大菱鲆早期性別分化及性別相關SNP位點篩選研究
發(fā)布時間:2022-12-04 01:10
本研究利用石蠟組織切片法結合性腺外形差異判別,實現(xiàn)了大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)4月齡幼魚的早期性別鑒別。利用此方法,對2013年構建的大菱鲆37個良種選育家系,共計4022尾4月齡的幼魚進行了家系水平及群體水平的性別比例研究。隨機挑選其中的20個家系,共計2254尾幼魚進行了體重數(shù)據(jù)采集,利用SPSS17.0軟件對大菱鲆4月齡幼魚雌雄個體體重差異進行了統(tǒng)計分析。 從前期完成的大菱鲆性別特異性差異454轉錄組測序結果中,挑選524個預測SNP(Single Nucleotide Polymorphysim,單核苷酸多態(tài)性)位點,利用MassArray(MALDI-TOF MS Array,飛行質譜芯片)高通量SNP基因分型技術,以20個8月齡大菱鲆雌雄樣本為材料,完成了398個454高通量轉錄組候選性別相關SNPs位點的篩選及分析驗證。利用直接測序法對分布于6個contigs上的7組共35個SNPs位點進行了多態(tài)性驗證及單倍型研究。結果如下: 1.解剖觀察發(fā)現(xiàn),4月齡大菱鲆幼魚性腺位于后部膀胱與外側體壁之間,雌性性腺呈短棒狀,雄性性腺呈細長線狀,...
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆養(yǎng)殖現(xiàn)狀
2. 魚類性別決定相關分子標記及基因的研究進展
2.1 RAPD 技術在魚類性別研究中的應用
2.2 AFLP 技術在魚類性別鑒定中的應用
2.3 SSR 技術在魚類性別決定研究中的應用
3. 單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)分子標記的檢測方法
3.1 SNP 簡介
3.2 SNP 的檢測方法
4. SNP 在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應用
4.1 構建高密度遺傳連鎖圖譜
4.2 性狀關聯(lián)分析
4.3 種群進化和親緣關系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月齡幼魚性別鑒定研究
1 材料與方法
1.1 實驗魚來源及培育
1.2 實驗儀器
1.3 實驗藥品
1.4 方法
2 結果與分析
2.1 4 月齡大菱鲆幼魚性別鑒別
2.2 大菱鲆幼魚性腺外部形態(tài)變化
3 討論
第三章 大菱四月齡幼魚性比及雌雄體重差異分析
1 材料與方法
1.1 實驗魚及其培育方法
1.2 數(shù)據(jù)采集及分析
2 結果
2.1 4 月齡雌雄幼魚的性別比例及χ_。~2測驗
2.2 雌雄個體體重值差異分析
2.3 家系內(nèi)雌雄個體平均體重差異分析
3 討論
第四章 大菱鲆性別相關 SNP 位點的初步篩選
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
2 結果與分析
2.1 基因組 DNA 質量檢測及濃度測定
2.2 引物設計及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位點多態(tài)性分析
2.4 SNP 篩選結果
3 討論
3.1 多態(tài)性 SNP 位點的開發(fā)
3.2 SNP 位點篩選及分析
第五章 大菱鲆轉錄組 454 測序部分預測 SNP 位點驗證分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結果
2.1 基因組 DNA 的質量及濃度測定
2.2 SNP 位點篩選
2.3 PCR 擴增產(chǎn)物測序檢測單倍型
2.4 單倍型與性別的關聯(lián)分析
3 討論
參考文獻
附錄
碩士在讀期間發(fā)表文章
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國大菱鲆養(yǎng)殖20年成就和展望——慶祝大菱鲆引進中國20周年[J]. 雷霽霖,劉新富,關長濤. 漁業(yè)科學進展. 2012(04)
