轉(zhuǎn)錄組測序可在各種環(huán)境條件下對物種進(jìn)行高通量測序,通過基因結(jié)構(gòu)分析和功能注釋,探討特定條件下相關(guān)基因的功能和表達(dá)情況。該研究分別獲取低鹽脅迫組（鹽度0.2）和自然海水組（鹽度31）脊尾白蝦（Exopalaemon carinicauda）樣品,通過Illumina平臺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,獲得13.92 Gb高質(zhì)量測序數(shù)據(jù),組裝得到111 618條轉(zhuǎn)錄本和72 734條Unigenes,其中有22 879條Unigenes得到注釋,比對到Nr數(shù)據(jù)庫的Unigenes為21 931條;篩選出1 492條脊尾白蝦低鹽脅迫差異顯著表達(dá)基因,包括829條上調(diào)基因和663條下調(diào)基因,其中有810條差異表達(dá)基因得到注釋。通過差異表達(dá)基因GO功能注釋和富集分析及KEGG通路富集分析,鎖定大量脊尾白蝦在自然海水和淡水環(huán)境下的差異表達(dá)基因,為深入探討脊尾白蝦在低鹽脅迫條件下的生理保護(hù)機(jī)制提供了技術(shù)支撐。 

【文章頁數(shù)】：14 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]低鹽度脅迫對羅氏沼蝦生長和肉質(zhì)的影響[D]. 何竺柳.浙江海洋大學(xué) 2018
[2]膳食多酚抑制α-葡糖苷酶活性的構(gòu)效關(guān)系研究[D]. 陳天晴.上海師范大學(xué) 2018
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[4]飼料中添加抗生素對半滑舌鰨腸道酶組織化學(xué)、腸道轉(zhuǎn)錄組及菌群結(jié)構(gòu)的影響[D]. 王一澤.天津農(nóng)學(xué)院 2017
[5]日本沼蝦抗氨氮脅迫轉(zhuǎn)錄組與代謝組分析[D]. 孫健.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[6]胰蛋白酶對刺參體壁膠原超分子結(jié)構(gòu)的降解作用研究[D]. 妥豐艷.大連工業(yè)大學(xué) 2016
[7]脊尾白蝦近交系遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[D]. 王日芳.上海海洋大學(xué) 2016
[8]黃姑魚微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用[D]. 龔詩琦.集美大學(xué) 2016
[9]干露脅迫對脊尾白蝦呼吸代謝相關(guān)酶和低氧誘導(dǎo)因子的影響[D]. 連春盎.上海海洋大學(xué) 2016
[10]脊尾白蝦幾丁質(zhì)酶的分離、特征及功能分析[D]. 王婧.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2015



本文編號：3717770