南海黃鰭馬面鲀（Thamnaconus hypargyreus）種群分析
發(fā)布時間：2022-01-15 22:07
黃鰭馬面鲀（Thamnaconus hypargyreus）是具有較高經(jīng)濟價值的魚類，曾是南海最大宗的高產(chǎn)魚種，是底拖網(wǎng)作業(yè)的主要捕撈對象。鲀形目（Tetraodontiformes）魚類的分子系統(tǒng)學(xué)研究是國內(nèi)外關(guān)注的熱點，從種至目各分類階元的系統(tǒng)發(fā)育研究中，多數(shù)是利用了部分或全部的線粒體基因組序列。為此，本研究通過設(shè)計15對引物進行PCR擴增并測序，首次獲得了黃鰭馬面鲀線粒體基因組DNA（MitochondrialDNA, mtDNA）全序列，并結(jié)合馬面鲀屬其它種類的mtDNA進行了線粒體全基因組水平的系統(tǒng)發(fā)育分析。黃鰭馬面鲀mtDNA基因組序列全長16438bp，A+T含量為53.5%，其mtDNA由2個rRNA基因、13個蛋白質(zhì)編碼基因、22個tRNA基因和1段786bp非編碼的控制區(qū)（D-loop）所組成。除COⅠ起始密碼子為GTG以外，其余蛋白質(zhì)編碼基因均以ATG為起始密碼子。除了COⅡ, ND4和Cyt b使用不完全密碼子（T或TA）為終止密碼子以外，其余均使用典型的終止密碼子TAA或TAG。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNA...
【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】：77 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
基于黃鰭馬面鲀等17種魚類的線粒體基因組核苷酸全序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹(a-NJ樹；b-MP樹)
圖 3-1 黃鰭馬面鲀樣本采集地點示意圖Figure 3-1 A sketch map of sampling sites of T. hypargyreus表3-1 黃鰭馬面鲀樣本采集信息Table 3-1 Sampling data of T. hypargyreus
圖 3-2 黃鰭馬面鲀單倍型的 MJ 網(wǎng)絡(luò)圖(圓圈面積表示單倍型的頻率)Figure 3-2 Median-joining network of the 58 haplotypes of T. hypargyreus(Size of circle was proportional to haplotype frequency)為 H1~H10、H13、H19、H26 和 H27。單倍型 H1 分布最廣，所有群體均有
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于線粒體Cyt b基因的黃鰭馬面鲀種群分析[J]. 李玉芳,李永振,陳國寶,孫典榮,于杰,崔科. 水產(chǎn)學(xué)報. 2014(01)
[2]長江中下游5個湖泊黃顙魚（Pelteobagrus fulvidraco）種群線粒體細(xì)胞色素b基因的遺傳變異分析[J]. 鐘立強,劉朋朋,潘建林,王明華,陳友明,秦欽,邊文冀,陳校輝. 湖泊科學(xué). 2013(02)
[3]南海金線魚屬Nemipterus魚類COⅠ和Cytb基因片段的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,李永振,陳國寶. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(02)
[4]基于Cytb基因序列研究5個地理種群叉尾斗魚的遺傳變異[J]. 劉宏毅,黎明星,肖俊,甘西,張明. 水生生物學(xué)報. 2011(06)
[5]基于線粒體D-loop區(qū)比較分析野生與養(yǎng)殖斜帶髭鯛種群的遺傳多樣性[J]. 陳竹,鐘山,羅大極,楊國華,梁日深,鄒記興. 水生生物學(xué)報. 2011(05)
[6]瓦氏黃顙魚線粒體全基因組序列分析及系統(tǒng)進化[J]. 李林,梁宏偉,李忠,羅相忠,呼光富,張志偉,朱媛媛,鄒桂偉. 遺傳. 2011(06)
[7]北部灣3種金線魚屬魚類COI基因序列的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,艾紅,盧偉華,李希國,李娜娜,李夏,李永振. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(03)
[8]條石鯛線粒體COⅠ和Cytb序列的遺傳變異分析[J]. 孫鵬,尹飛,彭士明,施兆鴻. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[9]斑尾復(fù)蝦虎魚群體遺傳多樣性比較分析[J]. 宋娜,宋林,高天翔,孫希福. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[10]竹筴魚屬魚類線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 蘇天鳳,江世貴. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2011(01)
