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鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白基因的克隆及進(jìn)化分析

發(fā)布時(shí)間:2022-04-23 13:09
  魚類是兼具特異性免疫和非特異性免疫的低等脊椎動(dòng)物。相比哺乳動(dòng)物來說,魚類的特異性免疫機(jī)制并不是特別完善,水生生物中存在品種數(shù)目眾多和大量的致病性微生物以及強(qiáng)大的生存壓力,使得魚類的免疫系統(tǒng)在面臨病原微生物的入侵過程中,非特異性免疫系統(tǒng)在抵御外源微生物中發(fā)揮相當(dāng)重要的作用。轉(zhuǎn)鐵蛋白(Transferrin,TF)是一種非血紅素結(jié)合的β-球蛋白,它具有兩個(gè)鐵離子(Fe3+)結(jié)合位點(diǎn),可以結(jié)合兩個(gè)鐵離子(Fe3+)。轉(zhuǎn)鐵蛋白功能廣泛,不僅在運(yùn)輸機(jī)體內(nèi)鐵離子以及鐵在體內(nèi)的代謝起重要作用,而且還在細(xì)胞呼吸、細(xì)胞生長(zhǎng)和增殖中也扮演重要角色。另外它還具有抗菌殺菌的功能,參與機(jī)體的先天性免疫功能。在這項(xiàng)研究中,鑒定和分離出鮸魚的TF基因(MIMI-TF)。鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白cDNA全長(zhǎng)2070bp,編碼689個(gè)氨基酸。鮸魚的TF基因全長(zhǎng)為6757bp,基因結(jié)構(gòu)由17個(gè)外顯子和16個(gè)內(nèi)含子組成,此結(jié)構(gòu)與其他多種脊椎動(dòng)物的TF基因結(jié)構(gòu)相似,揭示了鮸魚的TF基因在結(jié)構(gòu)上的保守性。鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白基因編碼的蛋白質(zhì)N-端存在由18個(gè)氨基酸殘基編碼的信號(hào)肽。鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白基因與其他... 

【文章頁數(shù)】:56 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
目錄
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 鮸魚的分類地位和基本情況
    1.2 轉(zhuǎn)鐵蛋白的研究進(jìn)展
        1.2.1 轉(zhuǎn)鐵蛋白
        1.2.2 轉(zhuǎn)鐵蛋白的結(jié)構(gòu)與生理功能
        1.2.3 轉(zhuǎn)鐵蛋白多態(tài)性
        1.2.4 轉(zhuǎn)鐵蛋白受體及其結(jié)構(gòu)功能
    1.3 本研究的內(nèi)容及目的
第二章 鮸魚 TF 基因的克隆和表達(dá)研究
    2.1 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑及配方
    2.2 實(shí)驗(yàn)材料
    2.3 實(shí)驗(yàn)方法
        2.3.1 基因組 DNA 抽提與檢測(cè)
        2.3.2 Trizol 法提取鮸魚 RNA 及反轉(zhuǎn)錄
        2.3.3 PCR 擴(kuò)增鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白基因 TF cDNA 全長(zhǎng)
        2.3.4 PCR 擴(kuò)增鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白基因基因組全長(zhǎng)
        2.3.5 定量 PCR 分析
    2.4 結(jié)果與討論
        2.4.1 鮸魚轉(zhuǎn)鐵蛋白分子特征分析
        2.4.2 鮸魚 TF 基因組織表達(dá)特征研究
第三章 鮸魚 TF 基因的分子進(jìn)化研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 序列分析
        3.1.2 分子系統(tǒng)樹構(gòu)建
        3.1.3 分子進(jìn)化分析
        3.1.4 PAML 軟件分析
    3.2 結(jié)果與討論
        3.2.1 鮸魚系統(tǒng)發(fā)生樹構(gòu)建
        3.2.2 轉(zhuǎn)鐵蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析
        3.2.3 轉(zhuǎn)鐵蛋白的蛋白功能分析
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]轉(zhuǎn)鐵蛋白的研究進(jìn)展[J]. 趙建輝,韓柱,侯小康.  河北化工. 2010(09)
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[6]大黃魚(Pseudosciaena crocea)轉(zhuǎn)鐵蛋白(Tf)基因克隆及序列分析[J]. 李明云,陳炯,張祖興,管丹東,張呈念.  海洋與湖沼. 2007(06)
[7]轉(zhuǎn)鐵蛋白正選擇位點(diǎn)的檢測(cè)及分析[J]. 樊棠懷,陶敏,徐立中,胡成鈺.  南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(理科版). 2007(03)
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碩士論文
[1]黃姑魚和鮸魚的形態(tài)學(xué)特征及黃姑魚群體的遺傳學(xué)研究[D]. 韓冰.中國(guó)海洋大學(xué) 2007



本文編號(hào):3647241

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