6個不同群體鱖基于SSR的遺傳多樣性初步研究
發(fā)布時間:2022-01-21 09:53
旨在了解不同群體鱖遺傳多樣性及種質資源現(xiàn)狀,采用微衛(wèi)星標記技術,對采自6個不同群體鱖96尾個體的遺傳多樣性進行了初步分析。結果表明,經(jīng)篩選的10對引物在6個鱖群體中的平均等位基因數(shù)(Na)為2.2000~2.5000,期望雜合度(He)為0.6489~0.7289,多態(tài)信息含量(PIC)為0.5614~0.6409(PIC>0.5);群體遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.0606(0.05<Fst<0.15),平均基因流(Nm)為4.0151;檢驗表明,除高郵和靖江群體外,其他4個群體均不同程度地偏離Hardy-Weinberg平衡,主要表現(xiàn)為雜合子缺失。構建的UPGMA聚類圖顯示,銅陵、安慶、太湖、高郵和靖江群體聚為一類,當涂群體聚為另一類。本研究表明6個鱖群體的遺傳多樣性較高,群體間遺傳分化水平中等,群體間存在著一定的基因交流。
【文章來源】:中國農學通報. 2020,36(26)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
圖1 位點G13在6個鱖群體的擴增電泳圖
多態(tài)信息含量(PIC)常用來衡量位點的多態(tài)性。Botstein等認為,PIC>0.5時,為高度多態(tài)位點;0.25<PIC<0.5時,為中度多態(tài)位點;PIC<0.25時,為低度多態(tài)位點[14]。在本課題研究的10個微衛(wèi)星位點中,除位點G09和G12(PIC值分別為0.5982和0.5238)屬于高度多態(tài)位點(PIC>0.5)外,其余8個位點均屬于中度多態(tài)位點(0.25<PIC<0.5),平均多態(tài)信息含量(PIC)值為0.4317,說明本研究選取的10個微衛(wèi)星位點多態(tài)性較高,適合用于鱖群體的遺傳多樣性分析。雜合度(H)能反映各個群體在多個位點上的遺傳變異,期望雜合度(He)是衡量群體遺傳變異程度的一個重要參數(shù)[15],期望雜合度(He)越高,說明遺傳多樣性越豐富。本課題研究的6個群體的平均期望雜合度(He)為0.6489-0.7289,趙程等[16]對5種鱖屬魚類進行微衛(wèi)星遺傳多樣性分析,得出來自湖南的翹嘴鱖野生群體的期望雜合度(He)為0.6900,田華[17]用22個微衛(wèi)星位點,對長江鰱、鳙的野生和養(yǎng)殖群體進行分析,得到的期望雜合度(He)分別為鰱0.5810~0.6120和鳙0.5400~0.5500,劉朋朋[18]用13對微衛(wèi)星引物,對巢湖、滆湖、洪澤湖、鄱陽湖和太湖的5個黃顙魚種群進行SSR分析,其平均期望雜合度(He)為0.5096~0.6098,由此可見,相比于其他的鱖種群以及長江流域的其他魚類種群,本課題6個鱖群體的遺傳多樣性較為豐富的,當環(huán)境發(fā)生變化時,鱖群體能有較高的適應能力。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱖屬5種魚類微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 趙程,梁旭方,田昌緒,楊敏,竇亞琪,郭穩(wěn)杰,宋易. 華中農業(yè)大學學報. 2015(05)
[2]2個鱖魚選育群體遺傳多樣性分析[J]. 張進,梁旭方,楊敏,陳敦學,劉燦洪,巫紹明,李永鋒. 水產科學. 2014(07)
[3]翹嘴鱖養(yǎng)殖與野生群體及其家系的遺傳多樣性分析[J]. 楊凱,高銀愛,丹成,曾可為,王青云,朱思華,夏儒龍,鄭翠華,羅峰,程穎紅,王輝,李波. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[4]瓦氏雅羅魚達里湖群體和烏蘇里江群體的遺傳多樣性和遺傳結構分析[J]. 池炳杰,常玉梅,閆學春,曹頂臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中國水產科學. 2010(02)
[5]利用微衛(wèi)星標記分析長鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性[J]. 孫莉,楊國梁,王軍毅,吳婷婷,張海波,吳添文,陳國宏. 揚州大學學報(農業(yè)與生命科學版). 2009(03)
[6]牙鲆5個養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉海金,朱曉琛,孫效文,楊立更,薛玲玲,毛連菊. 中國水產科學. 2008(01)
[7]FIASCO法篩選鱖魚微衛(wèi)星標記[J]. 匡剛橋,劉臻,魯雙慶,劉紅玉,張建社,唐建洲. 中國水產科學. 2007(04)
[8]應用微衛(wèi)星多態(tài)分析四個鯉魚群體的遺傳多樣性[J]. 全迎春,孫效文,梁利群. 動物學研究. 2005(06)
[9]鱖野生群體與養(yǎng)殖群體的RAPD分析[J]. 方展強,陳軍,鄭文彪,伍育源,肖智. 大連水產學院學報. 2005(01)
[10]鱖魚遺傳多樣性的RAPD指紋分析[J]. 楊受保,祖國掌,程久發(fā). 水產養(yǎng)殖. 2003(04)
碩士論文
