四川地區(qū)1株虹鱒(Oncorhynchus mykiss)源傳染性造血器官壞死病毒的分離鑒定
發(fā)布時間:2023-03-24 18:30
2013年,四川成都彭州某冷水魚養(yǎng)殖場虹鱒暴發(fā)一種流行性傳染病,具有發(fā)病率和死亡率高的特點(幼魚和魚苗死亡率分別高達40%和80%)。對送檢樣品進行剖解和組織病理學觀察。典型表觀臨床癥狀表現(xiàn)為體色發(fā)黑,腹部膨大,體表多處出現(xiàn)瘀點,病程長的病魚肛門到尾鰭基部大面積出血,吻部潰爛、出血,部分病魚眼眶充血,肛門處流出淡黃色粘液便。剖解后可見膘膜、腹膜、心包膜、腦膜、脂肪組織嚴重點狀出血,肝臟發(fā)白,脾臟發(fā)黑腫大,腎臟腫大、淤血,部分病魚可見心臟出血點,胃脹氣膨大,腸道呈明顯的出血性-卡他性炎,腸壁變薄,剖開胃和腸道可見透明淡黃色粘液。組織病理學觀察發(fā)現(xiàn)頭腎、腎、腸道、脾和肝臟等器官的損傷非常顯著。典型病理變化表現(xiàn)為頭腎實質(zhì)大面積變性、壞死:腎小管上皮細胞變性、壞死、脫落,間質(zhì)造血組織壞死:腸道腸粘膜上皮細胞變性、壞死、脫落,粘膜下層聚集大量壞死的嗜酸性顆粒細胞;脾廣泛變性、壞死,巨噬細胞侵潤,肝細胞變性,壞死形成局灶性的壞死灶,并在肝細胞胞漿發(fā)現(xiàn)包涵體。其臨床癥狀和典型的病理組織損傷與傳染性造血器官壞死病毒(infectious hematopoietic necrosis virus, IH...
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 IHNV概述
1.1.0 IHNV的分布與危害
1.1.1 IHNV分類地位與生物學特征
1.1.2 IHNV基因組及編碼的蛋白質(zhì)特征
1.1.3 IHNV基因分型
1.1.4 IHNV流行特點
1.1.5 IHNV感染的癥狀與病理學變化
1.1.6 IHNV的診斷與防治
1.2 虹鱒病害研究概況
1.2.1 虹鱒養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2.2 虹鱒病毒性疾病
2 材料
2.1 實驗動物
2.2 實驗材料
2.3 主要試劑配制方法
3 方法
3.1 病原檢測
3.1.1 寄生蟲學檢查
3.1.2 細菌學檢查
3.1.3 病毒學檢查
3.2 自然感染虹鱒的病理組織學檢查
3.2.1 取材
3.2.2 石蠟切片制備
3.2.3 HE染色和讀片
3.3 傳染性造血器官壞死病毒的分離及鑒定
3.3.1 組織懸液的制備
3.3.2 鯉魚上皮瘤細胞傳代培養(yǎng)
3.3.3 組織懸液接種到EPC細胞單層
3.3.4 病毒液RT-PCR鑒定
3.4 回歸試驗
3.5 IHNV糖蛋與核蛋白基因的克隆及系統(tǒng)進化分析
3.5.1 引物設計及合成
3.5.2 RT-PCR擴增糖蛋白和核蛋白基因
3.5.3 擴增產(chǎn)物的克隆與序列測定
3.5.4 基因序列測定
3.5.5 糖蛋白基因系統(tǒng)進化分析和同源性比較
3.6 核蛋白基因生物信息學分析
4 結(jié)果
4.1 病原檢測
4.1.1 寄生蟲學檢查
4.1.2 細菌學檢查
4.1.3 病毒學檢查
4.2 自然感染虹鱒的病理組織學檢查
4.2.1 臨床癥狀觀察
4.2.2 組織病理學觀察
4.3 病毒的分離及鑒定結(jié)果
4.3.1 病毒的分離
4.3.2 病毒液RT-PCR檢測結(jié)果
4.4 回歸試驗
4.5 IHNV主要功能基因的克隆及系統(tǒng)發(fā)育分析
4.5.1 G和N基因的擴增、T-克隆與鑒定
4.5.2 “Mid-G”基因的系統(tǒng)發(fā)育和同源性分析
4.6 核衣殼蛋白基因生物信息學分析
4.6.1 氨基酸序列理化特性分析
