藍(lán)藻ITS序列拷貝類型、進(jìn)化關(guān)系及系統(tǒng)學(xué)適用性分析
發(fā)布時(shí)間:2022-01-11 23:24
藍(lán)藻16S rRNA-23S rRNA基因間隔區(qū)(16S rRNA-23S rRNAinternal transcribedspacer, ITS)序列在長(zhǎng)度和堿基組成上具有較高的變異性,因此有學(xué)者將其應(yīng)用于藍(lán)藻分類鑒定及系統(tǒng)發(fā)育研究。然而目前報(bào)道的藍(lán)藻ITS序列拷貝分布情況以及不同拷貝類型間進(jìn)化關(guān)系分析等數(shù)據(jù)有限,且ITS序列是否適用于藍(lán)藻種水平分類階元的研究亦存在爭(zhēng)議。鑒于以上原因,本課題就藍(lán)藻ITS序列的拷貝分布情況、不同拷貝類型之間的進(jìn)化關(guān)系及其系統(tǒng)學(xué)研究適用性進(jìn)行分析。采用形態(tài)學(xué)方法和基于16S rRNA基因的分子生物學(xué)方法對(duì)24株藍(lán)藻樣品進(jìn)行分類鑒定;PCR擴(kuò)增檢測(cè)ITS序列拷貝分布情況;割膠回收擴(kuò)增的拷貝條帶并克隆測(cè)序。結(jié)果顯示:(1)藍(lán)藻的ITS序列至少存在三種拷貝類型,即ITS-IA型(同時(shí)攜帶tRNAIle和tRNAAla編碼區(qū)的ITS)、ITS-I型(只攜帶tRNAIle編碼區(qū)的ITS)、ITS-N型(無tRNA編碼區(qū)的ITS);(2)色球藻目藻株的ITS序列均為單一拷貝類型(僅有ITS-IA或ITS-I型);顫藻目藻株的ITS序列為單一拷貝類型(僅有ITS-IA...
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
rrn操縱子的結(jié)構(gòu)示意圖
藍(lán)藻樣品2-E4—7-D616SrRNA基因PCR擴(kuò)增瓊脂糖凝膠電泳分析
藍(lán)藻樣品3-H3—6-D616SrRNA基因PCR擴(kuò)增瓊脂糖凝膠電泳分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘇鐵珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷貝研究[J]. 粟絨,焦淑靜,黃現(xiàn)恩,張青,史全良. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(15)
[2]基于ITS序列分析對(duì)紫花地丁的分子鑒別[J]. 朱燁,張春,莊元春,稅丕先. 中華中醫(yī)藥雜志. 2013(04)
[3]天麻ITS-1測(cè)序及單核苷酸多態(tài)性變異位點(diǎn)分析[J]. 王德信. 生物技術(shù). 2012(05)
[4]地木耳實(shí)用價(jià)值的研究[J]. 袁云香. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2011(12)
[5]微囊藻毒素神經(jīng)毒理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 居靜娟,浦躍樸,尹立紅,王大勇. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2011(01)
[6]不同生長(zhǎng)基質(zhì)中葉狀地衣共生藻的分離與鑒定[J]. 張青,史全良. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2010(12)
[7]地衣中共生念珠藻多拷貝序列的初步分析[J]. 史全良,卜復(fù)鳴,韓梅. 蘇州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2005(04)
[8]AFLP分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及其在海洋生物中的應(yīng)用[J]. 王偉繼,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水產(chǎn)研究. 2005(01)
[9]聚球藻(Synechococcus)分子生態(tài)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 馬英,焦念志. 自然科學(xué)進(jìn)展. 2004(09)
[10]脂類分析在海洋微藻化學(xué)分類學(xué)上的研究進(jìn)展[J]. 徐繼林,嚴(yán)小軍. 海洋通報(bào). 2004(02)
博士論文
[1]藍(lán)藻念珠藻屬系統(tǒng)發(fā)育和分子進(jìn)化研究[D]. 韓丹翔.中國(guó)科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
碩士論文
[1]藍(lán)藻16S rRNA-23S rRNA基因間隔區(qū)序列(ITS)多拷貝分析[D]. 粟絨.蘇州大學(xué) 2013
[2]藍(lán)藻型地衣及其共生念珠藻的分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 雷海燕.蘇州大學(xué) 2009
[3]生物結(jié)皮中藍(lán)藻多樣性及其環(huán)境應(yīng)用研究[D]. 蘇振宏.西北師范大學(xué) 2006
本文編號(hào):3583642
【文章來源】:蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:83 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
rrn操縱子的結(jié)構(gòu)示意圖
藍(lán)藻樣品2-E4—7-D616SrRNA基因PCR擴(kuò)增瓊脂糖凝膠電泳分析
藍(lán)藻樣品3-H3—6-D616SrRNA基因PCR擴(kuò)增瓊脂糖凝膠電泳分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蘇鐵珊瑚根共生念珠藻ITS序列多拷貝研究[J]. 粟絨,焦淑靜,黃現(xiàn)恩,張青,史全良. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2014(15)
[2]基于ITS序列分析對(duì)紫花地丁的分子鑒別[J]. 朱燁,張春,莊元春,稅丕先. 中華中醫(yī)藥雜志. 2013(04)
[3]天麻ITS-1測(cè)序及單核苷酸多態(tài)性變異位點(diǎn)分析[J]. 王德信. 生物技術(shù). 2012(05)
[4]地木耳實(shí)用價(jià)值的研究[J]. 袁云香. 農(nóng)產(chǎn)品加工(學(xué)刊). 2011(12)
[5]微囊藻毒素神經(jīng)毒理學(xué)研究進(jìn)展[J]. 居靜娟,浦躍樸,尹立紅,王大勇. 生態(tài)毒理學(xué)報(bào). 2011(01)
[6]不同生長(zhǎng)基質(zhì)中葉狀地衣共生藻的分離與鑒定[J]. 張青,史全良. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2010(12)
[7]地衣中共生念珠藻多拷貝序列的初步分析[J]. 史全良,卜復(fù)鳴,韓梅. 蘇州大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2005(04)
[8]AFLP分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展及其在海洋生物中的應(yīng)用[J]. 王偉繼,岳志芹,孔杰,王清印. 海洋水產(chǎn)研究. 2005(01)
[9]聚球藻(Synechococcus)分子生態(tài)學(xué)研究進(jìn)展[J]. 馬英,焦念志. 自然科學(xué)進(jìn)展. 2004(09)
[10]脂類分析在海洋微藻化學(xué)分類學(xué)上的研究進(jìn)展[J]. 徐繼林,嚴(yán)小軍. 海洋通報(bào). 2004(02)
博士論文
[1]藍(lán)藻念珠藻屬系統(tǒng)發(fā)育和分子進(jìn)化研究[D]. 韓丹翔.中國(guó)科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2006
碩士論文
[1]藍(lán)藻16S rRNA-23S rRNA基因間隔區(qū)序列(ITS)多拷貝分析[D]. 粟絨.蘇州大學(xué) 2013
[2]藍(lán)藻型地衣及其共生念珠藻的分子鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 雷海燕.蘇州大學(xué) 2009
[3]生物結(jié)皮中藍(lán)藻多樣性及其環(huán)境應(yīng)用研究[D]. 蘇振宏.西北師范大學(xué) 2006
本文編號(hào):3583642
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