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黃顙魚(yú)干擾素調(diào)節(jié)因子的鑒定及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-02 17:41
  黃顙魚(yú)(Pelteobagrus fulvidraco)是我國(guó)重要的名優(yōu)新淡水養(yǎng)殖品種。但近年來(lái),隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大和養(yǎng)殖密度的提高,病害發(fā)生日趨嚴(yán)重,制約著黃顙魚(yú)養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。干擾素(interferon,IFN)反應(yīng)是魚(yú)類(lèi)抵抗病原感染的第一道防線。干擾素調(diào)節(jié)因子(interferon regulatory factors,IRFs)調(diào)節(jié)干擾素及干擾素刺激效應(yīng)基因的表達(dá),在免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。本研究克隆、鑒定了黃顙魚(yú)IRF家族的13個(gè)基因。采用生物信息學(xué)方法分析了 IRFs基因的序列特征,通過(guò)熒光定量PCR檢測(cè)了 IRF在正常黃顙魚(yú)組織中的分布特點(diǎn)。分別用鲇愛(ài)德華氏菌(Edwardsiellaictaluri)、polyI:C和LPS誘導(dǎo)黃顙魚(yú),在誘導(dǎo)后不同時(shí)間段分析了脾和頭腎中IRF表達(dá)量的變化。進(jìn)一步針對(duì)IRF3、IRF7和IRF9開(kāi)展了初步的功能研究:通過(guò)構(gòu)建融合綠色熒光蛋白(GFP)或紅色熒光蛋白(DsRed)的真核表達(dá)載體,研究了三者的亞細(xì)胞定位,以及IRF9和STAT1A、STAT1B、STAT2的定位關(guān)系。在過(guò)表達(dá)IRF3、IRF7和IRF9的細(xì)胞中,檢測(cè)了 I... 

【文章來(lái)源】:湖北大學(xué)湖北省

【文章頁(yè)數(shù)】:121 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第1章 緒論
    1.1 魚(yú)類(lèi)干擾素簡(jiǎn)介
    1.2 干擾素調(diào)控因子簡(jiǎn)介
        1.2.1 脊椎動(dòng)物干擾素調(diào)控因子簡(jiǎn)介
        1.2.2 魚(yú)類(lèi)干擾素調(diào)控因子簡(jiǎn)介
        1.2.3 干擾素調(diào)控因子的表達(dá)分布特點(diǎn)
        1.2.4 干擾素調(diào)控因子的功能
        1.2.5 魚(yú)類(lèi)干擾素調(diào)控因子的研究進(jìn)展
    1.3 STATs功能簡(jiǎn)介
    1.4 鲇愛(ài)德華氏菌簡(jiǎn)介
    1.5 黃顙魚(yú)研究概況
    1.6 本研究的目的與意義
第2章 材料和方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)儀器和材料
        2.1.1 主要儀器
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.3 載體和引物
        2.1.4 試劑和培養(yǎng)基的配制
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 黃顙魚(yú)IRF基因ORF的克隆
        2.2.2 黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)分析
        2.2.3 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亞細(xì)胞定位
        2.2.4 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9在細(xì)胞內(nèi)對(duì)干擾素的誘導(dǎo)表達(dá)
第3章 結(jié)果分析
    3.1 黃顙魚(yú)IRF基因cDNA的克隆及序列分析
        3.1.1 黃顙魚(yú)PfIRF1 cDNA的序列分析
        3.1.2 黃顙魚(yú)PfIRF2A cDNA的序列分析
        3.1.3 黃顙魚(yú)PfIRF2B cDNA的序列分析
        3.1.4 黃顙魚(yú)PfIRF3 cDNA的序列分析
        3.1.5 黃顙魚(yú)PfIRF4A cDNA的序列分析
        3.1.6 黃顙魚(yú)PfIRF4B cDNA的序列分析
        3.1.7 黃顙魚(yú)PfIRF4C cDNA的序列分析
        3.1.8 黃顙魚(yú)PfIRF5 cDNA的序列分析
        3.1.9 黃顙魚(yú)PfIRF6 cDNA的序列分析
        3.1.10 黃顙魚(yú)PfIRF7 cDNA的序列分析
        3.1.11 黃顙魚(yú)PfIRF8 cDNA的序列分析
        3.1.12 黃顙魚(yú)PfIRF9 cDNA的序列分析
        3.1.13 黃顙魚(yú)PfIRF10 cDNA的序列分析
        3.1.14 黃顙魚(yú)PfIRF基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
    3.2 黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)分析
        3.2.1 正常黃顙魚(yú)各組織中IRF基因的表達(dá)分析
        3.2.2 polyI:C誘導(dǎo)后黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)分析
        3.2.3 LPS誘導(dǎo)后黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)分析
        3.2.4 鲇愛(ài)德華氏菌誘導(dǎo)后黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)分析
    3.3 亞細(xì)胞定位
        3.3.1 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亞細(xì)胞定位
        3.3.2 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2亞細(xì)胞定位
        3.3.3 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2與PfIRF9的共定位
    3.4 黃顙魚(yú)PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9對(duì)EPC細(xì)胞IFN的誘導(dǎo)表達(dá)
第4章 討論
    4.1 黃顙魚(yú)IRF基因的序列特征
    4.2 黃顙魚(yú)IRF基因的表達(dá)特性
    4.3 黃顙魚(yú)IRF3、IRF7和IRF9的初步功能分析
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]斑馬魚(yú)IRF11基因的鑒定、亞細(xì)胞定位及表達(dá)特征[J]. 熊亞瑋,張義兵,桂建芳.  水生生物學(xué)報(bào). 2017(01)
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碩士論文
[1]魚(yú)類(lèi)干擾素調(diào)節(jié)因子4(IRF4)、5(IRF5)的抗病毒功能研究[D]. 艾克特.長(zhǎng)江大學(xué) 2017



本文編號(hào):3564604

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