基于線粒體COI基因序列研究口蝦蛄群體的遺傳多樣性及微衛(wèi)星引物的開發(fā)
發(fā)布時(shí)間:2022-01-08 15:44
口蝦蛄隸屬于蝦蛄科,口蝦蛄屬,廣泛分布于印度洋-太平洋海域?谖r蛄因其肉味鮮美和營(yíng)養(yǎng)豐富,是一種具有較高經(jīng)濟(jì)價(jià)值的優(yōu)良野生品種。對(duì)采自皮口、綏中、青島和廣州4個(gè)海域的口蝦蛄群體的線粒體CO I基因序列進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,比較并分析了其遺傳多樣性和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。研究獲得585bp的口蝦蛄線粒體CO I基因序列,變異位點(diǎn)54個(gè),占總位點(diǎn)數(shù)的9.2%。CO I基因序列A+T含量(64.8%)顯著高于G+T含量(35.2%),符合節(jié)肢動(dòng)物線粒體DNA堿基組成的特點(diǎn)。轉(zhuǎn)換與顛換的平均比值是7.84,堿基替換未達(dá)到飽和。100個(gè)樣本的線粒體CO I基因序列共定義35個(gè)單倍型,單倍型多樣性(Hd)為0.9616,平均核苷酸多樣性(π)為0.02027。4個(gè)群體均具有高的單倍型多樣性和低的核苷酸多樣性的特點(diǎn),說(shuō)明4個(gè)海域口蝦蛄的遺傳多樣性均處于中等水平,但廣州海域的遺傳多樣性水平最高。AMOVA分析表明,來(lái)自于群體間的遺傳差異(84.53%)明顯高于來(lái)自群體內(nèi)的差異(15.47%)。遺傳分化系數(shù)(Fst)表明皮口、綏中、青島3個(gè)海域間幾乎沒有發(fā)生分化(Fst<0),而廣州海域口蝦蛄遺傳分化較大。從Genb...
【文章來(lái)源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
同工酶實(shí)驗(yàn)操作流程
圖..例俄加甘..位dk創(chuàng)口門協(xié)?SIP}:‘書1R+曲該狡忽GT公..創(chuàng).dra}hareo7sand舊.日月仙rarn嘆
RFLP標(biāo)記基本原理
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]口蝦蛄乙酸乙酯提取物聯(lián)合阿霉素或順鉑對(duì)人肝癌HepG2細(xì)胞的增殖抑制效應(yīng)研究[J]. 邵松軍,李明勇,張湘寧,黃培春. 中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù). 2013(05)
[2]口蝦蛄提取物對(duì)人鼻咽癌細(xì)胞遷移和體外血管生成擬態(tài)的抑制作用[J]. 孔霞,尚九龍,李麗,吳孟晏,別延紅,顧帝水. 中國(guó)病理生理雜志. 2013(06)
[3]黃海海域口蝦蛄種群的遺傳多樣性[J]. 張代臻,丁鴿,周婷婷,楊文娟,李佳,彭旭,唐伯平. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2013(02)
[4]浙江南部近岸海域春季口蝦蛄(Oratosquilla oratoria)生物量的時(shí)空分布[J]. 潘國(guó)良,張龍,朱增軍,王忠明,張洪亮. 海洋與湖沼. 2013(02)
[5]江蘇連云港與鹽城海域口蝦蛄種群的遺傳多樣性[J]. 張代臻,丁鴿,彭旭,周婷婷,楊文娟,曹金,李佳,劉超,黃楠,殷劍鋒,唐伯平. 四川動(dòng)物. 2013(01)
[6]三疣梭子蟹微衛(wèi)星標(biāo)記與生長(zhǎng)相關(guān)性狀的相關(guān)性分析[J]. 劉磊,李健,劉萍,趙法箴,高保全,杜盈,馬春艷. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(07)
[7]脊尾白蝦微衛(wèi)星富集文庫(kù)的構(gòu)建與多態(tài)性標(biāo)記的篩選[J]. 賈舒雯,劉萍,韓智科,李健,潘魯青. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]口蝦蛄肝胰臟超氧化物歧化酶的分離純化及部分性質(zhì)的研究[J]. 柯佳穎,陳細(xì)香,陳寅山,戴聰杰. 水產(chǎn)科學(xué). 2011(09)
[9]基于線粒體DNA部分片段探討條石鯛與斑石鯛的親緣關(guān)系[J]. 肖志忠,肖永雙,馬道遠(yuǎn),徐世宏,劉清華,李軍. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2011(05)
