半滑舌鰨性腺響應高溫刺激的基因表達分析
發(fā)布時間:2022-08-13 13:26
脊椎動物性別決定類型通?梢苑譃檫z傳性別決定(genetic sex determination,GSD)和環(huán)境性別決定(environmental sex determination,ESD)。在相對低等的脊椎動物中,性別決定受到環(huán)境的影響較大。一般而言,溫度是影響ESD物種性別決定的主要因素。盡管前期許多研究報道了溫度對性別決定的影響,但是ESD物種如何響應溫度的調(diào)控機制尚不清楚。半滑舌鰨(Cynoglossus semilaevis)屬于鰈形目(Pleuronectiformes)、舌鰨科(Cynoglossidae)、舌鰨屬(Cynoglossus),是我國重要的海水經(jīng)濟魚類。半滑舌鰨生長性狀具有明顯的性別二態(tài)性,其雌性個體大且生長速度是雄性的2-4倍。半滑舌鰨性染色體為ZZ/ZW,具有典型的遺傳性別決定(GSD)和環(huán)境性別決定(ESD)特征。研究發(fā)現(xiàn),在養(yǎng)殖群體中,大約14%的ZW遺傳雌性會逆轉(zhuǎn)為表型雄魚,即偽雄魚。在性別分化的關(guān)鍵時期,利用高溫(28°C)誘導,其性逆轉(zhuǎn)比例可達60%。由于性逆轉(zhuǎn)導致雌魚比例過低,嚴重影響了半滑舌鰨產(chǎn)業(yè)的規(guī);l(fā)展。魚類響應溫度變化的機制解析...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 魚類性別決定與分化機制及相關(guān)基因
1.1.1 魚類性別決定機制
1.1.2 魚類性別相關(guān)基因
1.2 溫度與激素對魚類性別決定與分化的調(diào)控作用
1.2.1 環(huán)境溫度
1.2.2 性類固醇激素
1.3 魚類響應外界環(huán)境變化的研究進展
1.3.1 熱休克蛋白(HSP)
1.3.2 皮質(zhì)醇
1.3.3 表觀調(diào)控因子
1.4 半滑舌鰨是研究溫度對性逆轉(zhuǎn)的理想模型
第二章 高溫脅迫半滑舌鰨性腺轉(zhuǎn)錄組比較分析
引言
2.1 樣品采集
2.1.1 樣品制備及高溫處理實驗
2.1.2 半滑舌鰨的DNA提取及性別鑒定
2.1.3 半滑舌鰨總RNA提取方法
2.1.4 半滑舌鰨RNA文庫構(gòu)建及測序
2.1.5 RNA-seq數(shù)據(jù)處理
2.1.6 樣本基因表達量計算及高溫與對照度差異表達基因鑒定
2.1.7 差異表達基因GO及 KEGG分析
2.1.8 通過熒光定量PCR驗證RNA-seq數(shù)據(jù)
2.2 實驗結(jié)果及分析
2.2.1 半滑舌鰨性別鑒定及性腺樣品制備
2.2.2 半滑舌鰨性腺RNA-seq數(shù)據(jù)分析
2.2.3 高溫脅迫處理后PCA分析及差異表達基因數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.2.4 高溫脅迫處理后的性別特異差異基因
2.2.5 性別特異基因的GO和 KEGG分析
2.2.6 高溫脅迫后三種性別共有的差異基因
2.2.7 熒光定量PCR驗證RNA-seq數(shù)據(jù)
2.3 討論
第三章 半滑舌鰨HSD11B1L和 HSD11B2 基因克隆及表達分析
引言
3.1 材料
3.1.1 樣品制備
3.1.2 DNA提取及性別鑒定
3.1.3 RNA提取
3.1.4 hsd11b1l和 hsd11b2 的全長克隆
3.1.5 基因的生物學分析
3.1.6 c DNA合成及熒光定量PCR
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 hsd11b1l和 hsd11b2 克隆和序列分析
3.2.2 多序列比對和系統(tǒng)進化樹分析
3.2.3 hsd11b1l和 hsd11b2 在半滑舌鰨組織中的表達模式
3.2.4 hsd11b1l和 hsd11b2 在性腺發(fā)育過程中的表達模式
3.2.5 在半滑舌鰨性別分化過程中高溫脅迫后hsd11b1l和 hsd11b2 表達的變化
3.3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻
科研成果
致謝
本文編號:3677118
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 引言
1.1 魚類性別決定與分化機制及相關(guān)基因
1.1.1 魚類性別決定機制
1.1.2 魚類性別相關(guān)基因
1.2 溫度與激素對魚類性別決定與分化的調(diào)控作用
1.2.1 環(huán)境溫度
1.2.2 性類固醇激素
1.3 魚類響應外界環(huán)境變化的研究進展
1.3.1 熱休克蛋白(HSP)
1.3.2 皮質(zhì)醇
1.3.3 表觀調(diào)控因子
1.4 半滑舌鰨是研究溫度對性逆轉(zhuǎn)的理想模型
第二章 高溫脅迫半滑舌鰨性腺轉(zhuǎn)錄組比較分析
引言
2.1 樣品采集
2.1.1 樣品制備及高溫處理實驗
2.1.2 半滑舌鰨的DNA提取及性別鑒定
2.1.3 半滑舌鰨總RNA提取方法
2.1.4 半滑舌鰨RNA文庫構(gòu)建及測序
2.1.5 RNA-seq數(shù)據(jù)處理
2.1.6 樣本基因表達量計算及高溫與對照度差異表達基因鑒定
2.1.7 差異表達基因GO及 KEGG分析
2.1.8 通過熒光定量PCR驗證RNA-seq數(shù)據(jù)
2.2 實驗結(jié)果及分析
2.2.1 半滑舌鰨性別鑒定及性腺樣品制備
2.2.2 半滑舌鰨性腺RNA-seq數(shù)據(jù)分析
2.2.3 高溫脅迫處理后PCA分析及差異表達基因數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2.2.4 高溫脅迫處理后的性別特異差異基因
2.2.5 性別特異基因的GO和 KEGG分析
2.2.6 高溫脅迫后三種性別共有的差異基因
2.2.7 熒光定量PCR驗證RNA-seq數(shù)據(jù)
2.3 討論
第三章 半滑舌鰨HSD11B1L和 HSD11B2 基因克隆及表達分析
引言
3.1 材料
3.1.1 樣品制備
3.1.2 DNA提取及性別鑒定
3.1.3 RNA提取
3.1.4 hsd11b1l和 hsd11b2 的全長克隆
3.1.5 基因的生物學分析
3.1.6 c DNA合成及熒光定量PCR
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 hsd11b1l和 hsd11b2 克隆和序列分析
3.2.2 多序列比對和系統(tǒng)進化樹分析
3.2.3 hsd11b1l和 hsd11b2 在半滑舌鰨組織中的表達模式
3.2.4 hsd11b1l和 hsd11b2 在性腺發(fā)育過程中的表達模式
3.2.5 在半滑舌鰨性別分化過程中高溫脅迫后hsd11b1l和 hsd11b2 表達的變化
3.3 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻
科研成果
致謝
本文編號:3677118
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