發(fā)布時(shí)間：2023-03-04 19:45

　　長(zhǎng)牡蠣(Crassostrea gigas),又稱太平洋牡蠣,分類學(xué)隸屬于軟體動(dòng)物門(Mollusca)、瓣鰓綱(Lanellibranchia)、珍珠目(Pterioida)、牡蠣科(Ostreidae)、巨蠣屬(Crassostrea),是一種廣溫、廣鹽的重要海水經(jīng)濟(jì)雙殼貝類,其作為潮間帶這一特殊環(huán)境的典型物種,被當(dāng)做海洋生物對(duì)潮間帶環(huán)境適應(yīng)性研究的模式生物。由于其獨(dú)特的生態(tài)價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值被廣泛養(yǎng)殖,是世界上最重要的海水養(yǎng)殖物種。我國(guó)山東省是長(zhǎng)牡蠣的主養(yǎng)區(qū)之一,但是在最近幾年,經(jīng)常有報(bào)道長(zhǎng)牡蠣存在大規(guī)模死亡的現(xiàn)象,尤其在夏季海水溫度升高時(shí)死亡率達(dá)到最高,這在一定程度上困擾著長(zhǎng)牡蠣產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。有初步研究表明,導(dǎo)致大規(guī)模死亡這一現(xiàn)象發(fā)生可能主要是由于高溫脅迫、個(gè)體生理狀態(tài)以及病原微生物所導(dǎo)致,但是并沒(méi)有整體系統(tǒng)的研究。針對(duì)這一問(wèn)題,本研究對(duì)長(zhǎng)牡蠣的夏季大規(guī)模死亡展開(kāi)了系統(tǒng)的環(huán)境及生物學(xué)調(diào)查,并且通過(guò)轉(zhuǎn)錄組獲取脅迫響應(yīng)的基因集,對(duì)其分子機(jī)制進(jìn)行初步研究,結(jié)果如下:1.本研究對(duì)乳山長(zhǎng)牡蠣養(yǎng)殖區(qū)高溫季節(jié)水文條件(溫度、溶解氧、p H值、鹽度)指標(biāo)進(jìn)行了較為詳細(xì)的檢測(cè),統(tǒng)計(jì)了對(duì)應(yīng)各時(shí)間點(diǎn)養(yǎng)殖水...

【文章頁(yè)數(shù)】：91 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 牡蠣養(yǎng)殖現(xiàn)狀
    1.2 長(zhǎng)牡蠣度夏死亡問(wèn)題的相關(guān)研究
        1.2.1 長(zhǎng)牡蠣度夏死亡問(wèn)題概述
        1.2.2 長(zhǎng)牡蠣高溫脅迫研究現(xiàn)狀
        1.2.3 長(zhǎng)牡蠣病原體脅迫研究現(xiàn)狀
    1.3 轉(zhuǎn)錄組及雙殼貝類轉(zhuǎn)錄組研究進(jìn)展
    1.4 本研究目的及意義
        1.4.1 本研究目的
        1.4.2 本研究意義
第二章 長(zhǎng)牡蠣養(yǎng)殖環(huán)境以及抗性相關(guān)基因的季節(jié)性差異
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 主要儀器和試劑
        2.2.2 長(zhǎng)牡蠣樣品來(lái)源及環(huán)境數(shù)據(jù)監(jiān)測(cè)
        2.2.3 RNA提取和樣品混合
        2.2.4 RNA反轉(zhuǎn)錄
        2.2.5 實(shí)驗(yàn)用基因及引物信息
        2.2.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)
        2.2.7 長(zhǎng)牡蠣生存地點(diǎn)環(huán)境參數(shù)的統(tǒng)計(jì)及樣品肥滿度的差異
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 RNA提取結(jié)果
        2.3.2 目的基因在各月的表達(dá)結(jié)果
        2.3.3 環(huán)境參數(shù)檢測(cè)結(jié)果
        2.3.4 各取樣點(diǎn)藻類分析
        2.3.5 不同取樣點(diǎn)長(zhǎng)牡蠣在各月份的表型數(shù)據(jù)
    2.4 討論
        2.4.1 西黃島水環(huán)境指標(biāo)
        2.4.2 抗性基因的表達(dá)
    2.5 小結(jié)
第三章 長(zhǎng)牡蠣產(chǎn)卵前后的表型差異
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 樣品采集與處理
        3.2.2 人工催熟獲得產(chǎn)卵后群體
        3.2.3 群體數(shù)據(jù)測(cè)定
        3.2.4 糖原含量測(cè)定
        3.2.5 條件指數(shù)測(cè)定
        3.2.6 呼吸率測(cè)定
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 長(zhǎng)牡蠣群體數(shù)據(jù)結(jié)果
        3.3.2 糖原含量
        3.3.3 條件指數(shù)
        3.3.4 呼吸率
    3.4 討論
        3.4.1 表觀測(cè)量
        3.4.2 生理指標(biāo)分析
    3.5 小結(jié)
第四章 長(zhǎng)牡蠣產(chǎn)卵前后熱激脅迫下的轉(zhuǎn)錄組分析
    4.1 引言
    4.2 材料與方法
        4.2.1 樣品處理
        4.2.2 總RNA提取
        4.2.5 轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)的制備
        4.2.6 測(cè)序數(shù)據(jù)的獲得與過(guò)濾
        4.2.7 測(cè)序結(jié)果與參考基因組序列比對(duì)
        4.2.8 差異基因的獲取及相關(guān)分析
    4.3 結(jié)果與分析
        4.3.1 總RNA提取
        4.3.2 RNA-Seq測(cè)序結(jié)果
        4.3.3 差異表達(dá)基因篩選結(jié)果
        4.3.4 轉(zhuǎn)錄組基本統(tǒng)計(jì)分析
    4.4 討論
        4.4.1 差異基因篩選
        4.4.2 富集分析
    4.5 小結(jié)
第五章 長(zhǎng)牡蠣產(chǎn)卵前后溶藻弧菌感染后的轉(zhuǎn)錄組分析
    5.1 引言
    5.2 材料與方法
        5.2.1 長(zhǎng)牡蠣開(kāi)孔
        5.2.2 菌株的獲得以及濃度的確定
    5.3 結(jié)果與分析
        5.3.1 總RNA提取
        5.3.2 RNA-Seq測(cè)序結(jié)果
        5.3.3 差異表達(dá)基因篩選結(jié)果
        5.3.4 轉(zhuǎn)錄組基本統(tǒng)計(jì)分析
    5.4 討論
        5.4.1 差異基因篩選
        5.4.2 富集分析
    5.5 小結(jié)
第六章 總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況



本文編號(hào)：3754888