草魚(Ctenopharyngodon idellus)Sp1的克隆及其表達(dá)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-09-27 20:05
轉(zhuǎn)錄因子Sp1(Specificity protein1)可調(diào)控多種基因的激活,參與多數(shù)細(xì)胞的生長(zhǎng)分化和細(xì)胞周期代謝,與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。本研究利用T-A和RACE技術(shù)從草魚(Ctenopharyngodon idellus)腸道克隆出Sp1cDNA全序列,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)了草魚不同組織、不同發(fā)育時(shí)期Sp1基因的表達(dá),并探討了在日糧中添加不同蛋白源、不同蛋白水平和谷氨酰胺二肽等營(yíng)養(yǎng)素對(duì)草魚Sp1基因表達(dá)的調(diào)控。 1、草魚Sp1cDNA克隆及生物信息學(xué)分析 草魚Sp1cDNA全長(zhǎng)為1914bp,包括1482bp的編碼區(qū)、5bp的5’UTR和426bp的3’UTR,共編碼493個(gè)氨基酸。等電點(diǎn)為8.27,主要的元素成分含量為C:2.23%,N:4.87%,H:2.43%,S:9.94%,T:11.16%。分子式為C2237H3600N662O738S20。氨基酸組成中,Thr(11.2%)和Gln(10.1%)含量相對(duì)較高。氨基酸序列的疏水性:MAX,2.93;MIN,-1.89。磷酸化位點(diǎn):Ser21個(gè),Thr7個(gè),Tyr2個(gè)。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明Sp1在進(jìn)化上比...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語中英文對(duì)照
第一章 引言
1.1 研究背景與意義
1.2 SP 家族
1.2.1 Sp 家族簡(jiǎn)介
1.2.2 Sp 家族基本結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn)
1.3 SP1 基因
1.3.1 Sp1 的結(jié)構(gòu)與功能特征
1.3.2 Sp1 表達(dá)及其功能的調(diào)控
1.3.3 Sp1 轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)節(jié)
1.3.4 Sp1 在腸道中的作用
1.4 論文創(chuàng)新點(diǎn)
第二章 草魚 SP1 基因克隆及生物信息學(xué)分析
2.1 材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 總 RNA 制備
2.2.2 Sp1 cDNA 中間核心片段克隆
2.2.3 Sp1 cDNA 3'端片段擴(kuò)增和克隆
2.2.4 Sp1 cDNA 5'端片段擴(kuò)增和克隆
2.2.5 Sp1 cDNA 全序列拼接
2.2.6 草魚 Sp1 全長(zhǎng)氨基酸序列和蛋白結(jié)構(gòu)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 腸道總 RNA 提取
2.3.2 Sp1 cDNA 克隆
2.3.3 Sp1 生物信息學(xué)分析
2.4 討論
第三章 草魚 SP1 的時(shí)空表達(dá)分析
3.1 材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及取材
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 Sp1 基因表達(dá)量的檢測(cè)
3.2.1 引物設(shè)計(jì)
3.2.2 總 RNA 提取
3.2.3 模板 cDNA 第一鏈合成
3.2.4 Sp1 基因表達(dá)檢測(cè)
3.3 數(shù)據(jù)處理
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 模板 cDNA 制備效果
3.4.2 Sp1 mRNA 表達(dá)分析
3.5 討論
第四章 外源蛋白對(duì)草魚腸道 SP1 基因表達(dá)的影響
4.1 材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
4.2 方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.2.2 引物設(shè)計(jì)
4.2.3 總 RNA 提取
4.2.4 cDNA 第一鏈合成
4.2.5 Sp1 基因表達(dá)量檢測(cè)
4.3 數(shù)據(jù)處理
4.4 結(jié)果分析
4.4.1 不同蛋白源對(duì)草魚腸道 Sp1 mRNA 表達(dá)的影響
4.4.2 不同蛋白水平對(duì)草魚腸道 Sp1 mRNA 表達(dá)的影響
4.5 討論
第五章 谷氨酰胺二肽對(duì)草魚腸道 SP1 基因表達(dá)的影響
5.1 材料
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
5.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
5.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
