大菱鲆早期性別分化及性別相關(guān)SNP位點(diǎn)篩選研究
發(fā)布時(shí)間:2022-12-04 01:10
本研究利用石蠟組織切片法結(jié)合性腺外形差異判別,實(shí)現(xiàn)了大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)4月齡幼魚(yú)的早期性別鑒別。利用此方法,對(duì)2013年構(gòu)建的大菱鲆37個(gè)良種選育家系,共計(jì)4022尾4月齡的幼魚(yú)進(jìn)行了家系水平及群體水平的性別比例研究。隨機(jī)挑選其中的20個(gè)家系,共計(jì)2254尾幼魚(yú)進(jìn)行了體重?cái)?shù)據(jù)采集,利用SPSS17.0軟件對(duì)大菱鲆4月齡幼魚(yú)雌雄個(gè)體體重差異進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析。 從前期完成的大菱鲆性別特異性差異454轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中,挑選524個(gè)預(yù)測(cè)SNP(Single Nucleotide Polymorphysim,單核苷酸多態(tài)性)位點(diǎn),利用MassArray(MALDI-TOF MS Array,飛行質(zhì)譜芯片)高通量SNP基因分型技術(shù),以20個(gè)8月齡大菱鲆雌雄樣本為材料,完成了398個(gè)454高通量轉(zhuǎn)錄組候選性別相關(guān)SNPs位點(diǎn)的篩選及分析驗(yàn)證。利用直接測(cè)序法對(duì)分布于6個(gè)contigs上的7組共35個(gè)SNPs位點(diǎn)進(jìn)行了多態(tài)性驗(yàn)證及單倍型研究。結(jié)果如下: 1.解剖觀察發(fā)現(xiàn),4月齡大菱鲆幼魚(yú)性腺位于后部膀胱與外側(cè)體壁之間,雌性性腺呈短棒狀,雄性性腺呈細(xì)長(zhǎng)線狀,...
【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆養(yǎng)殖現(xiàn)狀
2. 魚(yú)類性別決定相關(guān)分子標(biāo)記及基因的研究進(jìn)展
2.1 RAPD 技術(shù)在魚(yú)類性別研究中的應(yīng)用
2.2 AFLP 技術(shù)在魚(yú)類性別鑒定中的應(yīng)用
2.3 SSR 技術(shù)在魚(yú)類性別決定研究中的應(yīng)用
3. 單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)分子標(biāo)記的檢測(cè)方法
3.1 SNP 簡(jiǎn)介
3.2 SNP 的檢測(cè)方法
4. SNP 在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
4.1 構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜
4.2 性狀關(guān)聯(lián)分析
4.3 種群進(jìn)化和親緣關(guān)系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月齡幼魚(yú)性別鑒定研究
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)來(lái)源及培育
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)藥品
1.4 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 4 月齡大菱鲆幼魚(yú)性別鑒別
2.2 大菱鲆幼魚(yú)性腺外部形態(tài)變化
3 討論
第三章 大菱四月齡幼魚(yú)性比及雌雄體重差異分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)及其培育方法
1.2 數(shù)據(jù)采集及分析
2 結(jié)果
2.1 4 月齡雌雄幼魚(yú)的性別比例及χ_。~2測(cè)驗(yàn)
2.2 雌雄個(gè)體體重值差異分析
2.3 家系內(nèi)雌雄個(gè)體平均體重差異分析
3 討論
第四章 大菱鲆性別相關(guān) SNP 位點(diǎn)的初步篩選
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組 DNA 質(zhì)量檢測(cè)及濃度測(cè)定
2.2 引物設(shè)計(jì)及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位點(diǎn)多態(tài)性分析
2.4 SNP 篩選結(jié)果
3 討論
3.1 多態(tài)性 SNP 位點(diǎn)的開(kāi)發(fā)
3.2 SNP 位點(diǎn)篩選及分析
第五章 大菱鲆轉(zhuǎn)錄組 454 測(cè)序部分預(yù)測(cè) SNP 位點(diǎn)驗(yàn)證分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 基因組 DNA 的質(zhì)量及濃度測(cè)定
2.2 SNP 位點(diǎn)篩選
2.3 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序檢測(cè)單倍型
2.4 單倍型與性別的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
碩士在讀期間發(fā)表文章
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)大菱鲆養(yǎng)殖20年成就和展望——慶祝大菱鲆引進(jìn)中國(guó)20周年[J]. 雷霽霖,劉新富,關(guān)長(zhǎng)濤. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2012(04)
