駱馬湖大銀魚、太湖新銀魚線粒體Cytb和COⅠ基因序列多態(tài)性分析
發(fā)布時間:2021-12-31 22:52
為了解江蘇省駱馬湖大銀魚(Protosalanx hyalocranius)和太湖新銀魚(Neosalanx taihuensis)遺傳多樣性水平,科學(xué)管理保護(hù)大銀魚和太湖新銀魚種質(zhì)資源,利用線粒體DNA Cytb和COⅠ基因序列作為分子標(biāo)記,研究了駱馬湖大銀魚和太湖新銀魚的遺傳多樣性。采用PCR擴(kuò)增和序列測定獲得長度為1 141 bp和630 bp的Cytb和COⅠ基因序列。64條大銀魚Cytb基因序列檢出10個多態(tài)性位點,定義9個單倍型,單倍型多樣性和核苷酸多樣性分別為0.824±0.025和0.001 49±0.000 13,堿基平均差異數(shù)為1.696;64條大銀魚COⅠ基因序列檢出5個多態(tài)性位點,定義6個單倍型,單倍型多樣性和核苷酸多樣性分別為0.753±0.025和0.001 98±0.000 13,堿基平均差異數(shù)為1.247。大銀魚遺傳多樣性具有高單倍型多樣性和低核苷酸多樣性特征。35條太湖新銀魚Cytb基因序列檢出11個多態(tài)性位點,定義8個單倍型,單倍型多樣性和核苷酸多樣性分別為0.449±0.103和0.000 92±0.000 30,堿基平均差異數(shù)為1.045;35條...
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 基因組DNA提取
1.3 PCR擴(kuò)增與測序
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 大銀魚和太湖新銀魚Cytb和COⅠ基因序列變異分析
2.2 駱馬湖大銀魚和太湖新銀魚遺傳多樣性
2.3 大銀魚和太湖新銀魚單倍型系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4 大銀魚和太湖新銀魚種群歷史動態(tài)
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]洪澤湖大銀魚和太湖新銀魚的生長、死亡參數(shù)及資源利用狀況[J]. 趙麗爽,程飛,張磊,王欣,張勝宇,蔣功成,謝松光. 水生生物學(xué)報. 2018(02)
[2]駱馬湖夏季魚類群落結(jié)構(gòu)及其空間分布[J]. 唐晟凱,張彤晴,李大命,李強(qiáng),高軍,劉小維,劉燕山. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(01)
[3]洪澤湖大銀魚(Protosalanx hyalocranius)Cytb和COⅠ基因序列多態(tài)性分析[J]. 李大命,李康,張彤晴,唐晟凱,劉燕山,劉小維,穆歡,黃越峰,潘建林. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2017(06)
[4]駱馬湖表層水體中32種PPCPs類物質(zhì)的污染水平、分布特征及風(fēng)險評估[J]. 張芹,張圣虎,汪貞,郭敏,劉濟(jì)寧,石利利,古文. 環(huán)境科學(xué). 2017(01)
[5]太湖大銀魚(Protosalanx chinensis)細(xì)胞色素b基因序列多態(tài)性分析[J]. 李大命,張彤晴,唐晟凱,鐘立強(qiáng). 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(04)
[6]駱馬湖生態(tài)環(huán)境現(xiàn)狀及其保護(hù)措施[J]. 申霞,洪大林,談永鋒,王永平,董家根. 水資源保護(hù). 2013(03)
[7]基于COI基因序列的太湖新銀魚遺傳多樣性[J]. 張迪,雷光春,龔成,王忠鎖. 湖泊科學(xué). 2012(02)
[8]利用COⅠ和Cytb序列探討東海區(qū)3種鯧屬魚類的種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,彭士明,尹飛,施兆鴻. 海洋漁業(yè). 2011(04)
[9]基于四個線粒體基因片段的銀魚科魚類系統(tǒng)發(fā)育[J]. 郭立,李雋,王忠鎖,傅萃長. 水生生物學(xué)報. 2011(03)
[10]三峽庫區(qū)3種銀魚線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列多態(tài)性分析[J]. 羅宏偉,段辛斌,王珂,唐錫良,陳大慶. 淡水漁業(yè). 2009(06)
碩士論文
[1]基于細(xì)胞色素b的中國9個大銀魚群體遺傳多樣性研究[D]. 薛丹.暨南大學(xué) 2015
本文編號:3561132
【文章來源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(11)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 基因組DNA提取
1.3 PCR擴(kuò)增與測序
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 大銀魚和太湖新銀魚Cytb和COⅠ基因序列變異分析
2.2 駱馬湖大銀魚和太湖新銀魚遺傳多樣性
2.3 大銀魚和太湖新銀魚單倍型系統(tǒng)進(jìn)化樹
2.4 大銀魚和太湖新銀魚種群歷史動態(tài)
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]洪澤湖大銀魚和太湖新銀魚的生長、死亡參數(shù)及資源利用狀況[J]. 趙麗爽,程飛,張磊,王欣,張勝宇,蔣功成,謝松光. 水生生物學(xué)報. 2018(02)
[2]駱馬湖夏季魚類群落結(jié)構(gòu)及其空間分布[J]. 唐晟凱,張彤晴,李大命,李強(qiáng),高軍,劉小維,劉燕山. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(01)
[3]洪澤湖大銀魚(Protosalanx hyalocranius)Cytb和COⅠ基因序列多態(tài)性分析[J]. 李大命,李康,張彤晴,唐晟凱,劉燕山,劉小維,穆歡,黃越峰,潘建林. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2017(06)
[4]駱馬湖表層水體中32種PPCPs類物質(zhì)的污染水平、分布特征及風(fēng)險評估[J]. 張芹,張圣虎,汪貞,郭敏,劉濟(jì)寧,石利利,古文. 環(huán)境科學(xué). 2017(01)
[5]太湖大銀魚(Protosalanx chinensis)細(xì)胞色素b基因序列多態(tài)性分析[J]. 李大命,張彤晴,唐晟凱,鐘立強(qiáng). 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(04)
[6]駱馬湖生態(tài)環(huán)境現(xiàn)狀及其保護(hù)措施[J]. 申霞,洪大林,談永鋒,王永平,董家根. 水資源保護(hù). 2013(03)
[7]基于COI基因序列的太湖新銀魚遺傳多樣性[J]. 張迪,雷光春,龔成,王忠鎖. 湖泊科學(xué). 2012(02)
[8]利用COⅠ和Cytb序列探討東海區(qū)3種鯧屬魚類的種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 孫鵬,彭士明,尹飛,施兆鴻. 海洋漁業(yè). 2011(04)
[9]基于四個線粒體基因片段的銀魚科魚類系統(tǒng)發(fā)育[J]. 郭立,李雋,王忠鎖,傅萃長. 水生生物學(xué)報. 2011(03)
[10]三峽庫區(qū)3種銀魚線粒體DNA細(xì)胞色素b基因序列多態(tài)性分析[J]. 羅宏偉,段辛斌,王珂,唐錫良,陳大慶. 淡水漁業(yè). 2009(06)
碩士論文
[1]基于細(xì)胞色素b的中國9個大銀魚群體遺傳多樣性研究[D]. 薛丹.暨南大學(xué) 2015
本文編號:3561132
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