MAVS（線粒體抗病毒信號蛋白）在宿主細胞抵御微生物病原體的固有免疫應答中扮演著一個重要的角色。在這篇研究中,我們克隆了青魚MAVS的cDNA全長序列,并對MAVS的功能進行了初步研究。青魚MAVS全長cDNA由2352個核苷酸組成,由軟件預測的MAVS蛋白包含有579個氨基酸,分子量為62.4kDa,等電點4.83。結構分析顯示青魚MAVS的功能性結構域包括N端CARD結構域（半胱氨酸蛋白酶激活和募集結構域）,中間富脯氨酸結構域,假定的TRAF2結合位點和C端跨膜結構域,這與哺乳動物的MAVS相類似。序列比對顯示青魚MAVS與其它已知的魚類和哺乳動物的MAVS的CARD結構域有著很高的相似性（53.3%-97.6%）,這也暗示了魚類和哺乳動物的MAVS的CARD結構域具有保守性。青魚MAVS在所有選定的組織中都有穩(wěn)定表達,包括鰓、腎臟、心臟、腸、肝臟、肌肉、皮膚和脾臟;在GCRV和SVCV病毒感染后,腸、肝臟和肌肉組織中的青魚MAVS mRNA水平明顯提高,但是在感染GCRV和SVCV病毒的青魚脾臟中的MAVS轉錄水平卻下降了。在免疫印跡分析中,我們檢測出青魚MAVS蛋白在HEK29... 

【文章來源】：湖南師范大學湖南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

5’FullRaceKit原理圖

圖 2-2：3’RACE 原理圖步驟具體如下：魚脾臟總 RNA 提取。參照步驟（2.1.4.1）據(jù)2.3.1得到的青魚mavs基因中間段序列設計克隆3’UTR內

26圖 3-1：青魚 MAVS 的全長 cDNA。青魚 MAVS 全長 cDNA 由 2352 個核苷酸組成，預測的青魚 MAVS 蛋白包含 579 個氨基酸。畫框的是 CARD 結構域（10-93aa）,劃線的是富脯氨酸結構域（106-209aa）;TRAF2 結合位點（322-325aa）是用雙線標記的區(qū)域而劃紅線的區(qū)域是TM 結構域（558-575aa）。蛋白結構域的預測是通過在線軟件 Simple Modular ArchitectureResearch Tool (SMART) (http://smart.embl-heidelberg.de/) ， Pfam database search(http://pfam.sanger.ac.uk/search)和 NCBI 的 CDD（Conserved Domain Database）數(shù)據(jù)庫，而域內特性是通過 PROSITE 數(shù)據(jù)庫 (http://us.expasy.org/tools/scanprosite)預測出來的。3.2 青魚 MAVS 的進化研究為了分析 MAVS 的進化，我們將青魚 MAVS 全長序列以及它的功能結構域—CARD 結構域，跨膜結構域（TM）和富脯氨酸結構域與其它物種的 MAVS 進


本文編號：3561342