大黃魚Nrdp1、March4和Rnf115基因的分子特征與免疫功能的初步研究
發(fā)布時間:2022-02-16 20:36
本文分析了三種E3泛素連接酶,Nrdp1、March4和Rnf115的分子結(jié)構(gòu)特征,研究了這些基因的組織表達譜及其在大黃魚免疫反應(yīng)中的表達,應(yīng)用酵母雙雜交研究了Nrdp1的互作蛋白。結(jié)果如下:(1)大黃魚Nrdp1基因(Lc Nrdp1)的cDNA全長1248 bp,ORF為957 bp,編碼318個氨基酸,其編碼蛋白主要結(jié)構(gòu)包括N-端的環(huán)指結(jié)構(gòu)、中間的B-box結(jié)構(gòu)和C-端的螺旋卷曲3個結(jié)構(gòu)域,分子量約為36.16 KDa。Real-time PCR分析發(fā)現(xiàn),Nrdp1廣泛表達在大黃魚的腦、心臟、鰓、肝臟、脾臟、腎臟、頭腎、胃、腸、皮膚、肌肉和血液組織中,其中腦表達豐度最高。用孵化2 h內(nèi)的刺激隱核蟲感染大黃魚,采集6h、12h、1d、2d、3d和5d的樣品,Real-time PCR檢測在鰓、皮膚、脾和腎中的的表達。結(jié)果表明:Nrdp1在鰓、皮膚和脾臟中表達出現(xiàn)顯著上調(diào)(P<0.05),且都在刺激后12h表達量達到最高值;在頭腎中Nrdp1基因的表達量下降。酵母雙雜交實驗表明,Nrdp1與MyD88、TBK1之間存在著相互作用。腹腔注射PBS、LPS、poly I:C和副溶血...
【文章來源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
酵母雙雜交原理圖
TGAAGGAGTAGCCACGCTCTGT量 PCR織差異表達分析結(jié)果,利用 Fold = 2–ΔΔCT 計算基因的 RQ 值,A 和 Independent-Samples T-test 方法)分析各組數(shù)p1的克隆與序列分析NA 的提取 RNA 經(jīng) 1.0%瓊脂糖凝膠電泳后,可以清楚的rRNA 及亮度較微弱的 5S rRNA 帶(圖 2.1),驗。
圖 2.2 Nrdp1 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖g 2.2 The electropherogram of Nrdp1 PCR frag1:Nrdp1 PCR 產(chǎn)物 M:Marker 2000cDNA 序列分析p1 基因片段進行序列拼接(如圖 2.3) bp,預(yù)測其編碼蛋白的分子量為 36.1CGTGGCTCCCAGTGATGTACCatggggtacgacgttacM G Y D V T gaagacctgctgtgccctatatgtagtggagtcctcgaE D L L C P I C S G V L E tgcgagcatgctttctgcaacgcctgtataacgcagtgC E H A F C N A C I T Q W ccagtcgatcgcacagtagtgacgctagctcacctccgP V D R T V V T L A H L R aacatgctgtccaagctccagatcagctgcgacaacgcN M L S K L Q I S C D N A ctacggctcgaccagctgcagtcgcacctcaaggactg
【參考文獻】:
期刊論文
[1]神經(jīng)調(diào)節(jié)素受體降解蛋白1的研究進展[J]. 蘇里,張圓. 醫(yī)學(xué)綜述. 2014(22)
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[3]大黃魚腫瘤壞死因子受體基因(TNFR)的克隆及其在各組織和副溶血弧菌感染下的表達[J]. 孫從正,韓坤煌,黃貽濤,劉家富,張子平,謝芳靖,王藝?yán)? 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2014(03)
[4]水稻E3泛素連接酶研究進展[J]. 戴陽朔,董錚,李魏,戴良英. 作物研究. 2013(03)
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[6]甘藍SCR、THL與SRK交替相互作用的酵母雙雜交檢測[J]. 楊永軍,張賀翠,楊昆,薛麗琰,常登龍,朱利泉. 中國蔬菜. 2012(24)
[7]大黃魚三種寄生蟲病爆發(fā)與同期水溫關(guān)系的探討[J]. 黃偉卿,王楠楠. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[8]凡納濱對蝦Crustin-like基因的克隆及在副溶血弧菌感染條件下的表達分析[J]. 張艷艷,劉小林,黃海洪,錢昭英,王憲宗,相建海,李義軍. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(12)
[9]斜帶石斑魚TLR3基因的克隆及其在刺激隱核蟲感染時的表達分析[J]. 喬瑋,李言偉,李安興. 水生生物學(xué)報. 2012(03)
[10]近江牡蠣HSC70基因?qū)θ茉寤【腥镜姆磻?yīng)[J]. 劉志剛,張其中,張占會,崔淼. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(03)
博士論文
[1]石斑魚TLRs功能及刺激隱核蟲感染后免疫相關(guān)基因表達分析[D]. 李言偉.中山大學(xué) 2012
[2]E3泛素連接酶CHIP和Nrdp1在免疫應(yīng)答反應(yīng)中的調(diào)控作用及其機制研究[D]. 楊明金.浙江大學(xué) 2012
[3]泛素E3連接酶Nrdp1在缺血再灌注心肌損傷中的作用及分子病理機制[D]. 張圓.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2011
[4]帕金森病(PD)致病基因LRRK2啟動子分離及PD相關(guān)基因CSP-α、Nrdp1、USP24突變篩查研究[D]. 莫曉云.中南大學(xué) 2010
[5]重要海水養(yǎng)殖魚類MHCⅡ基因克隆、表達及多態(tài)性分析[D]. 張玉喜.中國海洋大學(xué) 2006