[2]醋酸洋紅染色技術(shù)在大菱鲆幼魚(yú)生理性別鑒定中的應(yīng)用[J]. 韓偉國(guó),劉新富,孟振,溫海深,雷霽霖. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2011(06)
[3]鱖脂蛋白脂酶基因SNP及其與食性馴化相關(guān)性分析[J]. 楊宇暉,梁旭方,方榮,彭敏燕,黃志東. 遺傳. 2011(09)
[4]后基因組時(shí)代下作物的SNP分型方法[J]. 趙瓊一,李信,周德貴,何飛,周少川,羅達(dá). 分子植物育種. 2010(01)
[5]雌核發(fā)育與正常二倍體條斑星鰈胚胎發(fā)育比較研究[J]. 李忠紅,劉海金,張世奎,姜秀鳳,王玉芬. 水產(chǎn)科學(xué). 2009(12)
[6]變性梯度凝膠電泳檢測(cè)鮑曼不動(dòng)桿菌中SHV基因單核苷酸多態(tài)性[J]. 張哲,許德義,蔣曉飛. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2009(08)
[7]運(yùn)用TaqMan探針實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)檢測(cè)AKAP10基因2073A/G單核苷酸多態(tài)性[J]. 王默進(jìn),周總光,王玲,李園,張鵬,張益,崔長(zhǎng)富,周斌. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2009(02)
[8]大口黑鱸MyoD基因結(jié)構(gòu)和單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的篩選[J]. 于凌云,白俊杰,葉星,李勝杰,李小慧. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2009(01)
[9]大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼魚(yú)生長(zhǎng)性狀的遺傳力及其相關(guān)性分析[J]. 馬愛(ài)軍,王新安,楊志,曲江波,雷霽霖. 海洋與湖沼. 2008(05)
[10]尼羅羅非魚(yú)Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 楊東,劉紅艷,張繁榮,余來(lái)寧. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2008(09)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)EST-SNP的開(kāi)發(fā)及其應(yīng)用[D]. 李紀(jì)勤.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
碩士論文
[1]“黃海2號(hào)”中國(guó)對(duì)蝦高通量SNP篩選及其與抗WSSV性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 逄錦菲.上海海洋大學(xué) 2013
[2]大菱鲆幼魚(yú)生長(zhǎng)和耐高溫性狀的遺傳參數(shù)估計(jì)與家系篩選[D]. 劉寶鎖.上海海洋大學(xué) 2012
[3]大菱鲆性腺分化組織學(xué)和早期性別快速鑒定技術(shù)的研究[D]. 韓偉國(guó).中國(guó)海洋大學(xué) 2011
[4]長(zhǎng)牡蠣SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及多態(tài)性檢測(cè)[D]. 王紹宗.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]英國(guó)和西班牙進(jìn)口大菱鲆雜交子一代的雜種優(yōu)勢(shì)分析[D]. 季士治.中國(guó)海洋大學(xué) 2006
本文編號(hào):3707323
【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1. 大菱鲆養(yǎng)殖現(xiàn)狀
2. 魚(yú)類性別決定相關(guān)分子標(biāo)記及基因的研究進(jìn)展
2.1 RAPD 技術(shù)在魚(yú)類性別研究中的應(yīng)用
2.2 AFLP 技術(shù)在魚(yú)類性別鑒定中的應(yīng)用
2.3 SSR 技術(shù)在魚(yú)類性別決定研究中的應(yīng)用
3. 單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)分子標(biāo)記的檢測(cè)方法
3.1 SNP 簡(jiǎn)介
3.2 SNP 的檢測(cè)方法
4. SNP 在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
4.1 構(gòu)建高密度遺傳連鎖圖譜
4.2 性狀關(guān)聯(lián)分析
4.3 種群進(jìn)化和親緣關(guān)系的研究
5. 研究目的
第二章 大菱鲆 4 月齡幼魚(yú)性別鑒定研究
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)來(lái)源及培育
1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
1.3 實(shí)驗(yàn)藥品
1.4 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 4 月齡大菱鲆幼魚(yú)性別鑒別
2.2 大菱鲆幼魚(yú)性腺外部形態(tài)變化
3 討論
第三章 大菱四月齡幼魚(yú)性比及雌雄體重差異分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)魚(yú)及其培育方法
1.2 數(shù)據(jù)采集及分析
2 結(jié)果