[2]醋酸洋紅染色技術在大菱鲆幼魚生理性別鑒定中的應用[J]. 韓偉國,劉新富,孟振,溫海深,雷霽霖. 漁業(yè)科學進展. 2011(06)
[3]鱖脂蛋白脂酶基因SNP及其與食性馴化相關性分析[J]. 楊宇暉,梁旭方,方榮,彭敏燕,黃志東. 遺傳. 2011(09)
[4]后基因組時代下作物的SNP分型方法[J]. 趙瓊一,李信,周德貴,何飛,周少川,羅達. 分子植物育種. 2010(01)
[5]雌核發(fā)育與正常二倍體條斑星鰈胚胎發(fā)育比較研究[J]. 李忠紅,劉海金,張世奎,姜秀鳳,王玉芬. 水產(chǎn)科學. 2009(12)
[6]變性梯度凝膠電泳檢測鮑曼不動桿菌中SHV基因單核苷酸多態(tài)性[J]. 張哲,許德義,蔣曉飛. 現(xiàn)代實用醫(yī)學. 2009(08)
[7]運用TaqMan探針實時熒光PCR技術檢測AKAP10基因2073A/G單核苷酸多態(tài)性[J]. 王默進,周總光,王玲,李園,張鵬,張益,崔長富,周斌. 四川大學學報(醫(yī)學版). 2009(02)
[8]大口黑鱸MyoD基因結構和單核苷酸多態(tài)性位點的篩選[J]. 于凌云,白俊杰,葉星,李勝杰,李小慧. 水產(chǎn)學報. 2009(01)
[9]大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼魚生長性狀的遺傳力及其相關性分析[J]. 馬愛軍,王新安,楊志,曲江波,雷霽霖. 海洋與湖沼. 2008(05)
[10]尼羅羅非魚Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 楊東,劉紅艷,張繁榮,余來寧. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2008(09)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)EST-SNP的開發(fā)及其應用[D]. 李紀勤.中國海洋大學 2012
碩士論文
[1]“黃海2號”中國對蝦高通量SNP篩選及其與抗WSSV性狀的關聯(lián)分析[D]. 逄錦菲.上海海洋大學 2013
[2]大菱鲆幼魚生長和耐高溫性狀的遺傳參數(shù)估計與家系篩選[D]. 劉寶鎖.上海海洋大學 2012
[3]大菱鲆性腺分化組織學和早期性別快速鑒定技術的研究[D]. 韓偉國.中國海洋大學 2011
[4]長牡蠣SNP標記的開發(fā)及多態(tài)性檢測[D]. 王紹宗.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]英國和西班牙進口大菱鲆雜交子一代的雜種優(yōu)勢分析[D]. 季士治.中國海洋大學 2006
本文編號:3707323
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆養(yǎng)殖現(xiàn)狀
2. 魚類性別決定相關分子標記及基因的研究進展
2.1 RAPD 技術在魚類性別研究中的應用
2.2 AFLP 技術在魚類性別鑒定中的應用
2.3 SSR 技術在魚類性別決定研究中的應用
3. 單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)分子標記的檢測方法
3.1 SNP 簡介
3.2 SNP 的檢測方法
4. SNP 在水產(chǎn)動物遺傳育種中的應用
4.1 構建高密度遺傳連鎖圖譜
4.2 性狀關聯(lián)分析
4.3 種群進化和親緣關系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月齡幼魚性別鑒定研究
1 材料與方法
1.1 實驗魚來源及培育
1.2 實驗儀器
1.3 實驗藥品
1.4 方法
2 結果與分析
2.1 4 月齡大菱鲆幼魚性別鑒別
2.2 大菱鲆幼魚性腺外部形態(tài)變化
3 討論
第三章 大菱四月齡幼魚性比及雌雄體重差異分析
1 材料與方法
1.1 實驗魚及其培育方法
1.2 數(shù)據(jù)采集及分析
2 結果
2.1 4 月齡雌雄幼魚的性別比例及χ_。~2測驗
2.2 雌雄個體體重值差異分析
2.3 家系內(nèi)雌雄個體平均體重差異分析
3 討論
第四章 大菱鲆性別相關 SNP 位點的初步篩選
