基于轉錄組探討�；撬岷图琢虬彼醽喌\胺對高血氨癥大彈涂魚的影響
發(fā)布時間：2022-01-05 23:22
本研究采用生理生化、分子生物學及組學技術,探究了大彈涂魚（Boleophthalmus pectinirostris）氨中毒的生理機制,并就�；撬岷图琢虬彼醽喌\胺（MSO）對氨氮的緩釋作用做出了評估。本研究由以下三個實驗組成:（1）急性氨氮脅迫下大彈涂魚差異基因的比較轉錄組研究。以大彈涂魚（12.58±0.12 g）為實驗材料,開展為期96 h的氨氮脅迫實驗,對肝臟樣品進行比較轉錄組高通量測序。結果發(fā)現,共組裝得到87 654個Unigene;通過比較不同處理組之間的轉錄組數據,共有10 149個基因呈現差異性表達,其中上調的有4 727個,下調的有5 467個;對差異表達的基因進行GO功能的富集分析,獲得4 121個基因富集。結果表明,氨氮脅迫會導致大彈涂魚炎性反應,�；撬岷蚆SO均可以對氨中毒進行緩解,但解毒機制并不相同。（2）急性氨氮脅迫對大彈涂魚免疫相關基因表達的影響。以大彈涂魚（15.14±0.05）g為實驗材料,開展為期96 h的氨氮脅迫實驗。結果發(fā)現,大彈涂魚96 h氨氮LC50為8.99 mg/L;TNF與IL-6基因表達量在脅迫后先下調,并于12...
【文章來源】：浙江海洋大學浙江省
【文章頁數】：67 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
自然界中的氮素循環(huán)Fig.1Nitrogencycleinnature
基于轉錄組探討�；撬岷图琢虬彼醽喌\銨對高血氨癥大彈涂魚的影響之六十到百分之八十左右。我們常說的水中的氨氮指的是總氨氮，類別組成，離子氨和非離子氨。對于魚類來說離子氨的毒性較弱，是水中的非離子氨，因為它具有脂溶性可以通過鰓膜擴散進體內。主要來源于魚類的尿液中含有的尿素，經過氨化作用形成非離子氨在水體中的循環(huán)與陸地中大同小異。主要的差異存在于在水產養(yǎng)殖高浮游植物的數量，增加初級生產力，所以需要定期的向水體中添樣一來，氮肥中的含氮有機物在水中經過微生物的分解，就會形成氨化作用和硝化作用返還會大氣中。在水產養(yǎng)殖中，水體環(huán)境較小、集約型循環(huán)水養(yǎng)殖環(huán)境、餌料投放等多種原因都可能會導致水中從而誘發(fā)魚病。魚類在養(yǎng)殖過程中經常會處于高氨的環(huán)境下，導致濃度升高，變成氨氮脅迫。無論是急性的氨氮脅迫還是慢性的氨氮魚類的生長發(fā)育和生理過程，導致魚類的生長減緩甚至停止，肝和會發(fā)生一定程度的病變［9］，易感病、免疫力低下等癥狀［10］。
圖 2-1-1 Trinity 組裝程序原理圖Fig.2-1-1 Trinity assembly program schematic diagram.因功能注釋 BLAST［54］軟件將 Unigene 序列與 Non-Redundant Dataset (NR,w.ncbi.nlm.nih.gov)［55］、Swiss-Prot(http://www.expasy.ch/sprot)［56］、G(http://www.geneontology.org/GO)［57］、Clusters of Orthologous Groups(w.ncbi.nlm.nih.gov/COG)［58］、KOG（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/KOGNOG4.5（http://eggnogdb.embl.de/）［60］、Kyoto Encyclopaedia of Gene(KEGG, http://www.genome.jp/kegg)［61］數據庫比對，使用 KOBAS2.0［e 在 KEGG 中的 KEGG Orthology 結果，預測完 Unigene 的氨基酸序列 HMMER［63］（http://hmmer.org/）軟件與 Pfam［64］(http://pfam.xfam.org獲得 Unigene 的注釋信息。通過數據庫比對，對 Unigene 進行注釋分析
【參考文獻】：
期刊論文
[1]紋縞蝦虎魚對Cu2+、Cd2+和氨氮的毒性響應和敏感性分析[J]. 郝雅,朱麗巖,鞏文靜,韓萃,江田田. 生態(tài)毒理學報. 2016(06)