博士論文
[1]暗紋東方鲀線粒體基因組全序列和CD8基因的克隆與表達(dá)特征分析[D]. 邵愛華.蘇州大學(xué) 2012
[2]長江流域幾種重要魚類的分子標(biāo)記篩選開發(fā)及群體遺傳分析[D]. 廖小林.中國科學(xué)院研究生院（水生生物研究所） 2006
碩士論文
[1]南海北部陸架區(qū)金線魚（Nemipterus virgatus）種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學(xué) 2011
[2]分子生物學(xué)方法鑒定河豚魚魚種的研究[D]. 李文靜.中國疾病預(yù)防控制中心 2009
本文編號：3591404
【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】：77 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
基于黃鰭馬面鲀等17種魚類的線粒體基因組核苷酸全序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹(a-NJ樹；b-MP樹)
圖 3-1 黃鰭馬面鲀樣本采集地點示意圖Figure 3-1 A sketch map of sampling sites of T. hypargyreus表3-1 黃鰭馬面鲀樣本采集信息Table 3-1 Sampling data of T. hypargyreus
圖 3-2 黃鰭馬面鲀單倍型的 MJ 網(wǎng)絡(luò)圖(圓圈面積表示單倍型的頻率)Figure 3-2 Median-joining network of the 58 haplotypes of T. hypargyreus(Size of circle was proportional to haplotype frequency)為 H1~H10、H13、H19、H26 和 H27。單倍型 H1 分布最廣，所有群體均有
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于線粒體Cyt b基因的黃鰭馬面鲀種群分析[J]. 李玉芳,李永振,陳國寶,孫典榮,于杰,崔科. 水產(chǎn)學(xué)報. 2014(01)
[2]長江中下游5個湖泊黃顙魚（Pelteobagrus fulvidraco）種群線粒體細(xì)胞色素b基因的遺傳變異分析[J]. 鐘立強,劉朋朋,潘建林,王明華,陳友明,秦欽,邊文冀,陳校輝. 湖泊科學(xué). 2013(02)
[3]南海金線魚屬Nemipterus魚類COⅠ和Cytb基因片段的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,李永振,陳國寶. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2012(02)
[4]基于Cytb基因序列研究5個地理種群叉尾斗魚的遺傳變異[J]. 劉宏毅,黎明星,肖俊,甘西,張明. 水生生物學(xué)報. 2011(06)
[5]基于線粒體D-loop區(qū)比較分析野生與養(yǎng)殖斜帶髭鯛種群的遺傳多樣性[J]. 陳竹,鐘山,羅大極,楊國華,梁日深,鄒記興. 水生生物學(xué)報. 2011(05)
[6]瓦氏黃顙魚線粒體全基因組序列分析及系統(tǒng)進化[J]. 李林,梁宏偉,李忠,羅相忠,呼光富,張志偉,朱媛媛,鄒桂偉. 遺傳. 2011(06)
[7]北部灣3種金線魚屬魚類COI基因序列的比較分析[J]. 董麗娜,黃梓榮,艾紅,盧偉華,李希國,李娜娜,李夏,李永振. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(03)
[8]條石鯛線粒體COⅠ和Cytb序列的遺傳變異分析[J]. 孫鵬,尹飛,彭士明,施兆鴻. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[9]斑尾復(fù)蝦虎魚群體遺傳多樣性比較分析[J]. 宋娜,宋林,高天翔,孫希福. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(03)
[10]竹筴魚屬魚類線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 蘇天鳳,江世貴. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2011(01)
博士論文
[1]暗紋東方鲀線粒體基因組全序列和CD8基因的克隆與表達(dá)特征分析[D]. 邵愛華.蘇州大學(xué) 2012
[2]長江流域幾種重要魚類的分子標(biāo)記篩選開發(fā)及群體遺傳分析[D]. 廖小林.中國科學(xué)院研究生院（水生生物研究所） 2006
碩士論文
[1]南海北部陸架區(qū)金線魚（Nemipterus virgatus）種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學(xué) 2011
[2]分子生物學(xué)方法鑒定河豚魚魚種的研究[D]. 李文靜.中國疾病預(yù)防控制中心 2009
本文編號：3591404
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