凡納濱對蝦LvJNK沉默的轉(zhuǎn)錄組比較和3種lvp38亞型的功能分析
發(fā)布時間:2022-01-14 02:08
凡納濱對蝦是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)主要的養(yǎng)殖品種,也是水產(chǎn)行業(yè)主要的經(jīng)濟種類。然而,對蝦的各種病害時刻影響對蝦產(chǎn)業(yè)持續(xù)穩(wěn)定健康的發(fā)展,因此,致力于對蝦抗病基因及其相關免疫功能基因的研究,能夠為對蝦病害的防治提供重要的理論基礎。轉(zhuǎn)錄組測序可以分析特定生理條件下細胞內(nèi)所有mRNA的表達水平,因此可以應用于不同實驗條件下特定基因在mRNA表達水平的比較分析。在哺乳動物研究中JNK信號通路是細胞內(nèi)重要的信號通路,能夠參與許多細胞活動。在前期對蝦的研究發(fā)現(xiàn),LvJNK可以被WSSV病毒激活利用。為了深入全面的了解LvJNK在WSSV感染過程中的作用機制,本研究基于二代測序平臺,通過RNA-seq技術手段進行轉(zhuǎn)錄組差異比較分析LvJNK在WSSV感染中的關聯(lián)基因及可能參與的生物學過程。通過轉(zhuǎn)錄組差異比較分析共篩選得到230條差異基因,其中112條基因表達上調(diào),118條基因表達下調(diào)。隨后進一步分析了與JNK功能密切相關且已有相關研究報道的部分差異基因,同時對差異基因進行GO功能分類和KEGG富集分析。以上研究為后續(xù)對蝦JNK通路的深入研究奠定了良好的基礎。p38是MAPK家族中關鍵的應激活化蛋白激酶,可以被多種...
【文章來源】:自然資源部第三海洋研究所福建省
【文章頁數(shù)】:126 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
WSSV結(jié)構示意圖
圖 2 WSSV 中國大陸株基因組結(jié)構圖[7]Fig.2 The genomic structure of the WSSV-CN strainsSSV 功能基因研究SSV 基因編碼的蛋白,主要分為結(jié)構蛋白和非結(jié)構蛋白。結(jié)構蛋白主要蛋白、核衣殼蛋白和被膜蛋白三種,可以維持病毒構型,保護核酸,還病毒對組織及細胞的識別、吸附和侵入。非結(jié)構蛋白主要是與催化、調(diào)酶和蛋白。WSSV 的囊膜蛋白至少由 35 種構成,其中最重要的是 VP26 兩種蛋白,其在囊膜蛋白中含量高達 60%[12]。據(jù)研究報道,VP28 在宿主的最初階段可以與細胞膜上的 PmRab7 蛋白相互作用,輔助病毒與合,進而促進病毒入胞[13; 14]。VP26 可以與細胞的一種骨架蛋白 actin 相來協(xié)助病毒進入細胞后快速接近細胞核以盡快完成自身復制[15]。據(jù)相
圖 3 斑節(jié)對蝦酚氧化酶原激活系統(tǒng)模型[46]Fig.3 Model of proPO-activating system in P.monodon淋巴凝結(jié)反應巴凝結(jié)作用在脊椎動物和無脊椎動物中都發(fā)揮著非常重要的作用口快速的郁結(jié),減少血淋巴流失使傷口愈合,而且在免疫防御方面的作用,可以快速固定病原體并利于清除[51]。凝結(jié)過程主要是血氨酰胺酶調(diào)節(jié),由血漿中的凝結(jié)蛋白通過復雜的交聯(lián)反應形成凝塊谷氨酰胺酶是一種 Ca2+依賴性的蛋白酶,能夠催化某些蛋白(如氨酸和谷氨酰胺之間形成共價鍵。血淋巴凝結(jié)的級聯(lián)反應不僅在鱟中都有研究[31],而且在各對蝦中也有所研究。在中國明對蝦中測血細胞感染 WSSV 后晚期轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶轉(zhuǎn)錄水平明顯下降,證
【參考文獻】:
期刊論文
[1]LRP-1抑制缺氧/復氧誘導的腎細胞損傷[J]. 段斌,職瑾,杜鵬,高妍婷,李振江. 現(xiàn)代醫(yī)學. 2017(12)
[2]中國對蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展軌跡及技術變遷[J]. 周井娟. 中國農(nóng)學通報. 2016(08)
[3]南美白對蝦養(yǎng)殖技術[J]. 沈偉林,張鵬. 農(nóng)民致富之友. 2015(12)
[4]溶藻弧菌感染后凡納濱對蝦鰓組織免疫相關基因的表達[J]. 羅詞興,黃旭雄,李桑,趙利斌,危立坤,陳春燕,劉林林,曾蓓蓓. 中國水產(chǎn)科學. 2014(01)
[5]斑節(jié)對蝦Relish基因的克隆及免疫刺激對其mRNA表達水平的影響[J]. 劉文靜,楊麗詩,李曉蘭,邱麗華,蘇天鳳,楊其彬,江世貴. 中國水產(chǎn)科學. 2013(01)
[6]中國明對蝦caspase基因的克隆與表達分析[J]. 宋光年,金松君,張繼泉,相建海. 海洋科學. 2010(12)
[7]中國明對蝦Rel/NF-κB家族基因在弧菌刺激下的表達[J]. 閻慧,李富花,王兵,張繼泉,馬洪明,相建海. 海洋與湖沼. 2008(06)
[8]LPS影響p38蛋白在單核細胞內(nèi)定位[J]. 張琳,劉怒云,姜勇,李慶林,張璐. 中國病理生理雜志. 2007(06)
