長江、黃河、遼河水系中華絨螯蟹野生群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析
發(fā)布時間:2022-01-11 08:21
與傳統(tǒng)的遺傳標(biāo)記不同,分子標(biāo)記可以從DNA水平上體現(xiàn)出物種的遺傳多樣性,其中微衛(wèi)星DNA標(biāo)記由于具備諸多優(yōu)點(diǎn),通常被認(rèn)為是群體遺傳多樣性分析的理想標(biāo)記。微衛(wèi)星標(biāo)記用于中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)群體遺傳學(xué)分析的研究已有一些報道,然而之前報道由于采樣時間較早、水域不同加之中華絨螯蟹(河蟹)野生群體的生存繁衍處在動態(tài)變化中,長江、黃河、遼河三個主產(chǎn)水系的遺傳現(xiàn)狀尚存在不確定性,進(jìn)一步的種質(zhì)評價工作有待進(jìn)行。本研究針對中華絨螯蟹種群遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析這一目標(biāo),為更好的開展微衛(wèi)星分子標(biāo)記在河蟹種群遺傳分析上的應(yīng)用,首先從優(yōu)化DNA提取方法入手,然后比較優(yōu)選微衛(wèi)星PCR產(chǎn)物分型技術(shù),最后通過對長江、黃河和遼河三個水系野生河蟹種群的遺傳結(jié)構(gòu)加以分析,以期獲得河蟹主產(chǎn)水系野生群體的當(dāng)前的種質(zhì)資源狀況,對河蟹遺傳育種工作提供基礎(chǔ)資料。1.為優(yōu)化中華絨螯蟹基因組DNA提取方法,本試驗采用酚-氯仿法和吸附柱型試劑盒分別對中華絨螯蟹的鰓、肌肉、血淋巴液和剛毛4種組織進(jìn)行DNA提取,并從純度、濃度、片段完整性及微衛(wèi)星標(biāo)記PCR擴(kuò)增效果共4個方面評價提取DNA的質(zhì)量。結(jié)果顯示:使用酚-...
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1兩種方法對5種材料提取所得DNA電泳結(jié)果
圖 2-2 兩種提取方法下不同組織中 DNA 的微衛(wèi)星 PCR 產(chǎn)物電泳圖2 PAGE profile of PCR product from DNA extracted from 5 kinds of materialmethods
每兩個加入了不同顏色熒光標(biāo)記的位點(diǎn)的 PCR 產(chǎn)物混合后,使用甲酰胺變性,以 ROX-500 作為分子量內(nèi)標(biāo),使用 ABI-3730XL 全自動 DNA 測序儀進(jìn)行檢測分析。GeneMaper-3.5 掃描峰圖(見圖 3-1),讀取目標(biāo)峰所代表的等位基因片段長度,將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 Microsoft excel 中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中華絨螯蟹37個多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記在親子遺傳中的分離方式分析[J]. 熊良偉,劉志強(qiáng),嚴(yán)銀龍,邱高峰. 水產(chǎn)學(xué)報. 2015(02)
[2]中華絨螯蟹RXR基因全長cDNA克隆及表達(dá)分析[J]. 王瑤,楊志剛,郭子好,姚琴琴,曾奇韜,楊筱珍,成永旭. 水產(chǎn)學(xué)報. 2013(12)
[3]杉木育種群體SSR分子標(biāo)記遺傳多樣性分析[J]. 歐陽磊,陳金慧,鄭仁華,徐陽,林宇峰,黃金華,葉代全,方揚(yáng)輝,施季森. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(01)
[4]SSR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測方法比較及其實驗操作注意事項[J]. 戴劍,張云輝. 種子. 2013(09)
[5]中華絨螯蟹遺傳育種研究進(jìn)展[J]. 張世勇,傅洪拓,喬慧,孫盛明. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(20)
[6]中華絨螯蟹3個育種基礎(chǔ)群體遺傳特征的微衛(wèi)星分析[J]. 唐劉秀,許志強(qiáng),葛家春,陳乙榮,趙沐子,楊家新. 南京師大學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(02)
[7]“光合1號”中華絨螯蟹微衛(wèi)星富集文庫的構(gòu)建與多態(tài)性標(biāo)記的篩選[J]. 田盛君,李曉東,姜玉聲,劉胥,楊紅威,原振政,鄭巖. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2013(03)
[8]酚/氯仿法和鹽析法提取人類外周血基因組DNA方法的比較[J]. 宋潔云,劉芳宏,馬軍,陳遠(yuǎn)帆,王?. 中國實驗診斷學(xué). 2013(05)
[9]利用微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記分析中華絨螯蟹養(yǎng)殖群體遺傳分化[J]. 熊良偉,李真,馬克異,邱高峰. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2012(12)