[6]刺激隱核蟲(Cryptocaryon irritans)的傳代、保存及刺激隱核蟲病的防治研究[D]. 但學(xué)明.暨南大學(xué) 2006
碩士論文
[1]副溶血弧菌感染斑馬魚的致病性及天然免疫應(yīng)答研究[D]. 張永華.上海海洋大學(xué) 2012
[2]大黃魚刺激隱核蟲病病原生物學(xué)特性的研究[D]. 周旻曦.寧波大學(xué) 2012
[3]水稻條紋病毒功能蛋白與水稻葉綠體蛋白的互作[D]. 蘭漢紅.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
[4]大黃魚抗病功能基因的克隆與分析[D]. 謝芳靖.集美大學(xué) 2007
本文編號:3628621
【文章來源】:集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
酵母雙雜交原理圖
TGAAGGAGTAGCCACGCTCTGT量 PCR織差異表達分析結(jié)果,利用 Fold = 2–ΔΔCT 計算基因的 RQ 值,A 和 Independent-Samples T-test 方法)分析各組數(shù)p1的克隆與序列分析NA 的提取 RNA 經(jīng) 1.0%瓊脂糖凝膠電泳后,可以清楚的rRNA 及亮度較微弱的 5S rRNA 帶(圖 2.1),驗。
圖 2.2 Nrdp1 PCR 產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖g 2.2 The electropherogram of Nrdp1 PCR frag1:Nrdp1 PCR 產(chǎn)物 M:Marker 2000cDNA 序列分析p1 基因片段進行序列拼接(如圖 2.3) bp,預(yù)測其編碼蛋白的分子量為 36.1CGTGGCTCCCAGTGATGTACCatggggtacgacgttacM G Y D V T gaagacctgctgtgccctatatgtagtggagtcctcgaE D L L C P I C S G V L E tgcgagcatgctttctgcaacgcctgtataacgcagtgC E H A F C N A C I T Q W ccagtcgatcgcacagtagtgacgctagctcacctccgP V D R T V V T L A H L R aacatgctgtccaagctccagatcagctgcgacaacgcN M L S K L Q I S C D N A ctacggctcgaccagctgcagtcgcacctcaaggactg
【參考文獻】:
期刊論文
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[3]大黃魚腫瘤壞死因子受體基因(TNFR)的克隆及其在各組織和副溶血弧菌感染下的表達[J]. 孫從正,韓坤煌,黃貽濤,劉家富,張子平,謝芳靖,王藝?yán)? 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2014(03)
[4]水稻E3泛素連接酶研究進展[J]. 戴陽朔,董錚,李魏,戴良英. 作物研究. 2013(03)
[5]草魚E3泛素連接酶Nrdp1基因cDNA克隆和表達分析[J]. 隗黎麗,楊竹青,王自蕊,熊六鳳,周秋白. 江西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2013(01)
[6]甘藍SCR、THL與SRK交替相互作用的酵母雙雜交檢測[J]. 楊永軍,張賀翠,楊昆,薛麗琰,常登龍,朱利泉. 中國蔬菜. 2012(24)
[7]大黃魚三種寄生蟲病爆發(fā)與同期水溫關(guān)系的探討[J]. 黃偉卿,王楠楠. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(12)
[8]凡納濱對蝦Crustin-like基因的克隆及在副溶血弧菌感染條件下的表達分析[J]. 張艷艷,劉小林,黃海洪,錢昭英,王憲宗,相建海,李義軍. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2012(12)
[9]斜帶石斑魚TLR3基因的克隆及其在刺激隱核蟲感染時的表達分析[J]. 喬瑋,李言偉,李安興. 水生生物學(xué)報. 2012(03)
[10]近江牡蠣HSC70基因?qū)θ茉寤【腥镜姆磻?yīng)[J]. 劉志剛,張其中,張占會,崔淼. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(03)
博士論文
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[2]E3泛素連接酶CHIP和Nrdp1在免疫應(yīng)答反應(yīng)中的調(diào)控作用及其機制研究[D]. 楊明金.浙江大學(xué) 2012
[3]泛素E3連接酶Nrdp1在缺血再灌注心肌損傷中的作用及分子病理機制[D]. 張圓.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2011
[4]帕金森病(PD)致病基因LRRK2啟動子分離及PD相關(guān)基因CSP-α、Nrdp1、USP24突變篩查研究[D]. 莫曉云.中南大學(xué) 2010
[5]重要海水養(yǎng)殖魚類MHCⅡ基因克隆、表達及多態(tài)性分析[D]. 張玉喜.中國海洋大學(xué) 2006
[6]刺激隱核蟲(Cryptocaryon irritans)的傳代、保存及刺激隱核蟲病的防治研究[D]. 但學(xué)明.暨南大學(xué) 2006
碩士論文
[1]副溶血弧菌感染斑馬魚的致病性及天然免疫應(yīng)答研究[D]. 張永華.上海海洋大學(xué) 2012
[2]大黃魚刺激隱核蟲病病原生物學(xué)特性的研究[D]. 周旻曦.寧波大學(xué) 2012
[3]水稻條紋病毒功能蛋白與水稻葉綠體蛋白的互作[D]. 蘭漢紅.福建農(nóng)林大學(xué) 2009
[4]大黃魚抗病功能基因的克隆與分析[D]. 謝芳靖.集美大學(xué) 2007
本文編號:3628621
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