發(fā)布時(shí)間：2022-09-29 15:25

　　長(zhǎng)江上游是我國(guó)天然的淡水魚類種質(zhì)資源基因庫(kù),共有魚類261種,其中特有魚類107種。在長(zhǎng)江上游特有魚類中,鯉形目種類最多,共93種,占特有魚類總數(shù)的86.92%,因而其在長(zhǎng)江上游特有魚類中具有非常重要的地位。在全球范圍內(nèi),鯉形目物種豐富,擁有6科321屬共約3,268種魚類,主要分布于東南亞。近幾十年來,水利工程興修、水環(huán)境污染及過度捕撈等人為因素使得我國(guó)淡水魚類資源受到嚴(yán)重威脅。同時(shí),魚類存在表型可塑性和遺傳變異性等特征,致使經(jīng)典分類學(xué)方法在魚類的物種鑒定中存在一定困難。因此快速地獲取魚類的基因信息,建立全面準(zhǔn)確的基因序列數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)其物種多樣性和遺傳多樣性保護(hù)至關(guān)重要。 DNA條形碼（DNA barcoding）是一種快速準(zhǔn)確的物種鑒定技術(shù),通過將某段基因的DNA序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行比對(duì),以此實(shí)現(xiàn)物種的快速鑒定,在生態(tài)、環(huán)境、食品安全、海關(guān)檢疫、疾病防控和生物多樣性保護(hù)等領(lǐng)域中得到了廣泛應(yīng)用。以往的DNA條形碼研究中,常采用CAOS （Characteristic attributes organization system）實(shí)現(xiàn)特征診斷位點(diǎn)（Nucleotide-dia... 

【文章頁(yè)數(shù)】：108 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 DNA條形碼研究綜述
        1.1.1 DNA條形碼的產(chǎn)生及發(fā)展
        1.1.2 DNA條形碼工作原理
        1.1.3 DNA條形碼標(biāo)記基因
        1.1.4 DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)
        1.1.5 DNA條形碼的研究方法
        1.1.6 DNA條形碼在生物分類中的應(yīng)用
        1.1.7 DNA條形碼的優(yōu)勢(shì)及爭(zhēng)議
    1.2 自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型
    1.3 長(zhǎng)江上游特有魚類概況
    1.4 本研究的目的及意義
第2章 長(zhǎng)江上游特有魚類DNA條形碼研究
    2.1 材料與方法
        2.1.1 長(zhǎng)江上游特有魚類名錄整理
        2.1.2 樣品采集
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)器材
        2.1.4 實(shí)驗(yàn)試劑
        2.1.5 基因組DNA提取
        2.1.6 PCR擴(kuò)增
    2.2 數(shù)據(jù)分析
        2.2.1 COI序列整理
        2.2.2 遺傳距離分析
        2.2.3 長(zhǎng)江上游特有魚類科級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)的SOM模型預(yù)測(cè)
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 COI序列特征
        2.3.2 遺傳距離分析
        2.3.3 鄰接聚類分析
        2.3.4 DNA條形碼間隙
        2.3.5 長(zhǎng)江上游特有魚類的科級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)
    2.4 討論
        2.4.1 DNA條形碼在長(zhǎng)江上游特有魚類物種鑒定中的有效性
        2.4.2 長(zhǎng)江上游特有魚類中遺傳分化異常的類群
        2.4.3 長(zhǎng)江上游特有魚類總體遺傳分化
        2.4.4 長(zhǎng)江上游特有魚類科級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)的SOM模型預(yù)測(cè)可行性
    2.5 結(jié)論
    附表
    附圖
第3章 鯉形目魚類DNA條形碼研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 序列收集
    3.2 數(shù)據(jù)分析
        3.2.1 COI序列整理
        3.2.2 遺傳距離分析
        3.2.3 各科遺傳距離比較分析
        3.2.4 鯉形目科屬種級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)的SOM模型預(yù)測(cè)
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 COI序列特征
        3.3.2 鯉形目魚類的遺傳距離
        3.3.3 鯉形目魚類的條形碼間隙
        3.3.4 鯉形目各科魚類的遺傳距離比較
        3.3.5 鯉形目魚類的科級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)
        3.3.6 鯉形目魚類的屬級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)
        3.3.7 鯉形目魚類的種級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)
    3.4 討論
        3.4.1 COI序列在鯉形目魚類DNA條形碼研究中的有效性
        3.4.2 鯉形目魚類的DNA條形碼遺傳分化
        3.4.3 鯉形目各科魚類的遺傳分化比較
        3.4.4 魚類科屬種級(jí)水平特征診斷位點(diǎn)的SOM模型預(yù)測(cè)可行性
    3.5 結(jié)論
    附表
    附圖
參考文獻(xiàn)
致謝
發(fā)表論文和參加科研項(xiàng)目


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]鯉科鲌屬藥用魚類線粒體COI基因的DNA條形碼研究[J]. 謝佳燕,李軍德,黃鈺淞.  中國(guó)中藥雜志. 2013(07)
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[3]沱江寬體沙鰍個(gè)體生殖力的研究[J]. 黃燕,岳興建,王芳,甘雷,謝碧文,王淯,齊澤民,葛正良.  四川動(dòng)物. 2011(06)
[4]廣西嶺鰍屬魚類一新種——羅城嶺鰍（鯉形目:爬鰍科）[J]. 楊劍,吳鐵軍,韋日鋒,楊君興.  動(dòng)物學(xué)研究. 2011(02)
[5]中華沙鰍的繁殖生物學(xué)研究[J]. 楊明生,丁夏.  水生態(tài)學(xué)雜志. 2010(02)
[6]暗紋東方鲀線粒體COI及其側(cè)翼tRNA基因的克隆與序列分析[J]. 邵愛華,朱江,陳葵,史全良,姚煒雯.  遺傳. 2006(08)
[7]瀘沽湖魚類區(qū)系現(xiàn)狀及人為影響成因的初步探討[J]. 孔德平,陳小勇,楊君興.  動(dòng)物學(xué)研究. 2006(01)
[8]中華鮡與前臀鮡的形態(tài)差異和物種有效性[J]. 姚景龍,陳毅峰,李堃,嚴(yán)云志.  動(dòng)物分類學(xué)報(bào). 2006(01)
[9]生物分類學(xué)的新動(dòng)向——DNA條形編碼[J]. 肖金花,肖暉,黃大衛(wèi).  動(dòng)物學(xué)報(bào). 2004(05)
[10]萼花臂尾輪蟲（Brachionus calyciflorus）COI基因序列變異及種群遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 董云偉,牛翠娟.  海洋與湖沼. 2004(05)

博士論文
[1]長(zhǎng)江珍稀及特有魚類保護(hù)生物學(xué)研究[D]. 高欣.中國(guó)科學(xué)院研究生院（水生生物研究所） 2007
[2]歐亞大陸鲇形目魚類系統(tǒng)發(fā)育與骨鰾下區(qū)魚類分化時(shí)間估計(jì)及其起源與演化過程研究[D]. 彭作剛.中國(guó)科學(xué)院研究生院（水生生物研究所） 2005

碩士論文
[1]狹義鲌亞科及其相關(guān)類群系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究及厚頜魴遺傳多樣性分析[D]. 王瑾瑾.西南大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3682837