[2]孕鼠補充牛磺酸對生長受限胎鼠腦組織IL-6、IL-8、TNF-α和IL-1β水平的影響及臨床意義探討[J]. 王華偉,劉敬. 中國兒童保健雜志. 2017(01)
[3]蛋白營養(yǎng)對工業(yè)養(yǎng)殖大菱鲆（Scophthatmus maximus L.）幼魚生長、氨氮排泄及肌肉氨基酸的效應[J]. 張靜,高婷婷,李勇,趙寧寧,馬駿. 漁業(yè)科學進展. 2016(06)
[4]飼料維生素C含量對圓斑星鰈幼魚抗氨氮脅迫能力的影響[J]. 王貞杰,葉保民,常青,陳四清,劉長琳,胡建成,嚴俊麗,盧斌. 動物營養(yǎng)學報. 2016(12)
[5]基于轉錄組測序對茶樹GST基因表達的研究[J]. 張亞真,韋康,王麗鴛,成浩. 茶葉科學. 2016(05)
[6]利用MISA工具對不同類型序列進行SSR標記位點挖掘的探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷. 中國農學通報. 2016(10)
[7]氨氮對斑馬魚3種酶活性和基因表達的影響[J]. 周瑩,孫梨宗,劉志紅,臺培東,李玥瑩. 沈陽師范大學學報(自然科學版). 2016(01)
[8]魚類白介素（IL-1β）及干擾素（IFN）重組質粒構建及聯合應用研究[J]. 閆春梅,鄭偉,杜曉燕,肖志國,李忠強,熊占山,劉長有,李秀穎,劉慧吉. 黑龍江水產. 2015(06)
[9]氨氮脅迫對福瑞鯉幼魚GST活性的影響[J]. 李利紅,袁宏利,胡振平,武雨欣. 水產養(yǎng)殖. 2015(10)
[10]慢性氨氮脅迫對吉富羅非魚幼魚生長、免疫及代謝的影響[J]. 肖煒,李大宇,徐楊,鄒芝英,祝璟琳,韓玨,楊弘. 南方水產科學. 2015(04)
博士論文
[1]血清標志物TNF-α及IL-6水平與妊娠期高血壓的相關性研究[D]. 李園.山東大學 2017
[2]TNF-α通過microRNAs導致骨質疏松中骨髓間充質干細胞分化缺陷的機制研究[D]. 廖立.第四軍醫(yī)大學 2016
碩士論文
[1]芪參通絡飲對穩(wěn)定型心絞痛患者（氣虛血瘀型）臨床療效觀察及對血清GSH-Px、LPO的影響[D]. 王洋.黑龍江中醫(yī)藥大學 2017
[2]玉米高通量測序數據SNP檢測流程的優(yōu)化及應用[D]. 李坦.南京農業(yè)大學 2015
[3]養(yǎng)殖池塘中氨氮降解有益微生物的分離與鑒定[D]. 薛菲菲.中國海洋大學 2014
[4]攝食水平、氨氮脅迫對梭魚幼魚生長的影響及其毒理效應研究[D]. 黃厚見.上海海洋大學 2012
[5]先天性心臟病斑馬魚模型轉錄組測序分析[D]. 羅書萌.中國科學院北京基因組研究所 2012
本文編號：3571237
【文章來源】：浙江海洋大學浙江省
【文章頁數】：67 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
自然界中的氮素循環(huán)Fig.1Nitrogencycleinnature
基于轉錄組探討�；撬岷图琢虬彼醽喌\銨對高血氨癥大彈涂魚的影響之六十到百分之八十左右。我們常說的水中的氨氮指的是總氨氮，類別組成，離子氨和非離子氨。對于魚類來說離子氨的毒性較弱，是水中的非離子氨，因為它具有脂溶性可以通過鰓膜擴散進體內。主要來源于魚類的尿液中含有的尿素，經過氨化作用形成非離子氨在水體中的循環(huán)與陸地中大同小異。主要的差異存在于在水產養(yǎng)殖高浮游植物的數量，增加初級生產力，所以需要定期的向水體中添樣一來，氮肥中的含氮有機物在水中經過微生物的分解，就會形成氨化作用和硝化作用返還會大氣中。在水產養(yǎng)殖中，水體環(huán)境較小、集約型循環(huán)水養(yǎng)殖環(huán)境、餌料投放等多種原因都可能會導致水中從而誘發(fā)魚病。魚類在養(yǎng)殖過程中經常會處于高氨的環(huán)境下，導致濃度升高，變成氨氮脅迫。無論是急性的氨氮脅迫還是慢性的氨氮魚類的生長發(fā)育和生理過程，導致魚類的生長減緩甚至停止，肝和會發(fā)生一定程度的病變［9］，易感病、免疫力低下等癥狀［10］。
