牡蠣養(yǎng)殖業(yè)所用種質(zhì)均未經(jīng)系統(tǒng)地遺傳改良,在大規(guī)模累代集約化養(yǎng)殖的過程中出現(xiàn)了生長(zhǎng)慢、出肉率低和抗逆性差等種質(zhì)退化問題,嚴(yán)重影響長(zhǎng)牡蠣產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆的長(zhǎng)牡蠣新品種是解決這一問題的有效途徑。 我國(guó)的長(zhǎng)牡蠣良種選育工作自2006年正式開展,在查清種質(zhì)資源現(xiàn)狀的基礎(chǔ)上,2007年構(gòu)建了中國(guó)、日本和韓國(guó)三個(gè)地理群體的快速生長(zhǎng)選育系第一代,至2014年已連續(xù)選育七代。在群體選育的同時(shí)篩選并純化培育了多個(gè)白殼色、黑殼色、金殼色和紫殼色的長(zhǎng)牡蠣核心種質(zhì)家系,并篩選與長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原含量相關(guān)的功能基因及分子標(biāo)記,為長(zhǎng)牡蠣遺傳改良提供寶貴素材和理論支持。本研究主要分析了長(zhǎng)牡蠣三個(gè)地理群體第四代選育系的選育進(jìn)展及第五代選育系的生長(zhǎng)性能及其基因型與環(huán)境互作效應(yīng);比較了長(zhǎng)牡蠣四種殼色家系子代的表型性狀;研究了長(zhǎng)牡蠣類胰島素通路關(guān)鍵基因(oIRP、IRR和Ras基因)和β-葡萄糖苷酶基因多態(tài)性與長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原含量性狀的關(guān)聯(lián)性。主要研究結(jié)果如下: ...
【文章頁(yè)數(shù)】:152 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣生物學(xué)
1 分類地位
2 形態(tài)結(jié)構(gòu)
2.1 外部形態(tài)
2.2 內(nèi)部構(gòu)造
3 生長(zhǎng)和繁殖周期
3.1 生長(zhǎng)規(guī)律
3.2 繁殖周期
4 糖原含量變化周期
5 養(yǎng)殖現(xiàn)狀
第二節(jié) 牡蠣遺傳育種研究進(jìn)展
1 主要選育性狀
1.1 生長(zhǎng)速度
1.2 殼型
1.3 抗病力
1.4 糖原含量
1.5 殼色
2 育種方法
2.1 選擇育種
2.2 雜交育種
2.3 多倍體育種
2.4 分子育種
3 選育進(jìn)展評(píng)估
3.1 遺傳力
3.2 表型及遺傳相關(guān)
3.3 基因型與環(huán)境互作
3.4 遺傳結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原相關(guān)功能基因及 SNP 研究進(jìn)展
1 長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原調(diào)控網(wǎng)絡(luò)相關(guān)功能基因研究進(jìn)展
1.1 長(zhǎng)牡蠣類胰島素家族基因
1.2 β-葡萄糖苷酶基因
2 常用 SNP 檢測(cè)技術(shù)及應(yīng)用
2.1 常用的 SNP 分型和檢測(cè)技術(shù)
2.2 SNP 標(biāo)記在海洋水產(chǎn)動(dòng)物中的應(yīng)用
第四節(jié) 本研究的目標(biāo)和主要研究?jī)?nèi)容
1 研究目標(biāo)
2 研究?jī)?nèi)容
第二章 長(zhǎng)牡蠣快速生長(zhǎng)品系選育
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣三個(gè)地理群體第四代選育系的選育進(jìn)展
0 引言
1 材料與方法
1.1 選育系譜及親貝選擇
1.2 人工受精及孵化
1.3 幼蟲培育及采苗
1.4 稚貝暫養(yǎng)和成貝養(yǎng)成
1.5 樣品采集和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 殼高和活體重
2.2 殼型變異度
2.3 遺傳參數(shù)
3 討論
4 結(jié)論
第二節(jié) 長(zhǎng)牡蠣第五代選育系基因型與環(huán)境互作效應(yīng)
0 引言
1 材料與方法
1.1 選育系譜
1.2 人工受精及孵化
1.3 幼蟲培育及采苗
1.4 稚貝暫養(yǎng)和成貝養(yǎng)成
1.5 樣品采集和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 選育系的殼高性狀
2.2 選育系的總重
2.3 360 日齡選育系生長(zhǎng)性狀的基因型與環(huán)境互作
3 討論
4 結(jié)論
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣四種殼色家系子代的表型性狀比較
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及幼體培育
1.2 稚貝暫養(yǎng)和親貝養(yǎng)成
1.3 指標(biāo)測(cè)定
1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 卵徑、孵化率、受精率
2.2 幼蟲生長(zhǎng)、存活及變態(tài)
2.3 稚貝的生長(zhǎng)及存活
2.4 成貝生長(zhǎng)及存活性狀的基因型與環(huán)境互作效應(yīng)
3 討論
3.1 殼色對(duì)長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和存活的影響
3.2 長(zhǎng)牡蠣殼色家系的基因型與環(huán)境互作效應(yīng)分析
4 結(jié)論
第三章 重要功能基因與生長(zhǎng)和糖原含量相關(guān)性研究
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 OIRP 基因 SNPS與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.3 SSCP 電泳及測(cè)序
1.4 關(guān)聯(lián)分析策略
1.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 oIRP 基因 SNP 多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 單倍型構(gòu)建及與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 oIRP 基因 SNPs 頻率及分布規(guī)律
3.2 oIRP 基因 SNPs 對(duì)長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)作用的分子機(jī)理
4 結(jié)論
第二節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 IRR 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原含量關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4 SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣 IRR 基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 IRR 基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 IRR 基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 IRR 基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀和糖原含量作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原含量關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4. SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 Ras 基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
第四節(jié) β-glucosidase 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原的關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4. SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
學(xué)術(shù)成果
本文編號(hào):3811655
