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藍藻ITS序列拷貝類型、進化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)適用性分析

發(fā)布時間:2022-01-11 23:24
  藍藻16S rRNA-23S rRNA基因間隔區(qū)(16S rRNA-23S rRNAinternal transcribedspacer, ITS)序列在長度和堿基組成上具有較高的變異性,因此有學(xué)者將其應(yīng)用于藍藻分類鑒定及系統(tǒng)發(fā)育研究。然而目前報道的藍藻ITS序列拷貝分布情況以及不同拷貝類型間進化關(guān)系分析等數(shù)據(jù)有限,且ITS序列是否適用于藍藻種水平分類階元的研究亦存在爭議。鑒于以上原因,本課題就藍藻ITS序列的拷貝分布情況、不同拷貝類型之間的進化關(guān)系及其系統(tǒng)學(xué)研究適用性進行分析。采用形態(tài)學(xué)方法和基于16S rRNA基因的分子生物學(xué)方法對24株藍藻樣品進行分類鑒定;PCR擴增檢測ITS序列拷貝分布情況;割膠回收擴增的拷貝條帶并克隆測序。結(jié)果顯示:(1)藍藻的ITS序列至少存在三種拷貝類型,即ITS-IA型(同時攜帶tRNAIle和tRNAAla編碼區(qū)的ITS)、ITS-I型(只攜帶tRNAIle編碼區(qū)的ITS)、ITS-N型(無tRNA編碼區(qū)的ITS);(2)色球藻目藻株的ITS序列均為單一拷貝類型(僅有ITS-IA或ITS-I型);顫藻目藻株的ITS序列為單一拷貝類型(僅有ITS-IA... 

【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

藍藻ITS序列拷貝類型、進化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)適用性分析


rrn操縱子的結(jié)構(gòu)示意圖

藍藻ITS序列拷貝類型、進化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)適用性分析


藍藻樣品2-E4—7-D616SrRNA基因PCR擴增瓊脂糖凝膠電泳分析

藍藻ITS序列拷貝類型、進化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)適用性分析


藍藻樣品3-H3—6-D616SrRNA基因PCR擴增瓊脂糖凝膠電泳分析

【參考文獻】:
期刊論文
[1]蘇鐵珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷貝研究[J]. 粟絨,焦淑靜,黃現(xiàn)恩,張青,史全良.  現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展. 2014(15)
[2]基于ITS序列分析對紫花地丁的分子鑒別[J]. 朱燁,張春,莊元春,稅丕先.  中華中醫(yī)藥雜志. 2013(04)
[3]天麻ITS-1測序及單核苷酸多態(tài)性變異位點分析[J]. 王德信.  生物技術(shù). 2012(05)
[4]地木耳實用價值的研究[J]. 袁云香.  農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2011(12)
[5]微囊藻毒素神經(jīng)毒理學(xué)研究進展[J]. 居靜娟,浦躍樸,尹立紅,王大勇.  生態(tài)毒理學(xué)報. 2011(01)
[6]不同生長基質(zhì)中葉狀地衣共生藻的分離與鑒定[J]. 張青,史全良.  生態(tài)環(huán)境學(xué)報. 2010(12)
[7]地衣中共生念珠藻多拷貝序列的初步分析[J]. 史全良,卜復(fù)鳴,韓梅.  蘇州大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2005(04)
[8]AFLP分子標記技術(shù)的發(fā)展及其在海洋生物中的應(yīng)用[J]. 王偉繼,岳志芹,孔杰,王清印.  海洋水產(chǎn)研究. 2005(01)
[9]聚球藻(Synechococcus)分子生態(tài)學(xué)研究進展[J]. 馬英,焦念志.  自然科學(xué)進展. 2004(09)
[10]脂類分析在海洋微藻化學(xué)分類學(xué)上的研究進展[J]. 徐繼林,嚴小軍.  海洋通報. 2004(02)

博士論文
[1]藍藻念珠藻屬系統(tǒng)發(fā)育和分子進化研究[D]. 韓丹翔.中國科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006

碩士論文
[1]藍藻16S rRNA-23S rRNA基因間隔區(qū)序列(ITS)多拷貝分析[D]. 粟絨.蘇州大學(xué) 2013
[2]藍藻型地衣及其共生念珠藻的分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 雷海燕.蘇州大學(xué) 2009
[3]生物結(jié)皮中藍藻多樣性及其環(huán)境應(yīng)用研究[D]. 蘇振宏.西北師范大學(xué) 2006



本文編號:3583642

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