2.1 4 月齡雌雄幼魚(yú)的性別比例及χ_。~2測(cè)驗(yàn)
2.2 雌雄個(gè)體體重值差異分析
2.3 家系內(nèi)雌雄個(gè)體平均體重差異分析
3 討論
第四章 大菱鲆性別相關(guān) SNP 位點(diǎn)的初步篩選
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組 DNA 質(zhì)量檢測(cè)及濃度測(cè)定
2.2 引物設(shè)計(jì)及 SNP 基因分型
2.3 SNP 位點(diǎn)多態(tài)性分析
2.4 SNP 篩選結(jié)果
3 討論
3.1 多態(tài)性 SNP 位點(diǎn)的開(kāi)發(fā)
3.2 SNP 位點(diǎn)篩選及分析
第五章 大菱鲆轉(zhuǎn)錄組 454 測(cè)序部分預(yù)測(cè) SNP 位點(diǎn)驗(yàn)證分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
2 結(jié)果
2.1 基因組 DNA 的質(zhì)量及濃度測(cè)定
2.2 SNP 位點(diǎn)篩選
2.3 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序檢測(cè)單倍型
2.4 單倍型與性別的關(guān)聯(lián)分析
3 討論
參考文獻(xiàn)
附錄
碩士在讀期間發(fā)表文章
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)大菱鲆養(yǎng)殖20年成就和展望——慶祝大菱鲆引進(jìn)中國(guó)20周年[J]. 雷霽霖,劉新富,關(guān)長(zhǎng)濤. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2012(04)
[2]醋酸洋紅染色技術(shù)在大菱鲆幼魚(yú)生理性別鑒定中的應(yīng)用[J]. 韓偉國(guó),劉新富,孟振,溫海深,雷霽霖. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2011(06)
[3]鱖脂蛋白脂酶基因SNP及其與食性馴化相關(guān)性分析[J]. 楊宇暉,梁旭方,方榮,彭敏燕,黃志東. 遺傳. 2011(09)
[4]后基因組時(shí)代下作物的SNP分型方法[J]. 趙瓊一,李信,周德貴,何飛,周少川,羅達(dá). 分子植物育種. 2010(01)
[5]雌核發(fā)育與正常二倍體條斑星鰈胚胎發(fā)育比較研究[J]. 李忠紅,劉海金,張世奎,姜秀鳳,王玉芬. 水產(chǎn)科學(xué). 2009(12)
[6]變性梯度凝膠電泳檢測(cè)鮑曼不動(dòng)桿菌中SHV基因單核苷酸多態(tài)性[J]. 張哲,許德義,蔣曉飛. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2009(08)
[7]運(yùn)用TaqMan探針實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)檢測(cè)AKAP10基因2073A/G單核苷酸多態(tài)性[J]. 王默進(jìn),周總光,王玲,李園,張鵬,張益,崔長(zhǎng)富,周斌. 四川大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2009(02)
[8]大口黑鱸MyoD基因結(jié)構(gòu)和單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的篩選[J]. 于凌云,白俊杰,葉星,李勝杰,李小慧. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2009(01)
[9]大菱鲆(Scophthalmus maximus)幼魚(yú)生長(zhǎng)性狀的遺傳力及其相關(guān)性分析[J]. 馬愛(ài)軍,王新安,楊志,曲江波,雷霽霖. 海洋與湖沼. 2008(05)
[10]尼羅羅非魚(yú)Sox基因PCR-SSCP分析[J]. 楊東,劉紅艷,張繁榮,余來(lái)寧. 江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2008(09)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)EST-SNP的開(kāi)發(fā)及其應(yīng)用[D]. 李紀(jì)勤.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
碩士論文
[1]“黃海2號(hào)”中國(guó)對(duì)蝦高通量SNP篩選及其與抗WSSV性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 逄錦菲.上海海洋大學(xué) 2013
[2]大菱鲆幼魚(yú)生長(zhǎng)和耐高溫性狀的遺傳參數(shù)估計(jì)與家系篩選[D]. 劉寶鎖.上海海洋大學(xué) 2012
[3]大菱鲆性腺分化組織學(xué)和早期性別快速鑒定技術(shù)的研究[D]. 韓偉國(guó).中國(guó)海洋大學(xué) 2011
[4]長(zhǎng)牡蠣SNP標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及多態(tài)性檢測(cè)[D]. 王紹宗.中國(guó)科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2009
[5]英國(guó)和西班牙進(jìn)口大菱鲆雜交子一代的雜種優(yōu)勢(shì)分析[D]. 季士治.中國(guó)海洋大學(xué) 2006
本文編號(hào):3707323
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3707323.html
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