刺參隸屬棘皮動物門（Echinoermata）,廣泛分布于包括俄羅斯,日本,朝鮮以及中國在內(nèi)的沿岸海域。目前,我國刺參的養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)日漸完善,蓬勃發(fā)展,2013年年產(chǎn)量就已超200億元。刺參的發(fā)育、病害防治、育種等方面的研究已經(jīng)取得了很多成果,但對于刺參分子生物學(xué)方面的研究仍然不夠完善。刺參背部的疣足作為一個具有呼吸和與外界信息交換的中空錐形肉刺狀組織,學(xué)者們很早就開始對其進行研究。刺參疣足的數(shù)目、排數(shù)是重要的經(jīng)濟性狀。但目前為止,對刺參疣足的研究大多停留在組織形態(tài)學(xué)、解剖生物學(xué)和功能方面,從分子生物學(xué)水平上對刺參疣足的研究比較少見。為獲得刺參疣足相關(guān)基因,本文選取刺參疣足附近的背部皮膚為對照,利用RNA-Seq技術(shù)對刺參（Apostichopus japonicus）疣足組織和皮膚組織兩個組織樣本的的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行研究,得到結(jié)果如下:1.應(yīng)用雙端125bp Illumina Hiseq2500測序,在疣足組織和皮膚組織樣本中分別得到33,504,127和37,384,685條Raw reads。質(zhì)量控制后分別有30,657,027條和36,444,908條Clean reads。高質(zhì)量的... 

【文章來源】：大連海洋大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

刺參（Apostichopusjaponicus）

基于RNA-Seq技術(shù)的研究內(nèi)容Fig1-2ThepipelineofRNA-Seqresearch

本研究的技術(shù)路線

【參考文獻】：
期刊論文
[1]我國海參產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀分析[J]. 徐永東,李可聞.  漁業(yè)信息與戰(zhàn)略. 2013(02)
[2]刺參蝦青素基因的克隆及不同體色個體間表達差異的分析[J]. 趙鶴凌,楊紅生,趙歡,劉石林.  海洋科學(xué). 2012(03)
[3]nr數(shù)據(jù)庫分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初.  計算機工程. 2006(05)
[4]國內(nèi)外海參自然資源、養(yǎng)殖狀況及存在問題[J]. 張春云,王印庚,榮小軍,孫惠玲,董樹剛.  海洋水產(chǎn)研究. 2004(03)

博士論文
[1]基于高通量測序的刺參白化發(fā)生和子代體色分離研究[D]. 馬得友.中國科學(xué)院研究生院（海洋研究所） 2013

碩士論文
[1]基于RNA-Seq技術(shù)的人轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 陳超.中南大學(xué) 2011



本文編號：3557627