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6個不同群體鱖基于SSR的遺傳多樣性初步研究

發(fā)布時間:2022-01-21 09:53
  旨在了解不同群體鱖遺傳多樣性及種質資源現(xiàn)狀,采用微衛(wèi)星標記技術,對采自6個不同群體鱖96尾個體的遺傳多樣性進行了初步分析。結果表明,經(jīng)篩選的10對引物在6個鱖群體中的平均等位基因數(shù)(Na)為2.2000~2.5000,期望雜合度(He)為0.6489~0.7289,多態(tài)信息含量(PIC)為0.5614~0.6409(PIC>0.5);群體遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.0606(0.05<Fst<0.15),平均基因流(Nm)為4.0151;檢驗表明,除高郵和靖江群體外,其他4個群體均不同程度地偏離Hardy-Weinberg平衡,主要表現(xiàn)為雜合子缺失。構建的UPGMA聚類圖顯示,銅陵、安慶、太湖、高郵和靖江群體聚為一類,當涂群體聚為另一類。本研究表明6個鱖群體的遺傳多樣性較高,群體間遺傳分化水平中等,群體間存在著一定的基因交流。 

【文章來源】:中國農學通報. 2020,36(26)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

6個不同群體鱖基于SSR的遺傳多樣性初步研究


圖1 位點G13在6個鱖群體的擴增電泳圖

群體,親緣關系,聚類,雜合度


多態(tài)信息含量(PIC)常用來衡量位點的多態(tài)性。Botstein等認為,PIC>0.5時,為高度多態(tài)位點;0.25<PIC<0.5時,為中度多態(tài)位點;PIC<0.25時,為低度多態(tài)位點[14]。在本課題研究的10個微衛(wèi)星位點中,除位點G09和G12(PIC值分別為0.5982和0.5238)屬于高度多態(tài)位點(PIC>0.5)外,其余8個位點均屬于中度多態(tài)位點(0.25<PIC<0.5),平均多態(tài)信息含量(PIC)值為0.4317,說明本研究選取的10個微衛(wèi)星位點多態(tài)性較高,適合用于鱖群體的遺傳多樣性分析。雜合度(H)能反映各個群體在多個位點上的遺傳變異,期望雜合度(He)是衡量群體遺傳變異程度的一個重要參數(shù)[15],期望雜合度(He)越高,說明遺傳多樣性越豐富。本課題研究的6個群體的平均期望雜合度(He)為0.6489-0.7289,趙程等[16]對5種鱖屬魚類進行微衛(wèi)星遺傳多樣性分析,得出來自湖南的翹嘴鱖野生群體的期望雜合度(He)為0.6900,田華[17]用22個微衛(wèi)星位點,對長江鰱、鳙的野生和養(yǎng)殖群體進行分析,得到的期望雜合度(He)分別為鰱0.5810~0.6120和鳙0.5400~0.5500,劉朋朋[18]用13對微衛(wèi)星引物,對巢湖、滆湖、洪澤湖、鄱陽湖和太湖的5個黃顙魚種群進行SSR分析,其平均期望雜合度(He)為0.5096~0.6098,由此可見,相比于其他的鱖種群以及長江流域的其他魚類種群,本課題6個鱖群體的遺傳多樣性較為豐富的,當環(huán)境發(fā)生變化時,鱖群體能有較高的適應能力。

【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]長江中下游五個地理種群黃顙魚遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學 2013
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本文編號:3600044

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