中華絨螯蟹轉(zhuǎn)鐵蛋白在螺原體致病過程中的功能研究
發(fā)布時間:2022-01-08 07:13
中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)即河蟹、大閘蟹,在我國淡水養(yǎng)殖業(yè)中占有相當(dāng)大的比重,能夠創(chuàng)造巨大的經(jīng)濟(jì)價值。近年來,伴隨養(yǎng)殖規(guī)模不斷擴(kuò)大、養(yǎng)殖密度迅速增加,中華絨螯蟹的患病幾率也大大增加,主要由細(xì)菌、病毒和寄生蟲引起。其中,中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma ericheiris)作為一種新型致病菌,能引發(fā)中華絨螯蟹患“顫抖病”,所造成的危害最為嚴(yán)重;谇捌谥腥A絨螯蟹血細(xì)胞免疫蛋白組學(xué)篩選結(jié)果可知,轉(zhuǎn)鐵蛋白(EsTTF)以及鐵蛋白(EsFe1、EsFe2)在螺原體感染中華絨螯蟹后,在血細(xì)胞中的表達(dá)量發(fā)生顯著變化。此外,先前已有報(bào)道證實(shí)轉(zhuǎn)鐵蛋白和鐵蛋白曾參與了其他物種宿主的免疫反應(yīng)。綜上所述,我們推斷EsTF、EsFe1和EsFe2極有可能在中華絨螯蟹的免疫防御機(jī)制中發(fā)揮的重要的作用。本論文首先通過基因克隆及生物信息學(xué)分析的方法,對EsTF的生物學(xué)特性進(jìn)行了研究。其次,通過qRT-PCR的方法檢測外源補(bǔ)充鐵元素及螺原體刺激后EsTF、EsFe1和EsFe2的表達(dá)變化。依據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我們初步推斷這三個蛋白以及鐵元素可能在抵御螺原體侵染中華絨螯蟹的免疫反應(yīng)中發(fā)揮了作...
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.2?EsTF的TR_FER結(jié)構(gòu)域示意圖
框(OpenReadingFrame,ORF),是一段能編碼730個氦基酸的多肽。結(jié)果顯示??3’端有含有646匕口的非翻譯區(qū)(1111的1151311〇11比§1〇11,1]。暴栆约暗湫偷模癌枺毖景??的尾巴,5’端則包含135bp的UTR(圖2.1)。預(yù)測該蛋白質(zhì)分子量為79.59?kDa,??等電點(diǎn)為6.87。SMART網(wǎng)站預(yù)測該蛋白第21到第369個以及第371到709個??氨基酸殘基均為TR_FER結(jié)構(gòu)域(圖2.2)。??0?100?200?300?400?500?600?700??圖2.2?EsTF的TR_FER結(jié)構(gòu)域示意圖。??Fig.2.2?TR_FER?domain?of?EsTF?predicted?by?SMART.??2.3.3?EsTF基因編碼蛋白信號肽預(yù)測??通過Signal?P在線軟件可知,EsTF蛋白的信號肽位于卜19氨基酸,第20??個氨基酸位點(diǎn)是信號肽剪切位點(diǎn)(圖2.3)。??9gnalP-4.1?prediction?(euknetworks):?Sequence?? ̄?C-score'? ̄??10?■?,?Sscore??????一廣、?、?Y-score????08???v:?-??0.6?■?'Ji?-??“?:??02???-??0.0.iiiiiiiiiiiiililiiiiii_iiMniiWTMmM??MRAVFLCVSVA?LA?A?S?L?AHQVV?RLCV?PEOQIQPCT?EULRD?PSLANLT?VOCVSGPDRYQC?LEKLAAKEVDV^??0?10?20?30?4
占33.56%?(藍(lán)色部分),延伸鏈占13.70°/。(紅色部分),隨機(jī)卷曲占52.74%?(紫??色部分)。在Transferrin蛋白整個多肽鏈中并沒有突出的?螺旋結(jié)構(gòu),最主要??成分是隨機(jī)卷曲的結(jié)構(gòu)(圖2.4)。??0?iee?2ee?3ee?柳?see?m??圖2.4?EsTF氨基酸序列二級結(jié)構(gòu)預(yù)測??Fig.2.4?EsTF?amino?acid?sequence?of?secondary?structure?prediction??2.3.5?EsTF基因序列同源性分析??通過DNAMAN多序列比對可以發(fā)現(xiàn),EsTF的蛋白序列與美洲鱟(Ziww/w??/?〇細(xì)/zewws)以及蚤狀潘(Dop/zw'apw/a:)序列的相似性在40%以上,并且具有相??同的TR_FER結(jié)構(gòu)域,說明該蛋白的在進(jìn)化中非常保守(圖2.5)。??22??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蝦蟹新型病原螺原體的發(fā)現(xiàn)和研究[J]. 王文. 南京師大學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(01)
[2]家蠅轉(zhuǎn)鐵蛋白基因的克隆和生物信息學(xué)分析[J]. 龔曉林,張潔,李顯航,劉紅美. 生物信息學(xué). 2012(04)
[3]長江水系中華絨螯蟹種質(zhì)資源研究進(jìn)展[J]. 李曉暉,許志強(qiáng),葛家春,朱清順,潘建林. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2009(10)
[4]中華絨螯蟹營養(yǎng)需求的研究現(xiàn)狀和進(jìn)展[J]. 陳立僑,李二超. 飼料工業(yè). 2009(10)
[5]螺原體的分類及其生物多樣性研究進(jìn)展[J]. 于漢壽,劉淑園,阮康勤,陳永萱,王志偉. 微生物學(xué)報(bào). 2009(05)