5.2 方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
5.2.2 引物設(shè)計(jì)
5.2.3 總 RNA 提取
5.2.4 cDNA 第一鏈合成
5.2.5 Sp1 基因表達(dá)檢測(cè)
5.3 數(shù)據(jù)處理
5.4 結(jié)果分析
5.4.1 不同劑量谷氨酰胺二肽對(duì)草魚腸道 Sp1mRNA 表達(dá)的影響
5.5 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間學(xué)術(shù)業(yè)績(jī)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]草魚營(yíng)養(yǎng)需求與配合飼料技術(shù)研究進(jìn)展(上)[J]. 葉金云,邵仙萍,馬恒甲,吳成龍,明建華,楊霞,張易祥. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2013(08)
[2]南方鲇(Silurus meridionalis)幼魚日糧中適宜常量營(yíng)養(yǎng)素(蛋白質(zhì)、脂肪和碳水化合物)需求量研究[J]. 馮健,彭淇,吳彬,陳斌,梁品恒. 海洋與湖沼. 2013(04)
[3]谷氨酰胺二肽生物學(xué)功能及在動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)中的應(yīng)用[J]. 鄭燕斌,董娜,單安山. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2011(08)
[4]不同溫度下不同蛋白水平對(duì)鏡鯉(Cyprinus carpio L.)非特異性免疫的影響[J]. 張桐,徐奇友,許紅,王常安,尹家勝. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(12)
[5]谷氨酰胺對(duì)新生仔豬生長(zhǎng)性能、血清激素水平及小腸黏膜酶活性的影響[J]. 蔣宗勇,鄭衛(wèi)川,林映才,鄭春田,黃琳,陳芳. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2010(01)
[6]丙氨酰-谷氨酰胺對(duì)哲羅魚仔魚生長(zhǎng)和抗氧化能力的影響[J]. 徐奇友,王常安,許紅,尹家勝,馬建章. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2009(06)
[7]丙氨酰-谷氨酰胺對(duì)德國(guó)鏡鯉幼魚(Cyprinus carpio L.)血清生化指標(biāo)及體組成的影響[J]. 朱青,徐奇友,王長(zhǎng)安,許紅,尹家勝. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2009(04)
[8]谷氨酰胺二肽對(duì)日本對(duì)蝦血清生化指標(biāo)、肝胰腺細(xì)胞凋亡及腸粘膜形態(tài)的影響[J]. 葉均安,王冰心,孫紅霞,李瑞麗,伊祥華,周奕毅,吳舊生,劉波靜. 海洋與湖沼. 2009(03)
[9]飼料蛋白水平對(duì)寶石鱸增重和胃腸道消化酶活性影響[J]. 邵慶均,蘇小鳳,許梓榮. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2004(05)
[10]飼料蛋白水平對(duì)鱖魚實(shí)驗(yàn)種群胃腸道消化酶活性的影響[J]. 趙東海. 河北漁業(yè). 2004(02)
本文編號(hào):3681535
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語中英文對(duì)照
第一章 引言
1.1 研究背景與意義
1.2 SP 家族
1.2.1 Sp 家族簡(jiǎn)介
1.2.2 Sp 家族基本結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn)
1.3 SP1 基因
1.3.1 Sp1 的結(jié)構(gòu)與功能特征
1.3.2 Sp1 表達(dá)及其功能的調(diào)控
1.3.3 Sp1 轉(zhuǎn)錄活性的調(diào)節(jié)
1.3.4 Sp1 在腸道中的作用
1.4 論文創(chuàng)新點(diǎn)
第二章 草魚 SP1 基因克隆及生物信息學(xué)分析
2.1 材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 總 RNA 制備
2.2.2 Sp1 cDNA 中間核心片段克隆
2.2.3 Sp1 cDNA 3'端片段擴(kuò)增和克隆
2.2.4 Sp1 cDNA 5'端片段擴(kuò)增和克隆
2.2.5 Sp1 cDNA 全序列拼接
2.2.6 草魚 Sp1 全長(zhǎng)氨基酸序列和蛋白結(jié)構(gòu)分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 腸道總 RNA 提取
2.3.2 Sp1 cDNA 克隆
2.3.3 Sp1 生物信息學(xué)分析
2.4 討論
第三章 草魚 SP1 的時(shí)空表達(dá)分析
3.1 材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物及取材
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2 Sp1 基因表達(dá)量的檢測(cè)
