克氏原螯蝦在鹽脅迫條件下差異化的microRNA表達(dá)譜的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-25 08:59
目的近年鹽堿地克氏原螯蝦養(yǎng)殖業(yè)逐漸興起,但是鹽堿地水質(zhì)高鹽度是最嚴(yán)重的非生物脅迫之一,基礎(chǔ)理論研究又比較薄弱導(dǎo)致養(yǎng)殖不善,使得克氏原螯蝦大面積死亡,有些種類即使能存活,但生長(zhǎng)差,產(chǎn)量較低而且不穩(wěn)定。因此,探明鹽堿脅迫條件下克氏原螯蝦對(duì)養(yǎng)殖水環(huán)境的應(yīng)激機(jī)制性, 利用基因工程提高克氏原螯蝦的耐鹽性,培育出適合在鹽化土地上生長(zhǎng)的克氏原螯蝦品種是有效利用鹽堿化土地對(duì)于提高鹽堿地的克氏原螯蝦產(chǎn)量具有積極的指導(dǎo)作用。方法本實(shí)驗(yàn)通過對(duì)淡水中生長(zhǎng)的克氏原螯蝦(A型)和鹽水中生長(zhǎng)的克氏原螯蝦(B型)進(jìn)行Solexa高通量測(cè)序,構(gòu)建了其小RNA文庫,從而獲得了差異化的miRNA表達(dá)譜。通過分析測(cè)序結(jié)果,篩選出了受鹽脅迫下上調(diào)和下調(diào)的miRNA,并利用qRT-PCR的方法對(duì)測(cè)序的結(jié)果進(jìn)行了驗(yàn)證。結(jié)果:(1)Solexa測(cè)序一共獲得了469,044個(gè)長(zhǎng)度為18-30 nt的小RNA序列。根據(jù)生物信息學(xué)的方法篩選長(zhǎng)度在18-22nt的RNA,和十足目的動(dòng)物基因組的比對(duì),我們獲得了78種在整個(gè)動(dòng)物界保守的miRNA,在這78種miRNA中8種在A型螯蝦的體內(nèi)特異性表達(dá),18種miRNA在B型螯蝦的體內(nèi)特異性的表達(dá)...
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1 克氏原螯蝦概況和研究綜述
1.1 克氏原螯蝦生物學(xué)簡(jiǎn)介
1.2 克氏原螯蝦的經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.3 鹽堿地克氏原螯蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
2 miRNA研究進(jìn)展概述
2.1 miRNA的定義及發(fā)現(xiàn)歷程
2.2 miRNA的加工成熟過程及作用機(jī)制
2.3 miRNA的生物學(xué)意義及前景展望
第二章 克氏原螯蝦在鹽脅迫條件下差異化的microRNA表達(dá)譜的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 主要試劑與儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 A型和B型克氏原螯蝦總RNA的提取
2.3.2 Solexa測(cè)序
2.3.3 miRNA的qRT-PCR定量檢測(cè)
2.3.4 鹽度漸變(馴化)條件下的重復(fù)驗(yàn)證
2.4 數(shù)值的統(tǒng)計(jì)分析
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5.1. 使用Solexa測(cè)序技術(shù)構(gòu)建克氏原螯蝦的小RNA文庫
2.5.2 克氏原螯蝦的miRNA表達(dá)譜
2.5.3 使用qRT-PCR技術(shù)確證克氏原螯蝦miRNA
2.5.4 鹽度漸變實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.6 討論
第三章 不同蕪萍餌料組分對(duì)兩種社群規(guī)模的螯蝦生長(zhǎng)影響
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)分組
3.1.3 實(shí)驗(yàn)條件
3.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 最小社群實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.2 較大社群實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.3 小社群和較大社群的比較
3.3 討論
第四章 小群體的規(guī)模對(duì)克氏原螯蝦生存和生長(zhǎng)的影響
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)分組
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 死亡事件發(fā)生率及個(gè)體存活率結(jié)果分析
4.2.2 個(gè)體生長(zhǎng)指標(biāo)結(jié)果及分析
4.3. 討論
4.3.1 實(shí)驗(yàn)組群體規(guī)模設(shè)置
4.3.2 各群體死亡事件發(fā)生率分析
4.3.3 生長(zhǎng)狀況分析
4.4. 小結(jié)和應(yīng)用
4.4.1 小結(jié)
4.4.2 應(yīng)用
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間項(xiàng)目經(jīng)歷
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同蕪萍餌料組分對(duì)兩種社群規(guī)模的螯蝦生長(zhǎng)影響[J]. 季鵬飛,嚴(yán)幸云,黃成,唐建清. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(22)
[2]克氏原螯蝦母性撫育行為及食仔行為對(duì)子代的影響[J]. 熊青海,韋維婷,夏愛軍,黃成. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(03)
[3]池塘養(yǎng)蟹應(yīng)種草[J]. 張金建,孫貴江,張喜貴,于劍. 黑龍江水產(chǎn). 2010(04)
[4]小龍蝦的市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)價(jià)值論述[J]. 鄧澤召. 現(xiàn)代商貿(mào)工業(yè). 2010(13)
[5]克氏原螯蝦同步化與非同步化育苗效果分析[J]. 劉偉杰,嚴(yán)維輝,張成亮,黃成,唐建清. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(34)