[10]草魚野生群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析[J]. 傅建軍,李家樂,沈玉幫,王榮泉,宣云峰,徐曉雁,陳勇. 遺傳. 2013(02)
碩士論文
[1]三疣梭子蟹微衛(wèi)星富集文庫的構(gòu)建及五個野生地理群的多樣性分析[D]. 李曉萍.中國海洋大學(xué) 2010
[2]中華絨螯蟹經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[D]. 付春鵬.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]六個馬品種的SSR遺傳多樣性分析[D]. 布仁其其格.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]區(qū)域特色農(nóng)業(yè)的培育研究[D]. 金旭輝.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號:3582452
【文章來源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1兩種方法對5種材料提取所得DNA電泳結(jié)果
圖 2-2 兩種提取方法下不同組織中 DNA 的微衛(wèi)星 PCR 產(chǎn)物電泳圖2 PAGE profile of PCR product from DNA extracted from 5 kinds of materialmethods
每兩個加入了不同顏色熒光標(biāo)記的位點(diǎn)的 PCR 產(chǎn)物混合后,使用甲酰胺變性,以 ROX-500 作為分子量內(nèi)標(biāo),使用 ABI-3730XL 全自動 DNA 測序儀進(jìn)行檢測分析。GeneMaper-3.5 掃描峰圖(見圖 3-1),讀取目標(biāo)峰所代表的等位基因片段長度,將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 Microsoft excel 中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中華絨螯蟹37個多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記在親子遺傳中的分離方式分析[J]. 熊良偉,劉志強(qiáng),嚴(yán)銀龍,邱高峰. 水產(chǎn)學(xué)報. 2015(02)
[2]中華絨螯蟹RXR基因全長cDNA克隆及表達(dá)分析[J]. 王瑤,楊志剛,郭子好,姚琴琴,曾奇韜,楊筱珍,成永旭. 水產(chǎn)學(xué)報. 2013(12)
[3]杉木育種群體SSR分子標(biāo)記遺傳多樣性分析[J]. 歐陽磊,陳金慧,鄭仁華,徐陽,林宇峰,黃金華,葉代全,方揚(yáng)輝,施季森. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(01)
[4]SSR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測方法比較及其實驗操作注意事項[J]. 戴劍,張云輝. 種子. 2013(09)
[5]中華絨螯蟹遺傳育種研究進(jìn)展[J]. 張世勇,傅洪拓,喬慧,孫盛明. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2013(20)
[6]中華絨螯蟹3個育種基礎(chǔ)群體遺傳特征的微衛(wèi)星分析[J]. 唐劉秀,許志強(qiáng),葛家春,陳乙榮,趙沐子,楊家新. 南京師大學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(02)
[7]“光合1號”中華絨螯蟹微衛(wèi)星富集文庫的構(gòu)建與多態(tài)性標(biāo)記的篩選[J]. 田盛君,李曉東,姜玉聲,劉胥,楊紅威,原振政,鄭巖. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2013(03)
[8]酚/氯仿法和鹽析法提取人類外周血基因組DNA方法的比較[J]. 宋潔云,劉芳宏,馬軍,陳遠(yuǎn)帆,王?. 中國實驗診斷學(xué). 2013(05)
[9]利用微衛(wèi)星DNA分子標(biāo)記分析中華絨螯蟹養(yǎng)殖群體遺傳分化[J]. 熊良偉,李真,馬克異,邱高峰. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2012(12)
[10]草魚野生群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析[J]. 傅建軍,李家樂,沈玉幫,王榮泉,宣云峰,徐曉雁,陳勇. 遺傳. 2013(02)
碩士論文
[1]三疣梭子蟹微衛(wèi)星富集文庫的構(gòu)建及五個野生地理群的多樣性分析[D]. 李曉萍.中國海洋大學(xué) 2010
[2]中華絨螯蟹經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選[D]. 付春鵬.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[3]六個馬品種的SSR遺傳多樣性分析[D]. 布仁其其格.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[4]區(qū)域特色農(nóng)業(yè)的培育研究[D]. 金旭輝.揚(yáng)州大學(xué) 2004
本文編號:3582452
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