3.2.1 引物設(shè)計(jì)
3.2.2 總 RNA 提取
3.2.3 模板 cDNA 第一鏈合成
3.2.4 Sp1 基因表達(dá)檢測(cè)
3.3 數(shù)據(jù)處理
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 模板 cDNA 制備效果
3.4.2 Sp1 mRNA 表達(dá)分析
3.5 討論
第四章 外源蛋白對(duì)草魚腸道 SP1 基因表達(dá)的影響
4.1 材料
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
4.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
4.2 方法
4.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
4.2.2 引物設(shè)計(jì)
4.2.3 總 RNA 提取
4.2.4 cDNA 第一鏈合成
4.2.5 Sp1 基因表達(dá)量檢測(cè)
4.3 數(shù)據(jù)處理
4.4 結(jié)果分析
4.4.1 不同蛋白源對(duì)草魚腸道 Sp1 mRNA 表達(dá)的影響
4.4.2 不同蛋白水平對(duì)草魚腸道 Sp1 mRNA 表達(dá)的影響
4.5 討論
第五章 谷氨酰胺二肽對(duì)草魚腸道 SP1 基因表達(dá)的影響
5.1 材料
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
5.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
5.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
5.2 方法
5.2.1 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
5.2.2 引物設(shè)計(jì)
5.2.3 總 RNA 提取
5.2.4 cDNA 第一鏈合成
5.2.5 Sp1 基因表達(dá)檢測(cè)
5.3 數(shù)據(jù)處理
5.4 結(jié)果分析
5.4.1 不同劑量谷氨酰胺二肽對(duì)草魚腸道 Sp1mRNA 表達(dá)的影響
5.5 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間學(xué)術(shù)業(yè)績(jī)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]草魚營(yíng)養(yǎng)需求與配合飼料技術(shù)研究進(jìn)展(上)[J]. 葉金云,邵仙萍,馬恒甲,吳成龍,明建華,楊霞,張易祥. 科學(xué)養(yǎng)魚. 2013(08)
[2]南方鲇(Silurus meridionalis)幼魚日糧中適宜常量營(yíng)養(yǎng)素(蛋白質(zhì)、脂肪和碳水化合物)需求量研究[J]. 馮健,彭淇,吳彬,陳斌,梁品恒. 海洋與湖沼. 2013(04)
[3]谷氨酰胺二肽生物學(xué)功能及在動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)中的應(yīng)用[J]. 鄭燕斌,董娜,單安山. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2011(08)
[4]不同溫度下不同蛋白水平對(duì)鏡鯉(Cyprinus carpio L.)非特異性免疫的影響[J]. 張桐,徐奇友,許紅,王常安,尹家勝. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(12)
[5]谷氨酰胺對(duì)新生仔豬生長(zhǎng)性能、血清激素水平及小腸黏膜酶活性的影響[J]. 蔣宗勇,鄭衛(wèi)川,林映才,鄭春田,黃琳,陳芳. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2010(01)
[6]丙氨酰-谷氨酰胺對(duì)哲羅魚仔魚生長(zhǎng)和抗氧化能力的影響[J]. 徐奇友,王常安,許紅,尹家勝,馬建章. 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào). 2009(06)
[7]丙氨酰-谷氨酰胺對(duì)德國(guó)鏡鯉幼魚(Cyprinus carpio L.)血清生化指標(biāo)及體組成的影響[J]. 朱青,徐奇友,王長(zhǎng)安,許紅,尹家勝. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2009(04)
[8]谷氨酰胺二肽對(duì)日本對(duì)蝦血清生化指標(biāo)、肝胰腺細(xì)胞凋亡及腸粘膜形態(tài)的影響[J]. 葉均安,王冰心,孫紅霞,李瑞麗,伊祥華,周奕毅,吳舊生,劉波靜. 海洋與湖沼. 2009(03)
[9]飼料蛋白水平對(duì)寶石鱸增重和胃腸道消化酶活性影響[J]. 邵慶均,蘇小鳳,許梓榮. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版). 2004(05)
[10]飼料蛋白水平對(duì)鱖魚實(shí)驗(yàn)種群胃腸道消化酶活性的影響[J]. 趙東海. 河北漁業(yè). 2004(02)
本文編號(hào):3681535
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