[6]Liver iron transport[J]. Ross M Graham,Anita CG Chua,Carly E Herbison,John K Olynyk,Debbie Trinder. World Journal of Gastroenterology. 2007(35)
[7]鐵元素的生理功能及其研究進(jìn)展[J]. 石文艷,潘曉亮,萬鵬程. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2005(03)
[8]中華絨螯蟹顫抖病研究進(jìn)展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科學(xué). 2005(01)
[9]鋅銅鐵對水產(chǎn)動物免疫機(jī)能的影響[J]. 許安陽,王安利. 水產(chǎn)科學(xué). 2004(09)
[10]湖泊放養(yǎng)長江水系中華絨螯蟹的性成熟規(guī)律研究[J]. 李思發(fā),王成輝,趙乃剛. 水生生物學(xué)報(bào). 2001(04)
碩士論文
[1]河蟹血細(xì)胞中螺原體侵染相關(guān)蛋白篩選及Rab7、14-3-3蛋白功能研究[D]. 候利波.南京師范大學(xué) 2016
[2]鐵對幼建鯉消化吸收功能、免疫功能和抗氧化能力的影響[D]. 凌娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3576121
【文章來源】:南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.2?EsTF的TR_FER結(jié)構(gòu)域示意圖
框(OpenReadingFrame,ORF),是一段能編碼730個氦基酸的多肽。結(jié)果顯示??3’端有含有646匕口的非翻譯區(qū)(1111的1151311〇11比§1〇11,1]。暴栆约暗湫偷模癌枺毖景??的尾巴,5’端則包含135bp的UTR(圖2.1)。預(yù)測該蛋白質(zhì)分子量為79.59?kDa,??等電點(diǎn)為6.87。SMART網(wǎng)站預(yù)測該蛋白第21到第369個以及第371到709個??氨基酸殘基均為TR_FER結(jié)構(gòu)域(圖2.2)。??0?100?200?300?400?500?600?700??圖2.2?EsTF的TR_FER結(jié)構(gòu)域示意圖。??Fig.2.2?TR_FER?domain?of?EsTF?predicted?by?SMART.??2.3.3?EsTF基因編碼蛋白信號肽預(yù)測??通過Signal?P在線軟件可知,EsTF蛋白的信號肽位于卜19氨基酸,第20??個氨基酸位點(diǎn)是信號肽剪切位點(diǎn)(圖2.3)。??9gnalP-4.1?prediction?(euknetworks):?Sequence?? ̄?C-score'? ̄??10?■?,?Sscore??????一廣、?、?Y-score????08???v:?-??0.6?■?'Ji?-??“?:??02???-??0.0.iiiiiiiiiiiiililiiiiii_iiMniiWTMmM??MRAVFLCVSVA?LA?A?S?L?AHQVV?RLCV?PEOQIQPCT?EULRD?PSLANLT?VOCVSGPDRYQC?LEKLAAKEVDV^??0?10?20?30?4
占33.56%?(藍(lán)色部分),延伸鏈占13.70°/。(紅色部分),隨機(jī)卷曲占52.74%?(紫??色部分)。在Transferrin蛋白整個多肽鏈中并沒有突出的?螺旋結(jié)構(gòu),最主要??成分是隨機(jī)卷曲的結(jié)構(gòu)(圖2.4)。??0?iee?2ee?3ee?柳?see?m??圖2.4?EsTF氨基酸序列二級結(jié)構(gòu)預(yù)測??Fig.2.4?EsTF?amino?acid?sequence?of?secondary?structure?prediction??2.3.5?EsTF基因序列同源性分析??通過DNAMAN多序列比對可以發(fā)現(xiàn),EsTF的蛋白序列與美洲鱟(Ziww/w??/?〇細(xì)/zewws)以及蚤狀潘(Dop/zw'apw/a:)序列的相似性在40%以上,并且具有相??同的TR_FER結(jié)構(gòu)域,說明該蛋白的在進(jìn)化中非常保守(圖2.5)。??22??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[7]鐵元素的生理功能及其研究進(jìn)展[J]. 石文艷,潘曉亮,萬鵬程. 畜牧獸醫(yī)科技信息. 2005(03)
[8]中華絨螯蟹顫抖病研究進(jìn)展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科學(xué). 2005(01)
[9]鋅銅鐵對水產(chǎn)動物免疫機(jī)能的影響[J]. 許安陽,王安利. 水產(chǎn)科學(xué). 2004(09)
[10]湖泊放養(yǎng)長江水系中華絨螯蟹的性成熟規(guī)律研究[J]. 李思發(fā),王成輝,趙乃剛. 水生生物學(xué)報(bào). 2001(04)
碩士論文
[1]河蟹血細(xì)胞中螺原體侵染相關(guān)蛋白篩選及Rab7、14-3-3蛋白功能研究[D]. 候利波.南京師范大學(xué) 2016
[2]鐵對幼建鯉消化吸收功能、免疫功能和抗氧化能力的影響[D]. 凌娟.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3576121
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