[6]克氏原螯蝦繁殖生物學(xué)研究[J]. 龔世園,呂建林,孫瑞杰,李浪平,何緒剛. 淡水漁業(yè). 2008(06)
[7]鹽度變化對(duì)克氏原螯蝦滲透調(diào)節(jié)影響機(jī)制的初步研究[J]. 金彩霞,潘魯青. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(06)
[8]克氏原螯蝦的食性、繁殖和棲息習(xí)性研究[J]. 謝文星,董方勇,謝山,黃道明,梁友光,胡傳林. 水利漁業(yè). 2008(04)
[9]蟹種池塘套養(yǎng)克氏原螯蝦技術(shù)[J]. 周瑞和. 漁業(yè)致富指南. 2007(22)
[10]河蟹、克氏原螯蝦池塘生態(tài)套養(yǎng)技術(shù)[J]. 劉本鳳. 漁業(yè)致富指南. 2007(21)
本文編號(hào):3552167
【文章來源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:63 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
1 克氏原螯蝦概況和研究綜述
1.1 克氏原螯蝦生物學(xué)簡(jiǎn)介
1.2 克氏原螯蝦的經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.3 鹽堿地克氏原螯蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀
2 miRNA研究進(jìn)展概述
2.1 miRNA的定義及發(fā)現(xiàn)歷程
2.2 miRNA的加工成熟過程及作用機(jī)制
2.3 miRNA的生物學(xué)意義及前景展望
第二章 克氏原螯蝦在鹽脅迫條件下差異化的microRNA表達(dá)譜的研究
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 主要試劑與儀器
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 A型和B型克氏原螯蝦總RNA的提取
2.3.2 Solexa測(cè)序
2.3.3 miRNA的qRT-PCR定量檢測(cè)
2.3.4 鹽度漸變(馴化)條件下的重復(fù)驗(yàn)證
2.4 數(shù)值的統(tǒng)計(jì)分析
2.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.5.1. 使用Solexa測(cè)序技術(shù)構(gòu)建克氏原螯蝦的小RNA文庫
2.5.2 克氏原螯蝦的miRNA表達(dá)譜
2.5.3 使用qRT-PCR技術(shù)確證克氏原螯蝦miRNA
2.5.4 鹽度漸變實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.6 討論
第三章 不同蕪萍餌料組分對(duì)兩種社群規(guī)模的螯蝦生長(zhǎng)影響
3.1 材料與方法
3.1.1 材料
3.1.2 實(shí)驗(yàn)分組
3.1.3 實(shí)驗(yàn)條件
3.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 最小社群實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.2 較大社群實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
3.2.3 小社群和較大社群的比較
3.3 討論
第四章 小群體的規(guī)模對(duì)克氏原螯蝦生存和生長(zhǎng)的影響
4.1 材料與方法
4.1.1 材料
4.1.2 實(shí)驗(yàn)分組
4.1.3 實(shí)驗(yàn)方法
4.1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)
4.2 結(jié)果與分析
4.2.1 死亡事件發(fā)生率及個(gè)體存活率結(jié)果分析
4.2.2 個(gè)體生長(zhǎng)指標(biāo)結(jié)果及分析
4.3. 討論
4.3.1 實(shí)驗(yàn)組群體規(guī)模設(shè)置
4.3.2 各群體死亡事件發(fā)生率分析
4.3.3 生長(zhǎng)狀況分析
4.4. 小結(jié)和應(yīng)用
4.4.1 小結(jié)
4.4.2 應(yīng)用
第五章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間項(xiàng)目經(jīng)歷
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]不同蕪萍餌料組分對(duì)兩種社群規(guī)模的螯蝦生長(zhǎng)影響[J]. 季鵬飛,嚴(yán)幸云,黃成,唐建清. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(22)
[2]克氏原螯蝦母性撫育行為及食仔行為對(duì)子代的影響[J]. 熊青海,韋維婷,夏愛軍,黃成. 水產(chǎn)科技情報(bào). 2011(03)
[3]池塘養(yǎng)蟹應(yīng)種草[J]. 張金建,孫貴江,張喜貴,于劍. 黑龍江水產(chǎn). 2010(04)
[4]小龍蝦的市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)價(jià)值論述[J]. 鄧澤召. 現(xiàn)代商貿(mào)工業(yè). 2010(13)
[5]克氏原螯蝦同步化與非同步化育苗效果分析[J]. 劉偉杰,嚴(yán)維輝,張成亮,黃成,唐建清. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(34)
[6]克氏原螯蝦繁殖生物學(xué)研究[J]. 龔世園,呂建林,孫瑞杰,李浪平,何緒剛. 淡水漁業(yè). 2008(06)
[7]鹽度變化對(duì)克氏原螯蝦滲透調(diào)節(jié)影響機(jī)制的初步研究[J]. 金彩霞,潘魯青. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(06)
[8]克氏原螯蝦的食性、繁殖和棲息習(xí)性研究[J]. 謝文星,董方勇,謝山,黃道明,梁友光,胡傳林. 水利漁業(yè). 2008(04)
[9]蟹種池塘套養(yǎng)克氏原螯蝦技術(shù)[J]. 周瑞和. 漁業(yè)致富指南. 2007(22)
[10]河蟹、克氏原螯蝦池塘生態(tài)套養(yǎng)技術(shù)[J]. 劉本鳳. 漁業(yè)致富指南. 2007(21)
本文編號(hào):3552167
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