長(zhǎng)江水系大眼鱖的遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2022-07-11 12:00
大眼鱖(Siniperca kneri),隸屬鱸形目(Perciformes)、鮨科(Serranidae)、鱖亞科(Sinipercinae)。大眼鱖是東亞地區(qū)特有的名貴魚類,具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。但是,近年來,由于過度捕撈、人工放流、環(huán)境污染以及水壩的修建等因素的影響,野生大眼鱖的遺傳多樣性面臨下降的趨勢(shì)。本論文采用線粒體細(xì)胞色素(Cytochrome,Cytb)基因及控制區(qū)序列,對(duì)長(zhǎng)江水系大眼鱖的4個(gè)群體(赤水河群體—CS、南京群體—NJ、岳陽群體—YC、宜昌群體—YY)共計(jì)79尾個(gè)體進(jìn)行分析,探討其遺傳多樣性、遺傳分化、以及種群演化歷史,從而為有效、合理開發(fā)利用大眼鱖資源提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支撐。主要內(nèi)容如下:1.大眼鱖的遺傳多樣性研究:Cytb分析采用PCR擴(kuò)增、直接測(cè)序法,獲得4個(gè)大眼鱖群體共計(jì)79尾魚的Cytb基因全序列(長(zhǎng)度為1141bp),共檢測(cè)到26種單倍型。單倍型多樣性(Haplotype diversity,Hd)指數(shù)為 0.685(CS)-0.924(YY),核昔酸多樣性(nucleotide diversity,TT)指數(shù)為0.00176(CS)-0.00285(YC...
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 大眼鱖的生物學(xué)特性
1.1 形態(tài)特征
1.2 生活習(xí)性
1.3 繁殖習(xí)性
1.4 感官、攝食、消化器官
2 大眼鱖的人工養(yǎng)殖和經(jīng)濟(jì)價(jià)值
3 魚類多樣性研究
3.1 遺傳多樣性
3.2 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建
4 魚類線粒體DNA分子標(biāo)記
4.1 魚類線粒體基因組的特點(diǎn)
4.2 線粒體分子標(biāo)記在魚類遺傳學(xué)中的應(yīng)用
5 研究現(xiàn)狀
6 研究的目的和意義
第二章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:CYTB分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑和儀器
1.2 研究的樣本
1.3 DNA的提取
1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測(cè)序
1.5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的處理和分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總DNA的提取
2.2 Cytb基因序列特征
2.3 Cytb遺傳多樣性分析
2.3.1 單倍型分布
2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
2.4 Cytb的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.1 遺傳距離
2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
2.5 分子方差分析
2.6 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
2.6.1 中性檢驗(yàn)
2.6.2 歧點(diǎn)分布
3 討論
3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
3.3 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
第三章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:D-LOOP分析
1 材料與方法
1.1 所需實(shí)驗(yàn)材料
1.2 所需實(shí)驗(yàn)樣本
1.3 DNA的提取
1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測(cè)序
1.5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總DNA的提取
2.2 D-loop序列特征
2.3 D-loop遺傳多樣性分析
2.3.1 單倍型分布
2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
2.4 D-loop區(qū)的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.1 遺傳距離
2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
2.5 分子方差分析
2.6 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
2.6.1 中性檢驗(yàn)
2.6.2 核苷酸不配對(duì)分布圖
3 討論
3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
3.3 大眼鱖的遺傳多樣性保護(hù)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間參加的學(xué)術(shù)會(huì)議及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號(hào):3658125
【文章頁(yè)數(shù)】:68 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 大眼鱖的生物學(xué)特性
1.1 形態(tài)特征
1.2 生活習(xí)性
1.3 繁殖習(xí)性
1.4 感官、攝食、消化器官
2 大眼鱖的人工養(yǎng)殖和經(jīng)濟(jì)價(jià)值
3 魚類多樣性研究
3.1 遺傳多樣性
3.2 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建
4 魚類線粒體DNA分子標(biāo)記
4.1 魚類線粒體基因組的特點(diǎn)
4.2 線粒體分子標(biāo)記在魚類遺傳學(xué)中的應(yīng)用
5 研究現(xiàn)狀
6 研究的目的和意義
第二章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:CYTB分析
1 材料與方法
1.1 實(shí)驗(yàn)試劑和儀器
1.2 研究的樣本
1.3 DNA的提取
1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測(cè)序
1.5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的處理和分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總DNA的提取
2.2 Cytb基因序列特征
2.3 Cytb遺傳多樣性分析
2.3.1 單倍型分布
2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
2.4 Cytb的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.1 遺傳距離
2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
2.5 分子方差分析
2.6 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
2.6.1 中性檢驗(yàn)
2.6.2 歧點(diǎn)分布
3 討論
3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
3.3 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
第三章 大眼鱖的遺傳多樣性研究:D-LOOP分析
1 材料與方法
1.1 所需實(shí)驗(yàn)材料
1.2 所需實(shí)驗(yàn)樣本
1.3 DNA的提取
1.4 線粒體Cytb基因擴(kuò)增、純化和測(cè)序
1.5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總DNA的提取
2.2 D-loop序列特征
2.3 D-loop遺傳多樣性分析
2.3.1 單倍型分布
2.3.2 遺傳多樣性指數(shù)
2.4 D-loop區(qū)的遺傳結(jié)構(gòu)分析
2.4.1 遺傳距離
2.4.2 系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4.3 遺傳分化系數(shù)和基因流
2.5 分子方差分析
2.6 大眼鱖的種群歷史動(dòng)態(tài)
2.6.1 中性檢驗(yàn)
2.6.2 核苷酸不配對(duì)分布圖
3 討論
3.1 大眼鱖的遺傳多樣性分析
3.2 大眼鱖群體間的遺傳分化
3.3 大眼鱖的遺傳多樣性保護(hù)
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間參加的學(xué)術(shù)會(huì)議及發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
本文編號(hào):3658125
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