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 實驗方法
2 結果與分析
2.1 基因組 DNA 質量檢測及濃度測定
2.2 引物設計及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位點多態(tài)性分析
2.4 SNP 篩選結果
3 討論
3.1 多態(tài)性 SNP 位點的開發(fā)
3.2 SNP 位點篩選及分析
第五章 大菱鲆轉錄組 454 測序部分預測 SNP 位點驗證分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結果
2.1 基因組 DNA 的質量及濃度測定
2.2 SNP 位點篩選
2.3 PCR 擴增產(chǎn)物測序檢測單倍型
2.4 單倍型與性別的關聯(lián)分析
3 討論
參考文獻
附錄
碩士在讀期間發(fā)表文章
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中國大菱鲆養(yǎng)殖20年成就和展望——慶祝大菱鲆引進中國20周年[J]. 雷霽霖,劉新富,關長濤. 漁業(yè)科學進展. 2012(04)
[2]醋酸洋紅染色技術在大菱鲆幼魚生理性別鑒定中的應用[J]. 韓偉國,劉新富,孟振,溫海深,雷霽霖. 漁業(yè)科學進展. 2011(06)
[3]鱖脂蛋白脂酶基因SNP及其與食性馴化相關性分析[J]. 楊宇暉,梁旭方,方榮,彭敏燕,黃志東. 遺傳. 2011(09)
[4]后基因組時代下作物的SNP分型方法[J]. 趙瓊一,李信,周德貴,何飛,周少川,羅達. 分子植物育種. 2010(01)
[5]雌核發(fā)育與正常二倍體條斑星鰈胚胎發(fā)育比較研究[J]. 李忠紅,劉海金,張世奎,姜秀鳳,王玉芬. 水產(chǎn)科學. 2009(12)
[6]變性梯度凝膠電泳檢測鮑曼不動桿菌中SHV基因單核苷酸多態(tài)性[J]. 張哲,許德義,蔣曉飛. 現(xiàn)代實用醫(yī)學. 2009(08)
[7]運用TaqMan探針實時熒光PCR技術檢測AKAP10基因2073A/G單核苷酸多態(tài)性[J]. 王默進,周總光,王玲,李園,張鵬,張益,崔長富,周斌. 四川大學學報(醫(yī)學版). 2009(02)
[8]大口黑鱸MyoD基因結構和單核苷酸多態(tài)性位點的篩選[J]. 于凌云,白俊杰,葉星,李勝杰,李小慧. 水產(chǎn)學報. 2009(01)
[9]大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼魚生長性狀的遺傳力及其相關性分析[J]. 馬愛軍,王新安,楊志,曲江波,雷霽霖. 海洋與湖沼. 2008(05)
[10]尼羅羅非魚Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 楊東,劉紅艷,張繁榮,余來寧. 江西農(nóng)業(yè)學報. 2008(09)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)EST-SNP的開發(fā)及其應用[D]. 李紀勤.中國海洋大學 2012
碩士論文
[1]“黃海2號”中國對蝦高通量SNP篩選及其與抗WSSV性狀的關聯(lián)分析[D]. 逄錦菲.上海海洋大學 2013
[2]大菱鲆幼魚生長和耐高溫性狀的遺傳參數(shù)估計與家系篩選[D]. 劉寶鎖.上海海洋大學 2012
[3]大菱鲆性腺分化組織學和早期性別快速鑒定技術的研究[D]. 韓偉國.中國海洋大學 2011
[4]長牡蠣SNP標記的開發(fā)及多態(tài)性檢測[D]. 王紹宗.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]英國和西班牙進口大菱鲆雜交子一代的雜種優(yōu)勢分析[D]. 季士治.中國海洋大學 2006
本文編號:3707323
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3707323.html
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