為了解暗紋東方鲀（Takifugu obscurus）受到病原菌感染后參與應(yīng)答的主要蛋白的功能與調(diào)控作用,采用TMT標(biāo)記、高效液相色譜（HPLC）分級技術(shù)以及基于質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),分析了暗紋東方鲀感染嗜水氣單胞菌（Aeromonas hydrophila） 12 h后脾臟組織的蛋白表達水平,鑒定差異表達蛋白,并通過亞細胞定位、GO（Gene Oncology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）對差異表達蛋白進行進一步分析.本次實驗共鑒定到306個差異表達蛋白,其中120個上調(diào)表達蛋白,186個下調(diào)表達蛋白;利用平行反應(yīng)檢測實驗（PRM）對4個（1個上調(diào),3個下調(diào)）與免疫相關(guān)的差異蛋白進行驗證,其結(jié)果與蛋白質(zhì)測序結(jié)果一致;亞細胞定位結(jié)果顯示:差異表達蛋白主要定位在細胞質(zhì)、細胞核和胞外; GO分析發(fā)現(xiàn):差異表達蛋白參與的主要生物進程有代謝過程、細胞進程和單一生物進程,主要的分子功能有結(jié)合、催化活性和機構(gòu)分析活性; KEGG通路分析結(jié)果顯示:差異表達蛋白主要參與了核糖體、視黃醇代謝、卟啉和葉綠素代謝、ECM受體相互作用、吞噬體... 

【文章來源】：華南師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,52(05)北大核心

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實驗動物
    1.2 主要試劑和儀器
    1.3 暗紋東方鲀感染及取樣
    1.4 脾臟細胞凋亡率
    1.5 胞內(nèi)游離Ca2+含量
    1.6 蛋白質(zhì)提取及酶解
    1.7 TMT標(biāo)記和HPLC分級
    1.8 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析
    1.9 數(shù)據(jù)庫搜索
    1.1 0 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 脾臟細胞凋亡率和胞內(nèi)游離鈣離子含量
    2.2 差異表達蛋白的統(tǒng)計及分析
        2.2.1 差異表達蛋白統(tǒng)計
        2.2.2 差異表達蛋白的亞細胞結(jié)構(gòu)定位分析
        2.2.3 差異表達蛋白的GO注釋
        2.2.4 差異表達蛋白的功能富集分析
    2.3 差異蛋白的PRM驗證
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3635180