【文章頁(yè)數(shù)】:152 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
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摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣生物學(xué)
1 分類地位
2 形態(tài)結(jié)構(gòu)
2.1 外部形態(tài)
2.2 內(nèi)部構(gòu)造
3 生長(zhǎng)和繁殖周期
3.1 生長(zhǎng)規(guī)律
3.2 繁殖周期
4 糖原含量變化周期
5 養(yǎng)殖現(xiàn)狀
第二節(jié) 牡蠣遺傳育種研究進(jìn)展
1 主要選育性狀
1.1 生長(zhǎng)速度
1.2 殼型
1.3 抗病力
1.4 糖原含量
1.5 殼色
2 育種方法
2.1 選擇育種
2.2 雜交育種
2.3 多倍體育種
2.4 分子育種
3 選育進(jìn)展評(píng)估
3.1 遺傳力
3.2 表型及遺傳相關(guān)
3.3 基因型與環(huán)境互作
3.4 遺傳結(jié)構(gòu)
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原相關(guān)功能基因及 SNP 研究進(jìn)展
1 長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和糖原調(diào)控網(wǎng)絡(luò)相關(guān)功能基因研究進(jìn)展
1.1 長(zhǎng)牡蠣類胰島素家族基因
1.2 β-葡萄糖苷酶基因
2 常用 SNP 檢測(cè)技術(shù)及應(yīng)用
2.1 常用的 SNP 分型和檢測(cè)技術(shù)
2.2 SNP 標(biāo)記在海洋水產(chǎn)動(dòng)物中的應(yīng)用
第四節(jié) 本研究的目標(biāo)和主要研究?jī)?nèi)容
1 研究目標(biāo)
2 研究?jī)?nèi)容
第二章 長(zhǎng)牡蠣快速生長(zhǎng)品系選育
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣三個(gè)地理群體第四代選育系的選育進(jìn)展
0 引言
1 材料與方法
1.1 選育系譜及親貝選擇
1.2 人工受精及孵化
1.3 幼蟲培育及采苗
1.4 稚貝暫養(yǎng)和成貝養(yǎng)成
1.5 樣品采集和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 殼高和活體重
2.2 殼型變異度
2.3 遺傳參數(shù)
3 討論
4 結(jié)論
第二節(jié) 長(zhǎng)牡蠣第五代選育系基因型與環(huán)境互作效應(yīng)
0 引言
1 材料與方法
1.1 選育系譜
1.2 人工受精及孵化
1.3 幼蟲培育及采苗
1.4 稚貝暫養(yǎng)和成貝養(yǎng)成
1.5 樣品采集和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 選育系的殼高性狀
2.2 選育系的總重
2.3 360 日齡選育系生長(zhǎng)性狀的基因型與環(huán)境互作
3 討論
4 結(jié)論
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣四種殼色家系子代的表型性狀比較
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及幼體培育
1.2 稚貝暫養(yǎng)和親貝養(yǎng)成
1.3 指標(biāo)測(cè)定
1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 卵徑、孵化率、受精率
2.2 幼蟲生長(zhǎng)、存活及變態(tài)
2.3 稚貝的生長(zhǎng)及存活
2.4 成貝生長(zhǎng)及存活性狀的基因型與環(huán)境互作效應(yīng)
3 討論
3.1 殼色對(duì)長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)和存活的影響
3.2 長(zhǎng)牡蠣殼色家系的基因型與環(huán)境互作效應(yīng)分析
4 結(jié)論
第三章 重要功能基因與生長(zhǎng)和糖原含量相關(guān)性研究
第一節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 OIRP 基因 SNPS與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.3 SSCP 電泳及測(cè)序
1.4 關(guān)聯(lián)分析策略
1.5 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 oIRP 基因 SNP 多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 單倍型構(gòu)建及與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 oIRP 基因 SNPs 頻率及分布規(guī)律
3.2 oIRP 基因 SNPs 對(duì)長(zhǎng)牡蠣生長(zhǎng)作用的分子機(jī)理
4 結(jié)論
第二節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 IRR 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原含量關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4 SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣 IRR 基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 IRR 基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 IRR 基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 IRR 基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀和糖原含量作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
第三節(jié) 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原含量關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4. SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 Ras 基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 長(zhǎng)牡蠣 Ras 基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
第四節(jié) β-glucosidase 基因 SNPS與生長(zhǎng)及糖原的關(guān)聯(lián)研究
0 引言
1 材料與方法
1.1 家系構(gòu)建及數(shù)據(jù)測(cè)量
1.2 快速生長(zhǎng)品系構(gòu)建及生長(zhǎng)數(shù)據(jù)測(cè)量
1.3 引物設(shè)計(jì),DNA 提取和 PCR 擴(kuò)增
1.4. SSCP 電泳及測(cè)序
1.5 關(guān)聯(lián)分析策略
1.6 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 SNP 鑒定和等位基因頻率
2.2 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析
2.3 β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 與長(zhǎng)牡蠣家系糖原含量的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
3.1 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 頻率及多態(tài)性
3.2 長(zhǎng)牡蠣β-葡萄糖苷酶基因 SNPs 對(duì)生長(zhǎng)性狀作用的生理機(jī)制
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
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學(xué)術(shù)成果
本文編號(hào):3811655
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