圖 2-1-1 Trinity 組裝程序原理圖Fig.2-1-1 Trinity assembly program schematic diagram.因功能注釋 BLAST［54］軟件將 Unigene 序列與 Non-Redundant Dataset (NR,w.ncbi.nlm.nih.gov)［55］、Swiss-Prot(http://www.expasy.ch/sprot)［56］、G(http://www.geneontology.org/GO)［57］、Clusters of Orthologous Groups(w.ncbi.nlm.nih.gov/COG)［58］、KOG（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/KOGNOG4.5（http://eggnogdb.embl.de/）［60］、Kyoto Encyclopaedia of Gene(KEGG, http://www.genome.jp/kegg)［61］數據庫比對，使用 KOBAS2.0［e 在 KEGG 中的 KEGG Orthology 結果，預測完 Unigene 的氨基酸序列 HMMER［63］（http://hmmer.org/）軟件與 Pfam［64］(http://pfam.xfam.org獲得 Unigene 的注釋信息。通過數據庫比對，對 Unigene 進行注釋分析
【參考文獻】：
期刊論文
[1]紋縞蝦虎魚對Cu2+、Cd2+和氨氮的毒性響應和敏感性分析[J]. 郝雅,朱麗巖,鞏文靜,韓萃,江田田. 生態(tài)毒理學報. 2016(06)
[2]孕鼠補充牛磺酸對生長受限胎鼠腦組織IL-6、IL-8、TNF-α和IL-1β水平的影響及臨床意義探討[J]. 王華偉,劉敬. 中國兒童保健雜志. 2017(01)
[3]蛋白營養(yǎng)對工業(yè)養(yǎng)殖大菱鲆（Scophthatmus maximus L.）幼魚生長、氨氮排泄及肌肉氨基酸的效應[J]. 張靜,高婷婷,李勇,趙寧寧,馬駿. 漁業(yè)科學進展. 2016(06)
[4]飼料維生素C含量對圓斑星鰈幼魚抗氨氮脅迫能力的影響[J]. 王貞杰,葉保民,常青,陳四清,劉長琳,胡建成,嚴俊麗,盧斌. 動物營養(yǎng)學報. 2016(12)
[5]基于轉錄組測序對茶樹GST基因表達的研究[J]. 張亞真,韋康,王麗鴛,成浩. 茶葉科學. 2016(05)
[6]利用MISA工具對不同類型序列進行SSR標記位點挖掘的探討[J]. 王希,陳麗,趙春雷. 中國農學通報. 2016(10)
[7]氨氮對斑馬魚3種酶活性和基因表達的影響[J]. 周瑩,孫梨宗,劉志紅,臺培東,李玥瑩. 沈陽師范大學學報(自然科學版). 2016(01)
[8]魚類白介素（IL-1β）及干擾素（IFN）重組質粒構建及聯合應用研究[J]. 閆春梅,鄭偉,杜曉燕,肖志國,李忠強,熊占山,劉長有,李秀穎,劉慧吉. 黑龍江水產. 2015(06)
[9]氨氮脅迫對福瑞鯉幼魚GST活性的影響[J]. 李利紅,袁宏利,胡振平,武雨欣. 水產養(yǎng)殖. 2015(10)
[10]慢性氨氮脅迫對吉富羅非魚幼魚生長、免疫及代謝的影響[J]. 肖煒,李大宇,徐楊,鄒芝英,祝璟琳,韓玨,楊弘. 南方水產科學. 2015(04)
博士論文
[1]血清標志物TNF-α及IL-6水平與妊娠期高血壓的相關性研究[D]. 李園.山東大學 2017
[2]TNF-α通過microRNAs導致骨質疏松中骨髓間充質干細胞分化缺陷的機制研究[D]. 廖立.第四軍醫(yī)大學 2016
碩士論文
[1]芪參通絡飲對穩(wěn)定型心絞痛患者（氣虛血瘀型）臨床療效觀察及對血清GSH-Px、LPO的影響[D]. 王洋.黑龍江中醫(yī)藥大學 2017
[2]玉米高通量測序數據SNP檢測流程的優(yōu)化及應用[D]. 李坦.南京農業(yè)大學 2015
[3]養(yǎng)殖池塘中氨氮降解有益微生物的分離與鑒定[D]. 薛菲菲.中國海洋大學 2014
[4]攝食水平、氨氮脅迫對梭魚幼魚生長的影響及其毒理效應研究[D]. 黃厚見.上海海洋大學 2012
[5]先天性心臟病斑馬魚模型轉錄組測序分析[D]. 羅書萌.中國科學院北京基因組研究所 2012
本文編號：3571237
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