發(fā)布時(shí)間：2022-02-26 11:11

　　為了開(kāi)發(fā)奧利亞羅非魚(yú)有關(guān)耐鹽性的分子標(biāo)記,采用二代測(cè)序RNA-seq方法,挖掘奧利亞羅非魚(yú)的微衛(wèi)星標(biāo)記。結(jié)果顯示,拼接組裝獲得了71 009條Unigenes,并在所有序列中共發(fā)現(xiàn)了10 875個(gè)SSR位點(diǎn),含有位點(diǎn)序列的數(shù)量為8 315條,占總序列的11.71%。奧利亞羅非魚(yú)轉(zhuǎn)錄組中SSR位點(diǎn)類(lèi)型較為豐富,共識(shí)別到5種不同核苷酸重復(fù)類(lèi)型和126種不同重復(fù)基序。其中,二核苷酸串聯(lián)重復(fù)單元類(lèi)型的含量最多（5 779個(gè)）,占總位點(diǎn)數(shù)的53.14%;而在二核苷酸重復(fù)類(lèi)型中AC/GT基序類(lèi)型出現(xiàn)頻率最高（3 954個(gè),占36.36%）。此外,SSR位點(diǎn)以6次重復(fù)次數(shù)為主（3 048個(gè)）,占總位點(diǎn)數(shù)的27.77%;SSR位點(diǎn)序列長(zhǎng)度分布于12～254 bp,其中具有高度多態(tài)性位點(diǎn)3 480個(gè)（占比29.14%）,中等多態(tài)性位點(diǎn)8 462個(gè)（占比70.86%）。 

【文章來(lái)源】：河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,49(11)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

奧利亞羅非魚(yú)轉(zhuǎn)錄組中SSR主要重復(fù)單元的類(lèi)型及出現(xiàn)頻率

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]奧利亞羅非魚(yú)性別連鎖分子標(biāo)記的篩選[D]. 樊征.西南大學(xué) 2018
[2]奧利亞羅非魚(yú)DMRT1基因的克隆及其性別決定機(jī)制的研究[D]. 王光花.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004



本文編號(hào)：3644507