大鱗副泥鰍是鰍科經(jīng)濟(jì)魚類，也是我國(guó)出口韓國(guó)的重要淡水魚類之一。本研究采用第二代高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)大鱗副泥鰍進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，批量開(kāi)發(fā)并驗(yàn)證了大鱗副泥鰍微衛(wèi)星分子標(biāo)記；分析了中國(guó)四大湖泊野生大鱗副泥鰍群體的遺傳結(jié)構(gòu)，并利用建成的大鱗副泥鰍全同胞家系進(jìn)行生長(zhǎng)性狀與微衛(wèi)星分子標(biāo)記的相關(guān)分析，以期為大鱗副泥鰍種質(zhì)資源保護(hù)和良種選育提供一定的參考和理論基礎(chǔ)。1、基于第二代測(cè)序的大鱗副泥鰍轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析及微衛(wèi)星分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)通過(guò)Illumina（2×100HiSeq2000）高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)大鱗副泥鰍進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，序列組裝后得到71,887條非冗余轉(zhuǎn)錄組序列，平均長(zhǎng)度1464.58bp�；蜃⑨尠l(fā)現(xiàn)與Nr和Sting數(shù)據(jù)庫(kù)有同源性的序列分別有38,733和17,434；對(duì)所有序列進(jìn)行GO （gene ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes Pathway database）功能注釋，其中22,102（31.14%）條序列成功注釋到302條代謝通路上。為進(jìn)一步評(píng)價(jià)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序深度，將本數(shù)據(jù)庫(kù)序列與斑馬魚cDNA數(shù)據(jù)庫(kù)做序列同源性比對(duì)... 

【文章來(lái)源】：蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

組裝后的序列長(zhǎng)度分布

不同長(zhǎng)度可變剪接體與Nr數(shù)據(jù)庫(kù)有同源性的比例Figure1-2Comparisonofisogenelengthwithhits.(Longercontigsweremorelikelyto

大鱗副泥鰍可變剪接體的GO功能分類Figure1-3GeneontologyclassificationofParamisgurnusdabryanusisogenes

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]日糧中不同硒水平對(duì)大鱗副泥鰍生理生化指標(biāo)及肌肉品質(zhì)的影響[D]. 郝小鳳.蘇州大學(xué) 2013
[2]家蠶RAPD-SSR-AFLP三種分子標(biāo)記綜合連鎖圖譜的構(gòu)建及圖譜整合[D]. 姜振.蘇州大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3572709