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黃顙魚干擾素調(diào)節(jié)因子的鑒定及表達分析

發(fā)布時間:2022-01-02 17:41
  黃顙魚(Pelteobagrus fulvidraco)是我國重要的名優(yōu)新淡水養(yǎng)殖品種。但近年來,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴大和養(yǎng)殖密度的提高,病害發(fā)生日趨嚴(yán)重,制約著黃顙魚養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。干擾素(interferon,IFN)反應(yīng)是魚類抵抗病原感染的第一道防線。干擾素調(diào)節(jié)因子(interferon regulatory factors,IRFs)調(diào)節(jié)干擾素及干擾素刺激效應(yīng)基因的表達,在免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用。本研究克隆、鑒定了黃顙魚IRF家族的13個基因。采用生物信息學(xué)方法分析了 IRFs基因的序列特征,通過熒光定量PCR檢測了 IRF在正常黃顙魚組織中的分布特點。分別用鲇愛德華氏菌(Edwardsiellaictaluri)、polyI:C和LPS誘導(dǎo)黃顙魚,在誘導(dǎo)后不同時間段分析了脾和頭腎中IRF表達量的變化。進一步針對IRF3、IRF7和IRF9開展了初步的功能研究:通過構(gòu)建融合綠色熒光蛋白(GFP)或紅色熒光蛋白(DsRed)的真核表達載體,研究了三者的亞細(xì)胞定位,以及IRF9和STAT1A、STAT1B、STAT2的定位關(guān)系。在過表達IRF3、IRF7和IRF9的細(xì)胞中,檢測了 I... 

【文章來源】:湖北大學(xué)湖北省

【文章頁數(shù)】:121 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語表
第1章 緒論
    1.1 魚類干擾素簡介
    1.2 干擾素調(diào)控因子簡介
        1.2.1 脊椎動物干擾素調(diào)控因子簡介
        1.2.2 魚類干擾素調(diào)控因子簡介
        1.2.3 干擾素調(diào)控因子的表達分布特點
        1.2.4 干擾素調(diào)控因子的功能
        1.2.5 魚類干擾素調(diào)控因子的研究進展
    1.3 STATs功能簡介
    1.4 鲇愛德華氏菌簡介
    1.5 黃顙魚研究概況
    1.6 本研究的目的與意義
第2章 材料和方法
    2.1 實驗儀器和材料
        2.1.1 主要儀器
        2.1.2 實驗材料
        2.1.3 載體和引物
        2.1.4 試劑和培養(yǎng)基的配制
    2.2 實驗方法
        2.2.1 黃顙魚IRF基因ORF的克隆
        2.2.2 黃顙魚IRF基因的表達分析
        2.2.3 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亞細(xì)胞定位
        2.2.4 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9在細(xì)胞內(nèi)對干擾素的誘導(dǎo)表達
第3章 結(jié)果分析
    3.1 黃顙魚IRF基因cDNA的克隆及序列分析
        3.1.1 黃顙魚PfIRF1 cDNA的序列分析
        3.1.2 黃顙魚PfIRF2A cDNA的序列分析
        3.1.3 黃顙魚PfIRF2B cDNA的序列分析
        3.1.4 黃顙魚PfIRF3 cDNA的序列分析
        3.1.5 黃顙魚PfIRF4A cDNA的序列分析
        3.1.6 黃顙魚PfIRF4B cDNA的序列分析
        3.1.7 黃顙魚PfIRF4C cDNA的序列分析
        3.1.8 黃顙魚PfIRF5 cDNA的序列分析
        3.1.9 黃顙魚PfIRF6 cDNA的序列分析
        3.1.10 黃顙魚PfIRF7 cDNA的序列分析
        3.1.11 黃顙魚PfIRF8 cDNA的序列分析
        3.1.12 黃顙魚PfIRF9 cDNA的序列分析
        3.1.13 黃顙魚PfIRF10 cDNA的序列分析
        3.1.14 黃顙魚PfIRF基因系統(tǒng)進化分析
    3.2 黃顙魚IRF基因的表達分析
        3.2.1 正常黃顙魚各組織中IRF基因的表達分析
        3.2.2 polyI:C誘導(dǎo)后黃顙魚IRF基因的表達分析
        3.2.3 LPS誘導(dǎo)后黃顙魚IRF基因的表達分析
        3.2.4 鲇愛德華氏菌誘導(dǎo)后黃顙魚IRF基因的表達分析
    3.3 亞細(xì)胞定位
        3.3.1 PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9亞細(xì)胞定位
        3.3.2 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2亞細(xì)胞定位
        3.3.3 PfSTAT1A、PfSTAT1B、PfSTAT2與PfIRF9的共定位
    3.4 黃顙魚PfIRF3、PfIRF7、PfIRF9對EPC細(xì)胞IFN的誘導(dǎo)表達
第4章 討論
    4.1 黃顙魚IRF基因的序列特征
    4.2 黃顙魚IRF基因的表達特性
    4.3 黃顙魚IRF3、IRF7和IRF9的初步功能分析
參考文獻
附錄
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]斑馬魚IRF11基因的鑒定、亞細(xì)胞定位及表達特征[J]. 熊亞瑋,張義兵,桂建芳.  水生生物學(xué)報. 2017(01)
[2]Gene cloning and induced expression pattern of IRF4 and IRF10 in the Asian swamp eel(Monopterus albus)[J]. Qiao-Qing XU,Dai-Qin YANG,Rui TUO,Jing WAN,Ming-Xian CHANG,Pin NIE.  Zoological Research. 2014(05)
[3]3種免疫增強劑對黃顙魚非特異性免疫機能的影響[J]. 姚嘉赟,徐洋,盛鵬程,尹文林,藺凌云,袁雪梅,潘曉藝,郝貴杰,沈錦玉.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(10)
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[5]2010年水產(chǎn)養(yǎng)殖病害發(fā)生情況與2011年流行趨勢分析[J]. 陳愛平,劉富林,吳凡修.  中國水產(chǎn). 2011(03)
[6]黃顙魚鲇愛德華氏菌的分離鑒定及其致病性研究[J]. 徐進,羅曉松,曾令兵.  淡水漁業(yè). 2009(06)
[7]黃顙魚HSC70基因及其組織表達分析[J]. 張娟,張其中,張占會,崔淼.  水生生物學(xué)報. 2009(03)
[8]黃顙魚生物學(xué)特性及養(yǎng)殖技術(shù)[J]. 王俊鵬.  內(nèi)陸水產(chǎn). 2008(08)

碩士論文
[1]魚類干擾素調(diào)節(jié)因子4(IRF4)、5(IRF5)的抗病毒功能研究[D]. 艾克特.長江大學(xué) 2017



本文編號:3564604

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