發(fā)布時間：2023-05-03 15:35

　　文昌魚(Branchiostoma)是研究脊椎動物起源和進化的模式動物,具有極高的科研價值。此外,文昌魚還具有很高的營養(yǎng)價值。廈門劉五店曾因是世界上唯一的文昌魚漁場而馳名中外,但由于生境破壞和過度捕撈等原因,文昌魚資源量急劇下降,已被列為國家二級保護動物。本研究運用微衛(wèi)星分子標記、AFLP分子標記技術(shù)及線粒體DNA COI基因標記技術(shù)對瀕危物種文昌魚的青島、廈門和北海三個群體的遺傳多樣性和遺傳分化進行了研究,以期提供文昌魚相關(guān)遺傳背景知識,進一步完善文昌魚保護遺傳學方面的研究,為文昌魚保護策略的制定提供理論依據(jù)。(1)采用FIASCO法,利用生物素標記的(GT)₁₅、(CT)₁₅混合寡核苷酸探針從文昌魚的基因組DNA的MboI酶切片段中篩選出微衛(wèi)星序列,最終獲得了12個具有多態(tài)性的微衛(wèi)星位點。其中每個位點的等位基因數(shù)(N_a)為3-7個,多態(tài)信息含量(PIC)為0.309-0.778,觀察雜合度(H_o)為0.1786-0.8571,期望雜合度(H_e)為0.2449-0.7825。...

【文章頁數(shù)】：122 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 文昌魚生物學特征及我國文昌魚研究概況
        1.1.1 文昌魚的生物學特征
        1.1.2 我國文昌魚的研究概況
    1.2 群體遺傳學方法及其在文昌魚中的應(yīng)用
        1.2.1 等位酶技術(shù)
        1.2.2 RAPD技術(shù)
        1.2.3 AFLP技術(shù)
        1.2.4 微衛(wèi)星標記技術(shù)
        1.2.5 線粒體DNA標記技術(shù)
    1.3 三種海參生物學特征與研究概況
        1.3.1 玉足海參生物學特征
        1.3.2 玉足海參研究概況
        1.3.3 糙海參生物學特征
        1.3.4 糙海參研究概況
        1.3.5 糙刺參生物學特征
        1.3.6 糙刺參研究概況
    1.4 本研究的目的意義與方案
        1.4.1 文昌魚群體遺傳學研究的目的意義與方案
        1.4.2 三種海參微衛(wèi)星開發(fā)研究的目的意義與方案
第2章 文昌魚微衛(wèi)星標記篩選
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 實驗儀器與試劑
        2.1.3 實驗方法
    2.2 實驗結(jié)果
        2.2.1 基因組DNA提取結(jié)果
        2.2.2 基因組酶切結(jié)果
        2.2.3 目的片段PCR結(jié)果
        2.2.4 陽性克隆檢測結(jié)果
        2.2.5 測序結(jié)果及引物設(shè)計
        2.2.6 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測
    2.3 討論
第3章 基于微衛(wèi)星標記技術(shù)的文昌魚群體遺傳學研究
    3.1 實驗材料與方法
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 實驗儀器及試劑
        3.1.3 實驗方法
    3.2 實驗結(jié)果
        3.2.1 文昌魚微衛(wèi)星的擴增
        3.2.2 文昌魚群體的雜合性
        3.2.3 文昌魚群體的遺傳多樣性
        3.2.4 文昌魚群體間的遺傳分化
    3.3 討論
        3.3.1 文昌魚群體雜合性分析
        3.3.2 文昌魚群體遺傳多樣性分析
        3.3.3 文昌魚群體的遺傳分化分析
第4章 基于AFLP技術(shù)的文昌魚群體遺傳學研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實驗材料
        4.1.2 主要儀器與試劑
        4.1.3 實驗方法
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 文昌魚基因DNA提取結(jié)果
        4.2.2 基因組DNA酶切結(jié)果
        4.2.3 文昌魚AFLP的擴增結(jié)果
        4.2.4 文昌魚群體多樣性
        4.2.5 文昌魚群體的遺傳分化
    4.3 討論
        4.3.1 文昌魚群體遺傳多樣性
        4.3.2 文昌魚群體遺傳分化研究
第5章 文昌魚群體線粒體COI基因序列比較研究
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實驗材料
        5.1.2 實驗儀器與試劑
        5.1.3 實驗方法
    5.2 結(jié)果
        5.2.1 擴增產(chǎn)物與序列測定
        5.2.2 序列特征及群體遺傳多樣性
        5.2.3 文昌魚群體間的遺傳變異
        5.2.4 分子中性進化檢驗
    5.3 討論
        5.3.1 序列特征及群體遺傳多樣性分析
        5.3.2 文昌魚群體間的遺傳變異分析
        5.3.3 分子中性進化分析
        5.3.4 3個群體文昌魚與其它文昌魚系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系
第6章 三種海參微衛(wèi)星開發(fā)的研究
    6.1 材料與方法
        6.1.1 實驗材料
        6.1.2 實驗儀器與試劑
        6.1.3 實驗方法
    6.2 實驗結(jié)果
        6.2.1 基因組DNA提取結(jié)果
        6.2.2 基因組DNA酶切結(jié)果
        6.2.3 目的片段PCR擴增結(jié)果
        6.2.4 陽性克隆檢測結(jié)果
        6.2.5 測序結(jié)果及引物設(shè)計
        6.2.6 微衛(wèi)星多態(tài)性檢測結(jié)果
    6.3 討論
第7章 結(jié)論與展望
    7.1 文昌魚遺傳學研究結(jié)論與展望
    7.2 三種海參微衛(wèi)星位點的開發(fā)研究結(jié)論與展望
致謝
參考文獻
在校期間發(fā)表的論文
在校期間即將發(fā)表的論文



本文編號：3806980