草魚（Ctenopharyngodon idella）在黑龍江、珠江和長(zhǎng)江等水域中分布廣泛，是我國(guó)最重要的淡水養(yǎng)殖魚類。本研究通過磁珠富集法，分離篩選多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記400余個(gè)，為草魚遺傳連鎖圖譜加密工作打下基礎(chǔ)；建立了5組適用于檢測(cè)草魚不同群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星多重PCR體系；對(duì)來(lái)自國(guó)內(nèi)外共9個(gè)草魚養(yǎng)殖群體進(jìn)行了遺傳多樣性研究，以期為草魚種質(zhì)資源的監(jiān)測(cè)、評(píng)估和利用提供理論依據(jù)。主要內(nèi)容如下：1.草魚多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選與分析通過改進(jìn)的磁珠富集法，以生物素標(biāo)記（CA）10和（GACA）6作為探針，構(gòu)建以兩堿基和四堿基為重復(fù)單元的草魚微衛(wèi)星文庫(kù)，一共得到3000余條含有微衛(wèi)星片段的序列。設(shè)計(jì)引物，并依次通過AGE和PAGE電泳檢測(cè)，成功篩選出多態(tài)性微衛(wèi)星引物465對(duì)，從中隨機(jī)挑選25對(duì)，對(duì)60個(gè)黑龍江草魚基因組DNA進(jìn)行擴(kuò)增和STR分型，分析其多態(tài)性水平。結(jié)果顯示：此25個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)全部表現(xiàn)出多態(tài)性，每個(gè)位點(diǎn)等位基因數(shù)量在3-15之間，平均值為6.52；觀測(cè)雜合度0.350-0.950；期望雜合度0.439-0.843；3個(gè)位點(diǎn)表現(xiàn)出偏離群體哈迪-溫伯格平衡（P<0.05）；18... 

【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：74 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

部分草魚基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳(AGE)的拍照?qǐng)D

圖 2-2 二次富集后的 PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳(AGE)照片2 Agarose gel electrophoresis pattern of PCR products for second enrichm序及微衛(wèi)星序列的整理增好的產(chǎn)物連接入 pGEM-T 載體 (由 Promega公司提供)，

圖 2-3 微衛(wèi)星單元的重復(fù)次數(shù)分布圖Fig. 2-3 Number of sequences for different repeats (SSR).2 微衛(wèi)星標(biāo)記的不同重復(fù)單元類型分布統(tǒng)計(jì)顯示：以二核苷酸為重復(fù)單元的微衛(wèi)星位點(diǎn)共 4483 個(gè)，占總數(shù)量

【參考文獻(xiàn)】：
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