第一章 草魚（Ctenopharyngodon idellus）HMGCR基因的全長(zhǎng)克隆、生物信息學(xué)分析及組織表達(dá)分析3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶（3-hydroxy-3-methylglutaryl Co A reductase,HMGCR）是內(nèi)源性膽固醇合成的關(guān)鍵限速酶,在維持膽固醇穩(wěn)態(tài)方面具有重要作用。本實(shí)驗(yàn)利用c DNA末端快速擴(kuò)增（RACE）法獲得了草魚HMGCR基因的c DNA全序列。HMGCR全長(zhǎng)3594bp,5’端非編碼區(qū)（5’-UTR）長(zhǎng)77bp,3’端非編碼區(qū)（3’-UTR）長(zhǎng)988bp,開放閱讀框（ORF）為2529bp,編碼842個(gè)氨基酸組成的多肽鏈,分子量91.48k D,理論等電點(diǎn)6.27。草魚HMGCR蛋白包括兩個(gè)結(jié)構(gòu)域:氨基端復(fù)雜的復(fù)雜的跨膜區(qū)域（Asp62-Leu219）和羧基端細(xì)胞溶質(zhì)催化區(qū)域（Asn419-Arg826）,這兩個(gè)序列通過一個(gè)可變的親水接頭序列（Val220-Ser418）連接起來,存在一個(gè)磷酸化位點(diǎn)（Ser827）和一個(gè)催化活性位點(diǎn)（His821）,前39個(gè)氨基酸殘基（Met1-Ala39）為信號(hào)肽。由氨基酸同源性分析和進(jìn)化... 

【文章來源】：蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：111 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

HMGCRcDNA全序列及預(yù)測(cè)的氨基酸序列

圖 1-3 HMGCR 蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象模擬圖Fig.1-3 Predicted tertiary structure of HMGR 氨基酸與其他已知物種 HMGCR 的氨基酸序nt identity and similarity of C. idellus HMGCR ato those of other species amino acid sequences注冊(cè)號(hào)accessionnumber同源性／％identity相siio NP_001014314 89% xXP_007252844XP_003981124.178%68%EHH54336 67% ulus AAH85083 67% ens NP_000850 67%

Fig.1-3 Predicted tertiary structure of HMGCR表 1-5 HMGCR 氨基酸與其他已知物種 HMGCR 的氨基酸序列同源性分析Tab1-5 Percent identity and similarity of C. idellus HMGCR amino acid sequencesto those of other species amino acid sequences物種species注冊(cè)號(hào)accessionnumber同源性／％identity相似性／％similarity氨基酸數(shù)目aminoacids斑馬魚 Danio rerio NP_001014314 89% 100% 845麗脂鯉 Astyanaxmexicanus家貓 Felis catusXP_007252844XP_003981124.178%68%99%99%873888食蟹猴 MacacafascicularisEHH54336 67% 99% 888家鼠 Mus musculus AAH85083 67% 99% 887人 Homo sapiens NP_000850 67% 99% 888牛 Bos taurus NP_001099083 67% 99% 888

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]腸道損傷對(duì)草魚膽固醇代謝通路基因表達(dá)的影響[J]. 黃雨薇,葉元土,蔡春芳,劉漢超,陳科全,張寶彤,蕭培珍,彭侃,徐登輝.  南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(03)
[2]池塘養(yǎng)殖條件下草魚（Ctenopharyngodon idelluspond）腸道黏膜細(xì)胞緊密連接蛋白基因表達(dá)水平的研究[J]. 黃雨薇,葉元土,蔡春芳,許凡,陳科全,劉漢超,張寶彤,蕭培珍,彭侃,徐登輝.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(01)
[3]灌喂氧化魚油使草魚腸道黏膜膽固醇膽汁酸合成基因通路表達(dá)上調(diào)[J]. 葉元土,蔡春芳,許凡,董嬌嬌,張寶彤,蕭培珍.  水生生物學(xué)報(bào). 2015(01)
[4]丙二醛對(duì)離體草魚腸道黏膜細(xì)胞的損傷作用[J]. 姚仕彬,葉元土,蔡春芳,張寶彤,蕭培珍,劉漢超,黃雨薇.  水生生物學(xué)報(bào). 2015(01)
[5]氧化豆油水溶物對(duì)離體草魚腸道黏膜細(xì)胞的損傷作用[J]. 姚仕彬,葉元土,蔡春芳,姚林杰,許凡,劉猛,張寶彤,蕭培珍,王麗宏.  水生生物學(xué)報(bào). 2014(04)
[6]膽固醇代謝調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 李天平,軒貴平,庹勤慧.  臨床與病理雜志. 2014(01)
[7]豆粕替代魚粉對(duì)魚類膽固醇代謝影響的研究進(jìn)展[J]. 漢雪梅,張曦,陶琳麗,鄧君明.  云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2013(05)
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[9]飼料中添加膽汁酸對(duì)軍曹魚生長(zhǎng)及體組成的影響[J]. 周書耘,劉永堅(jiān),梁海鷗,趙麗梅,田麗霞,陽(yáng)會(huì)軍,梁桂英.  南方水產(chǎn). 2010(04)
[10]阻斷腸肝循環(huán)原理的臨床意義及其研究進(jìn)展[J]. 魏科達(dá),肖平,方平飛,趙緒元.  中國(guó)藥學(xué)雜志. 2009(21)

博士論文
[1]在高植物蛋白飼料中添加膽固醇、�；撬岷痛蠖乖磉皩�(duì)大菱鲆生長(zhǎng)性能和膽固醇代謝的影響[D]. 贠彪.中國(guó)海洋大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3584323