基于線粒體基因組的東方鲀屬系統(tǒng)發(fā)育學及群體遺傳學
發(fā)布時間:2023-03-30 00:22
為了探究東方鲀屬內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育關系,本研究首次基于群體尺度對東方鲀屬物種進行系統(tǒng)發(fā)育分析。利用線粒體基因組,在包含10個種的124尾東方鲀中,挖掘了1 488個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點和4個插入缺失(INDEL),使用這些遺傳變異位點進行了系統(tǒng)發(fā)育及群體遺傳學分析。發(fā)現(xiàn)網(wǎng)紋東方鲀與鉛點東方鲀可能是同種異名,且二者形成的姊妹群位于東方鲀屬基部;暗紋東方鲀與紅鰭東方鲀、菊黃東方鲀與雙斑東方鲀各自親緣關系較近。此外,實驗發(fā)現(xiàn)了4尾可疑的雙斑東方鲀和菊黃東方鲀雜交個體,以及2尾可疑的橫紋東方鲀雜交個體。遺傳多樣性方面,弓斑東方鲀遺傳多樣性最低。此外,實驗在10種東方鲀中共找到595個種間特異性SNP位點。Ka/Ks分析表明,nd6基因的Ka/Ks最高(平均為1.19),說明在東方鲀屬中nd6可能經(jīng)歷了正選擇,而ATP合成酶基因可能在東方鲀適應淡水環(huán)境中受到選擇。研究表明,東方鲀屬內(nèi)系統(tǒng)發(fā)育關系較為復雜,且在野生環(huán)境下東方鲀物種間廣泛存在自然雜交現(xiàn)象,該研究為東方鲀物種快速鑒定提供可靠的分子標記,加速東方鲀屬系統(tǒng)發(fā)育研究進展,并為東方鲀野生種質(zhì)資源保護提供了理論依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:12 頁
本文編號:3774799
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