[1]翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)以及三個群體遺傳多態(tài)性分析[D]. 彭敏燕.暨南大學 2013
[2]長江中下游五個地理種群黃顙魚遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學 2013
[3]鰱鳙長江野生群體和養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析[D]. 田華.華中農業(yè)大學 2008
本文編號:3600044
【文章來源】:中國農學通報. 2020,36(26)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
圖1 位點G13在6個鱖群體的擴增電泳圖
多態(tài)信息含量(PIC)常用來衡量位點的多態(tài)性。Botstein等認為,PIC>0.5時,為高度多態(tài)位點;0.25<PIC<0.5時,為中度多態(tài)位點;PIC<0.25時,為低度多態(tài)位點[14]。在本課題研究的10個微衛(wèi)星位點中,除位點G09和G12(PIC值分別為0.5982和0.5238)屬于高度多態(tài)位點(PIC>0.5)外,其余8個位點均屬于中度多態(tài)位點(0.25<PIC<0.5),平均多態(tài)信息含量(PIC)值為0.4317,說明本研究選取的10個微衛(wèi)星位點多態(tài)性較高,適合用于鱖群體的遺傳多樣性分析。雜合度(H)能反映各個群體在多個位點上的遺傳變異,期望雜合度(He)是衡量群體遺傳變異程度的一個重要參數(shù)[15],期望雜合度(He)越高,說明遺傳多樣性越豐富。本課題研究的6個群體的平均期望雜合度(He)為0.6489-0.7289,趙程等[16]對5種鱖屬魚類進行微衛(wèi)星遺傳多樣性分析,得出來自湖南的翹嘴鱖野生群體的期望雜合度(He)為0.6900,田華[17]用22個微衛(wèi)星位點,對長江鰱、鳙的野生和養(yǎng)殖群體進行分析,得到的期望雜合度(He)分別為鰱0.5810~0.6120和鳙0.5400~0.5500,劉朋朋[18]用13對微衛(wèi)星引物,對巢湖、滆湖、洪澤湖、鄱陽湖和太湖的5個黃顙魚種群進行SSR分析,其平均期望雜合度(He)為0.5096~0.6098,由此可見,相比于其他的鱖種群以及長江流域的其他魚類種群,本課題6個鱖群體的遺傳多樣性較為豐富的,當環(huán)境發(fā)生變化時,鱖群體能有較高的適應能力。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱖屬5種魚類微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[J]. 趙程,梁旭方,田昌緒,楊敏,竇亞琪,郭穩(wěn)杰,宋易. 華中農業(yè)大學學報. 2015(05)
[2]2個鱖魚選育群體遺傳多樣性分析[J]. 張進,梁旭方,楊敏,陳敦學,劉燦洪,巫紹明,李永鋒. 水產科學. 2014(07)
[3]翹嘴鱖養(yǎng)殖與野生群體及其家系的遺傳多樣性分析[J]. 楊凱,高銀愛,丹成,曾可為,王青云,朱思華,夏儒龍,鄭翠華,羅峰,程穎紅,王輝,李波. 淡水漁業(yè). 2013(03)
[4]瓦氏雅羅魚達里湖群體和烏蘇里江群體的遺傳多樣性和遺傳結構分析[J]. 池炳杰,常玉梅,閆學春,曹頂臣,高玉奎,柳玉海,李勇,梁利群. 中國水產科學. 2010(02)
[5]利用微衛(wèi)星標記分析長鰭鯉、錦鯉和龍鳳鯉的遺傳多樣性[J]. 孫莉,楊國梁,王軍毅,吳婷婷,張海波,吳添文,陳國宏. 揚州大學學報(農業(yè)與生命科學版). 2009(03)
[6]牙鲆5個養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉海金,朱曉琛,孫效文,楊立更,薛玲玲,毛連菊. 中國水產科學. 2008(01)
[7]FIASCO法篩選鱖魚微衛(wèi)星標記[J]. 匡剛橋,劉臻,魯雙慶,劉紅玉,張建社,唐建洲. 中國水產科學. 2007(04)
[8]應用微衛(wèi)星多態(tài)分析四個鯉魚群體的遺傳多樣性[J]. 全迎春,孫效文,梁利群. 動物學研究. 2005(06)
[9]鱖野生群體與養(yǎng)殖群體的RAPD分析[J]. 方展強,陳軍,鄭文彪,伍育源,肖智. 大連水產學院學報. 2005(01)
[10]鱖魚遺傳多樣性的RAPD指紋分析[J]. 楊受保,祖國掌,程久發(fā). 水產養(yǎng)殖. 2003(04)
碩士論文
[1]翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)以及三個群體遺傳多態(tài)性分析[D]. 彭敏燕.暨南大學 2013
[2]長江中下游五個地理種群黃顙魚遺傳多樣性的分析以及MSTN多態(tài)性的研究[D]. 劉朋朋.南京師范大學 2013
[3]鰱鳙長江野生群體和養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星的遺傳多樣性分析[D]. 田華.華中農業(yè)大學 2008
本文編號:3600044
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