養(yǎng)殖達(dá)氏鰉和西伯利亞鱘種群微衛(wèi)星驗(yàn)證及遺傳多樣性分析
發(fā)布時(shí)間:2023-04-05 20:42
鱘魚是一類古老的大型多倍體經(jīng)濟(jì)魚類,由于人類過度捕撈和對(duì)其生存生態(tài)環(huán)境的破壞,世界范圍內(nèi)的鱘魚自然資源日趨枯竭。本試驗(yàn)通過小體鱘微衛(wèi)星數(shù)據(jù)處理方法研究,利用13個(gè)微衛(wèi)星DNA標(biāo)記位點(diǎn)對(duì)人工養(yǎng)殖的四倍體小體鱘種群進(jìn)行擴(kuò)增,得知“比例法”、“補(bǔ)齊法”、“1、0法”等多倍體樣品的微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析方法差異不顯著,由于在實(shí)際讀圖中,補(bǔ)齊法更加有效便捷,因此可根據(jù)試驗(yàn)方法和樣品來源選擇該數(shù)據(jù)讀取方法。對(duì)前期開發(fā)的達(dá)氏鰉和西伯利亞鱘微衛(wèi)星引物進(jìn)行驗(yàn)證,從而篩選出具有高多態(tài)性位點(diǎn)的20對(duì)達(dá)氏鰉和21對(duì)西伯利亞鱘引物。從篩選出的21對(duì)西伯利亞鱘微衛(wèi)星引物中篩選出14對(duì)進(jìn)行兩兩組合建立了7組微衛(wèi)星多重PCR體系。使用新篩選出的微衛(wèi)星位點(diǎn),對(duì)養(yǎng)殖達(dá)氏鰉和西伯利亞鱘種群進(jìn)行遺傳多樣性分析得知,達(dá)氏鰉種群和西伯利亞鱘種群在新微衛(wèi)星位點(diǎn)上分別檢測(cè)到443和644個(gè)等位基因,各群體的平均有效等位基因數(shù)分別是9.0759、13.4074。所有位點(diǎn)平均PIC指數(shù)分別為0.8595、0.8797,均大于0.5,表明驗(yàn)證得到的這些微衛(wèi)星位點(diǎn)均屬于高多態(tài)性位點(diǎn)。兩種群平均表觀雜合度是0.9534、0.9084,平均期望雜合度是...
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞
第一章 前言
1.1 鱘魚
1.1.1 分類及體型
1.1.2 分布及生境
1.1.3 食性及生長(zhǎng)
1.1.4 洄游及繁殖
1.1.5 經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.1.6 保護(hù)現(xiàn)狀
1.2 微衛(wèi)星
1.2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記
1.2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
1.2.3 微衛(wèi)星標(biāo)記的應(yīng)用
1.3 遺傳多樣性
1.3.1 遺傳多樣性概述
1.3.2 遺傳多樣性研究意義
1.4 研究的目的與意義
第二章 養(yǎng)殖小體鱘種群微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析方法比較研究
2.1 材料與方法
2.1.1 樣品采集及基因組DNA提取
2.1.2 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
2.1.3 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果
2.3 討論
第三章 養(yǎng)殖達(dá)氏鰉微衛(wèi)星引物驗(yàn)證及遺傳多樣性分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 達(dá)氏鰉基因組DNA提取
3.1.4 達(dá)氏鰉新SSR引物的篩選
3.1.5 達(dá)氏鰉新SSR引物的克隆驗(yàn)證
3.1.6 PCR擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
3.1.7 跨種擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
3.2 結(jié)果
3.2.1 基因組DNA的提取
3.2.2 SSR引物篩選
3.2.3 SSR引物克隆驗(yàn)證
3.2.4 PCR擴(kuò)增及分析
3.2.5 跨種擴(kuò)增及分析
3.3 討論
第四章 養(yǎng)殖西伯利亞鱘微衛(wèi)星引物驗(yàn)證及遺傳多樣性分析
4.1 材料和方法
4.1.1 試驗(yàn)材料
4.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
4.1.3 西伯利亞鱘基因組DNA提取
4.1.4 西伯利亞鱘新SSR引物的篩選及多重PCR建立
4.1.5 西伯利亞鱘新SSR引物的驗(yàn)證
4.1.6 PCR擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
4.1.7 跨種擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
4.2 結(jié)果
4.2.1 基因組DNA的提取
4.2.2 SSR引物的篩選
4.2.3 SSR引物的克隆驗(yàn)證
4.2.4 PCR擴(kuò)增及分析
4.2.5 PCR跨種擴(kuò)增及分析
4.3 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號(hào):3784098
【文章頁數(shù)】:57 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞
第一章 前言
1.1 鱘魚
1.1.1 分類及體型
1.1.2 分布及生境
1.1.3 食性及生長(zhǎng)
1.1.4 洄游及繁殖
1.1.5 經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.1.6 保護(hù)現(xiàn)狀
1.2 微衛(wèi)星
1.2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記
1.2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記的優(yōu)缺點(diǎn)
1.2.3 微衛(wèi)星標(biāo)記的應(yīng)用
1.3 遺傳多樣性
1.3.1 遺傳多樣性概述
1.3.2 遺傳多樣性研究意義
1.4 研究的目的與意義
第二章 養(yǎng)殖小體鱘種群微衛(wèi)星數(shù)據(jù)分析方法比較研究
2.1 材料與方法
2.1.1 樣品采集及基因組DNA提取
2.1.2 PCR擴(kuò)增及檢測(cè)
2.1.3 數(shù)據(jù)分析
2.2 結(jié)果
2.3 討論
第三章 養(yǎng)殖達(dá)氏鰉微衛(wèi)星引物驗(yàn)證及遺傳多樣性分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 達(dá)氏鰉基因組DNA提取
3.1.4 達(dá)氏鰉新SSR引物的篩選
3.1.5 達(dá)氏鰉新SSR引物的克隆驗(yàn)證
3.1.6 PCR擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
3.1.7 跨種擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
3.2 結(jié)果
3.2.1 基因組DNA的提取
3.2.2 SSR引物篩選
3.2.3 SSR引物克隆驗(yàn)證
3.2.4 PCR擴(kuò)增及分析
3.2.5 跨種擴(kuò)增及分析
3.3 討論
第四章 養(yǎng)殖西伯利亞鱘微衛(wèi)星引物驗(yàn)證及遺傳多樣性分析
4.1 材料和方法
4.1.1 試驗(yàn)材料
4.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
4.1.3 西伯利亞鱘基因組DNA提取
4.1.4 西伯利亞鱘新SSR引物的篩選及多重PCR建立
4.1.5 西伯利亞鱘新SSR引物的驗(yàn)證
4.1.6 PCR擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
4.1.7 跨種擴(kuò)增及遺傳多樣性分析
4.2 結(jié)果
4.2.1 基因組DNA的提取
4.2.2 SSR引物的篩選
4.2.3 SSR引物的克隆驗(yàn)證
4.2.4 PCR擴(kuò)增及分析
4.2.5 PCR跨種擴(kuò)增及分析
4.3 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號(hào):3784098
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