刺參隸屬棘皮動(dòng)物門（Echinoermata）,廣泛分布于包括俄羅斯,日本,朝鮮以及中國(guó)在內(nèi)的沿岸海域。目前,我國(guó)刺參的養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)日漸完善,蓬勃發(fā)展,2013年年產(chǎn)量就已超200億元。刺參的發(fā)育、病害防治、育種等方面的研究已經(jīng)取得了很多成果,但對(duì)于刺參分子生物學(xué)方面的研究仍然不夠完善。刺參背部的疣足作為一個(gè)具有呼吸和與外界信息交換的中空錐形肉刺狀組織,學(xué)者們很早就開始對(duì)其進(jìn)行研究。刺參疣足的數(shù)目、排數(shù)是重要的經(jīng)濟(jì)性狀。但目前為止,對(duì)刺參疣足的研究大多停留在組織形態(tài)學(xué)、解剖生物學(xué)和功能方面,從分子生物學(xué)水平上對(duì)刺參疣足的研究比較少見。為獲得刺參疣足相關(guān)基因,本文選取刺參疣足附近的背部皮膚為對(duì)照,利用RNA-Seq技術(shù)對(duì)刺參（Apostichopus japonicus）疣足組織和皮膚組織兩個(gè)組織樣本的的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行研究,得到結(jié)果如下:1.應(yīng)用雙端125bp Illumina Hiseq2500測(cè)序,在疣足組織和皮膚組織樣本中分別得到33,504,127和37,384,685條Raw reads。質(zhì)量控制后分別有30,657,027條和36,444,908條Clean reads。高質(zhì)量的... 

【文章來(lái)源】：大連海洋大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

刺參（Apostichopusjaponicus）

基于RNA-Seq技術(shù)的研究?jī)?nèi)容Fig1-2ThepipelineofRNA-Seqresearch

本研究的技術(shù)路線

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]我國(guó)海參產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀分析[J]. 徐永東,李可聞.  漁業(yè)信息與戰(zhàn)略. 2013(02)
[2]刺參蝦青素基因的克隆及不同體色個(gè)體間表達(dá)差異的分析[J]. 趙鶴凌,楊紅生,趙歡,劉石林.  海洋科學(xué). 2012(03)
[3]nr數(shù)據(jù)庫(kù)分析及其本地化[J]. 鄧泱泱,荔建琦,吳松鋒,朱云平,陳耀文,賀福初.  計(jì)算機(jī)工程. 2006(05)
[4]國(guó)內(nèi)外海參自然資源、養(yǎng)殖狀況及存在問題[J]. 張春云,王印庚,榮小軍,孫惠玲,董樹剛.  海洋水產(chǎn)研究. 2004(03)

博士論文
[1]基于高通量測(cè)序的刺參白化發(fā)生和子代體色分離研究[D]. 馬得友.中國(guó)科學(xué)院研究生院（海洋研究所） 2013

碩士論文
[1]基于RNA-Seq技術(shù)的人轉(zhuǎn)錄組分析研究[D]. 陳超.中南大學(xué) 2011



本文編號(hào)：3557627