[9]甲殼動物血細胞及其在免疫防御中的功能[J]. 姚翠鸞,王志勇,相建海. 動物學研究. 2006(05)
[10]蝦類免疫機制的特點及其免疫增強劑的研究進展[J]. 李紅權,劉燕. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2006(08)
碩士論文
[1]斑節(jié)對蝦JNK信號通路中的JNK、C-JUN和ATF-2基因的克隆與功能研究[D]. 時恭芳.上海海洋大學 2017
[2]中國明對蝦Rac1/PI3K/Akt通路相關基因的克隆和功能關系的初步研究[D]. 遲艷紅.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2012
本文編號:3587596
【文章來源】:自然資源部第三海洋研究所福建省
【文章頁數(shù)】:126 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
WSSV結(jié)構示意圖
圖 2 WSSV 中國大陸株基因組結(jié)構圖[7]Fig.2 The genomic structure of the WSSV-CN strainsSSV 功能基因研究SSV 基因編碼的蛋白,主要分為結(jié)構蛋白和非結(jié)構蛋白。結(jié)構蛋白主要蛋白、核衣殼蛋白和被膜蛋白三種,可以維持病毒構型,保護核酸,還病毒對組織及細胞的識別、吸附和侵入。非結(jié)構蛋白主要是與催化、調(diào)酶和蛋白。WSSV 的囊膜蛋白至少由 35 種構成,其中最重要的是 VP26 兩種蛋白,其在囊膜蛋白中含量高達 60%[12]。據(jù)研究報道,VP28 在宿主的最初階段可以與細胞膜上的 PmRab7 蛋白相互作用,輔助病毒與合,進而促進病毒入胞[13; 14]。VP26 可以與細胞的一種骨架蛋白 actin 相來協(xié)助病毒進入細胞后快速接近細胞核以盡快完成自身復制[15]。據(jù)相
圖 3 斑節(jié)對蝦酚氧化酶原激活系統(tǒng)模型[46]Fig.3 Model of proPO-activating system in P.monodon淋巴凝結(jié)反應巴凝結(jié)作用在脊椎動物和無脊椎動物中都發(fā)揮著非常重要的作用口快速的郁結(jié),減少血淋巴流失使傷口愈合,而且在免疫防御方面的作用,可以快速固定病原體并利于清除[51]。凝結(jié)過程主要是血氨酰胺酶調(diào)節(jié),由血漿中的凝結(jié)蛋白通過復雜的交聯(lián)反應形成凝塊谷氨酰胺酶是一種 Ca2+依賴性的蛋白酶,能夠催化某些蛋白(如氨酸和谷氨酰胺之間形成共價鍵。血淋巴凝結(jié)的級聯(lián)反應不僅在鱟中都有研究[31],而且在各對蝦中也有所研究。在中國明對蝦中測血細胞感染 WSSV 后晚期轉(zhuǎn)谷氨酰胺酶轉(zhuǎn)錄水平明顯下降,證
【參考文獻】:
期刊論文
[1]LRP-1抑制缺氧/復氧誘導的腎細胞損傷[J]. 段斌,職瑾,杜鵬,高妍婷,李振江. 現(xiàn)代醫(yī)學. 2017(12)
[2]中國對蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展軌跡及技術變遷[J]. 周井娟. 中國農(nóng)學通報. 2016(08)
[3]南美白對蝦養(yǎng)殖技術[J]. 沈偉林,張鵬. 農(nóng)民致富之友. 2015(12)
[4]溶藻弧菌感染后凡納濱對蝦鰓組織免疫相關基因的表達[J]. 羅詞興,黃旭雄,李桑,趙利斌,危立坤,陳春燕,劉林林,曾蓓蓓. 中國水產(chǎn)科學. 2014(01)
[5]斑節(jié)對蝦Relish基因的克隆及免疫刺激對其mRNA表達水平的影響[J]. 劉文靜,楊麗詩,李曉蘭,邱麗華,蘇天鳳,楊其彬,江世貴. 中國水產(chǎn)科學. 2013(01)
[6]中國明對蝦caspase基因的克隆與表達分析[J]. 宋光年,金松君,張繼泉,相建海. 海洋科學. 2010(12)
[7]中國明對蝦Rel/NF-κB家族基因在弧菌刺激下的表達[J]. 閻慧,李富花,王兵,張繼泉,馬洪明,相建海. 海洋與湖沼. 2008(06)
[8]LPS影響p38蛋白在單核細胞內(nèi)定位[J]. 張琳,劉怒云,姜勇,李慶林,張璐. 中國病理生理雜志. 2007(06)
[9]甲殼動物血細胞及其在免疫防御中的功能[J]. 姚翠鸞,王志勇,相建海. 動物學研究. 2006(05)
[10]蝦類免疫機制的特點及其免疫增強劑的研究進展[J]. 李紅權,劉燕. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2006(08)
碩士論文
[1]斑節(jié)對蝦JNK信號通路中的JNK、C-JUN和ATF-2基因的克隆與功能研究[D]. 時恭芳.上海海洋大學 2017
[2]中國明對蝦Rac1/PI3K/Akt通路相關基因的克隆和功能關系的初步研究[D]. 遲艷紅.中國科學院研究生院(海洋研究所) 2012
本文編號:3587596
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