[10]天津海域口蝦蛄群體結(jié)構(gòu)及資源量分析[J]. 谷德賢,劉茂利. 河北漁業(yè). 2011(08)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及應(yīng)用[D]. 戰(zhàn)愛斌.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
碩士論文
[1]脊尾白蝦微衛(wèi)星引物篩選及群體遺傳多樣性分析[D]. 賈舒雯.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
[2]利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)六個(gè)湖北省地方雞群遺傳多樣性的研究[D]. 鄧呈遜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3576830
【文章來(lái)源】:大連海洋大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:48 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
同工酶實(shí)驗(yàn)操作流程
圖..例俄加甘..位dk創(chuàng)口門協(xié)?SIP}:‘書1R+曲該狡忽GT公..創(chuàng).dra}hareo7sand舊.日月仙rarn嘆
RFLP標(biāo)記基本原理
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]口蝦蛄乙酸乙酯提取物聯(lián)合阿霉素或順鉑對(duì)人肝癌HepG2細(xì)胞的增殖抑制效應(yīng)研究[J]. 邵松軍,李明勇,張湘寧,黃培春. 中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù). 2013(05)
[2]口蝦蛄提取物對(duì)人鼻咽癌細(xì)胞遷移和體外血管生成擬態(tài)的抑制作用[J]. 孔霞,尚九龍,李麗,吳孟晏,別延紅,顧帝水. 中國(guó)病理生理雜志. 2013(06)
[3]黃海海域口蝦蛄種群的遺傳多樣性[J]. 張代臻,丁鴿,周婷婷,楊文娟,李佳,彭旭,唐伯平. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2013(02)
[4]浙江南部近岸海域春季口蝦蛄(Oratosquilla oratoria)生物量的時(shí)空分布[J]. 潘國(guó)良,張龍,朱增軍,王忠明,張洪亮. 海洋與湖沼. 2013(02)
[5]江蘇連云港與鹽城海域口蝦蛄種群的遺傳多樣性[J]. 張代臻,丁鴿,彭旭,周婷婷,楊文娟,曹金,李佳,劉超,黃楠,殷劍鋒,唐伯平. 四川動(dòng)物. 2013(01)
[6]三疣梭子蟹微衛(wèi)星標(biāo)記與生長(zhǎng)相關(guān)性狀的相關(guān)性分析[J]. 劉磊,李健,劉萍,趙法箴,高保全,杜盈,馬春艷. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(07)
[7]脊尾白蝦微衛(wèi)星富集文庫(kù)的構(gòu)建與多態(tài)性標(biāo)記的篩選[J]. 賈舒雯,劉萍,韓智科,李健,潘魯青. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2011(12)
[8]口蝦蛄肝胰臟超氧化物歧化酶的分離純化及部分性質(zhì)的研究[J]. 柯佳穎,陳細(xì)香,陳寅山,戴聰杰. 水產(chǎn)科學(xué). 2011(09)
[9]基于線粒體DNA部分片段探討條石鯛與斑石鯛的親緣關(guān)系[J]. 肖志忠,肖永雙,馬道遠(yuǎn),徐世宏,劉清華,李軍. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2011(05)
[10]天津海域口蝦蛄群體結(jié)構(gòu)及資源量分析[J]. 谷德賢,劉茂利. 河北漁業(yè). 2011(08)
博士論文
[1]櫛孔扇貝(Chlamys farreri)微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及應(yīng)用[D]. 戰(zhàn)愛斌.中國(guó)海洋大學(xué) 2007
碩士論文
[1]脊尾白蝦微衛(wèi)星引物篩選及群體遺傳多樣性分析[D]. 賈舒雯.中國(guó)海洋大學(xué) 2012
[2]利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)六個(gè)湖北省地方雞群遺傳多樣性的研究[D]. 鄧呈遜.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005
本文編號(hào):3576830
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