黃鰭?cǎi)R面鲀（Thamnaconus hypargyreus）是具有較高經(jīng)濟(jì)價(jià)值的魚(yú)類，曾是南海最大宗的高產(chǎn)魚(yú)種，是底拖網(wǎng)作業(yè)的主要捕撈對(duì)象。鲀形目（Tetraodontiformes）魚(yú)類的分子系統(tǒng)學(xué)研究是國(guó)內(nèi)外關(guān)注的熱點(diǎn)，從種至目各分類階元的系統(tǒng)發(fā)育研究中，多數(shù)是利用了部分或全部的線粒體基因組序列。為此，本研究通過(guò)設(shè)計(jì)15對(duì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測(cè)序，首次獲得了黃鰭?cǎi)R面鲀線粒體基因組DNA（MitochondrialDNA, mtDNA）全序列，并結(jié)合馬面鲀屬其它種類的mtDNA進(jìn)行了線粒體全基因組水平的系統(tǒng)發(fā)育分析。黃鰭?cǎi)R面鲀mtDNA基因組序列全長(zhǎng)16438bp，A+T含量為53.5%，其mtDNA由2個(gè)rRNA基因、13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、22個(gè)tRNA基因和1段786bp非編碼的控制區(qū)（D-loop）所組成。除COⅠ起始密碼子為GTG以外，其余蛋白質(zhì)編碼基因均以ATG為起始密碼子。除了COⅡ, ND4和Cyt b使用不完全密碼子（T或TA）為終止密碼子以外，其余均使用典型的終止密碼子TAA或TAG。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNA... 

【文章來(lái)源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】：77 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

基于黃鰭?cǎi)R面鲀等17種魚(yú)類的線粒體基因組核苷酸全序列構(gòu)建的分子系統(tǒng)樹(shù)(a-NJ樹(shù)；b-MP樹(shù))

圖 3-1 黃鰭?cǎi)R面鲀樣本采集地點(diǎn)示意圖Figure 3-1 A sketch map of sampling sites of T. hypargyreus表3-1 黃鰭?cǎi)R面鲀樣本采集信息Table 3-1 Sampling data of T. hypargyreus

圖 3-2 黃鰭?cǎi)R面鲀單倍型的 MJ 網(wǎng)絡(luò)圖(圓圈面積表示單倍型的頻率)Figure 3-2 Median-joining network of the 58 haplotypes of T. hypargyreus(Size of circle was proportional to haplotype frequency)為 H1~H10、H13、H19、H26 和 H27。單倍型 H1 分布最廣，所有群體均有

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
[1]南海北部陸架區(qū)金線魚(yú)（Nemipterus virgatus）種群分子分析[D]. 董麗娜.上海海洋大學(xué) 2011
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本文編號(hào)：3591404