4.6.2 保守結(jié)構(gòu)域分析
4.6.3 信號肽分析
4.6.4 跨膜區(qū)域分析
4.6.5 疏水性分析
4.6.6 抗原表位分析
4.6.7 糖基化及磷酸化位點的預測
4.6.8 系統(tǒng)發(fā)育和同源性分析
5 討論
5.1 IHNV的診斷
5.2 IHNV感染的病理損傷
5.3 IHNV的系統(tǒng)發(fā)育分析
5.4 IHNV N蛋白基因生物信息學分析
6 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術(shù)論文
本文編號:3769627
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
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中文摘要
ABSTRACT
1 文獻綜述
1.1 IHNV概述
1.1.0 IHNV的分布與危害
1.1.1 IHNV分類地位與生物學特征
1.1.2 IHNV基因組及編碼的蛋白質(zhì)特征
1.1.3 IHNV基因分型
1.1.4 IHNV流行特點
1.1.5 IHNV感染的癥狀與病理學變化
1.1.6 IHNV的診斷與防治
1.2 虹鱒病害研究概況
1.2.1 虹鱒養(yǎng)殖現(xiàn)狀
1.2.2 虹鱒病毒性疾病
2 材料
2.1 實驗動物
2.2 實驗材料
2.3 主要試劑配制方法
3 方法
3.1 病原檢測
3.1.1 寄生蟲學檢查
3.1.2 細菌學檢查
3.1.3 病毒學檢查
3.2 自然感染虹鱒的病理組織學檢查
3.2.1 取材
3.2.2 石蠟切片制備
3.2.3 HE染色和讀片
3.3 傳染性造血器官壞死病毒的分離及鑒定
3.3.1 組織懸液的制備
3.3.2 鯉魚上皮瘤細胞傳代培養(yǎng)
3.3.3 組織懸液接種到EPC細胞單層
3.3.4 病毒液RT-PCR鑒定
3.4 回歸試驗
3.5 IHNV糖蛋與核蛋白基因的克隆及系統(tǒng)進化分析
3.5.1 引物設計及合成
3.5.2 RT-PCR擴增糖蛋白和核蛋白基因
3.5.3 擴增產(chǎn)物的克隆與序列測定
3.5.4 基因序列測定
3.5.5 糖蛋白基因系統(tǒng)進化分析和同源性比較
3.6 核蛋白基因生物信息學分析
4 結(jié)果
4.1 病原檢測
4.1.1 寄生蟲學檢查
4.1.2 細菌學檢查
4.1.3 病毒學檢查
4.2 自然感染虹鱒的病理組織學檢查
4.2.1 臨床癥狀觀察
4.2.2 組織病理學觀察
4.3 病毒的分離及鑒定結(jié)果
4.3.1 病毒的分離
4.3.2 病毒液RT-PCR檢測結(jié)果
4.4 回歸試驗
4.5 IHNV主要功能基因的克隆及系統(tǒng)發(fā)育分析
4.5.1 G和N基因的擴增、T-克隆與鑒定
4.5.2 “Mid-G”基因的系統(tǒng)發(fā)育和同源性分析
4.6 核衣殼蛋白基因生物信息學分析
4.6.1 氨基酸序列理化特性分析
4.6.2 保守結(jié)構(gòu)域分析
4.6.3 信號肽分析
4.6.4 跨膜區(qū)域分析
4.6.5 疏水性分析
4.6.6 抗原表位分析
4.6.7 糖基化及磷酸化位點的預測
4.6.8 系統(tǒng)發(fā)育和同源性分析
5 討論
5.1 IHNV的診斷
5.2 IHNV感染的病理損傷
5.3 IHNV的系統(tǒng)發(fā)育分析
5.4 IHNV N蛋白基因生物信息學分析
6 結(jié)論
參考文獻
致謝
作者攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術(shù)論文
本文編號:3769627
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