雜色鮑在不同外界因子脅迫下HIF信號(hào)通路相關(guān)基因的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-17 02:01
近些年,全球氣候的變暖已經(jīng)對自然和社會(huì)環(huán)境產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。在海洋生態(tài)系統(tǒng)中,水溫的升高可能會(huì)導(dǎo)致一系列的負(fù)面影響,如微生物的大量繁殖和溶解氧的降低。這些環(huán)境因素的改變最終將導(dǎo)致水生生物暴露于缺氧的環(huán)境中。一般情況下,外界環(huán)境的改變往往會(huì)誘發(fā)機(jī)體內(nèi)一系列的生理生化的變化來適應(yīng)這一改變。而這一適應(yīng)的過程,在很大程度上都依賴于編碼這些理化反應(yīng)相關(guān)蛋白基因的表達(dá)水平的改變。缺氧誘導(dǎo)因子1(Hypoxia inducible factor 1,HIF-1)包括α和β兩個(gè)亞基,是缺氧環(huán)境下的一個(gè)主要的轉(zhuǎn)錄因子,可以通過對不同基因表達(dá)水平的調(diào)節(jié)來適應(yīng)缺氧的環(huán)境。本研究首次對雜色鮑(Haliotis diversicolor)的HIF-1α、HIF-1β和硒結(jié)合蛋白1(Selenium-binding protein 1,SBP1)基因進(jìn)行了報(bào)道,并分別將雜色鮑的HIF-1α、HIF-1β和SBP1基因命名為HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1。同時(shí),采用生物信息學(xué)的方法分析了雜色鮑的HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因的特征。另外,我們還利用實(shí)時(shí)定量PCR和RNA干擾等...
【文章來源】: 集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 HIF信號(hào)通路相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)與功能的研究進(jìn)展
1.1.1 HIF信號(hào)通路核心基因HIF-1
1.1.2 SBP1、NOS及TNF-α基因
1.2 HIF-1 的表達(dá)調(diào)控及靶基因引起的生物學(xué)效應(yīng)研究進(jìn)展
1.2.1 HIF-1 的表達(dá)調(diào)控
1.2.2 HIF-1 的靶基因
1.2.3 紅細(xì)胞生成或鐵代謝
1.2.4 血管生成
1.2.5 葡萄糖代謝
1.2.6 細(xì)胞增殖/生存及細(xì)胞凋亡
1.3 HIF信號(hào)通路相關(guān)基因在水生動(dòng)物中的研究進(jìn)展
1.4 本研究的內(nèi)容和目的意義
1.4.1 研究的內(nèi)容
1.4.2 目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要儀器與試劑
2.1.3 引物
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 總RNA的提。≧DP法)及去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一鏈和RT-PCR擴(kuò)增獲取基因片段
2.2.3 SMART-RACE技術(shù)獲取基因全長
2.2.4 割膠純化基因片段
2.2.5 與PET19-T質(zhì)粒載體連接
2.2.6 JM109感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化及篩選
2.2.7 質(zhì)粒插入片段的PCR檢測
2.2.8 質(zhì)粒測序
2.2.9 目的基因的生物信息學(xué)分析
2.2.10 缺氧、高溫、缺氧&高溫及弧菌注射的應(yīng)激實(shí)驗(yàn)
2.2.11 dsRNA的合成
2.2.12 雜色鮑血細(xì)胞的培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)
2.2.13 RNA干擾
2.2.14 實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系及條件
第3章 結(jié)果
3.1 總RNA的抽提結(jié)果
3.2 RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3 雜色鮑HIF信號(hào)通路相關(guān)基因的序列分析
3.3.1 HdHIF-1α基因的序列分析
3.3.2 HdHIF-1β基因的序列分析
3.3.3 HdSBP1基因的序列分析
3.4 雜色鮑HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因在不同組織器官中的表達(dá)分析
3.5 雜色鮑HIF信號(hào)通路相關(guān)基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.1 雜色鮑HdHIF-1α基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.2 雜色鮑HdHIF-1β基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.3 雜色鮑HdSBP1基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.4 雜色鮑HdNOS基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.5 雜色鮑HdTNFα基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.6 HdHIF-1α基因的RNA干擾之后表達(dá)
第4章 討論
4.1 HdHIF-1 基因
4.2 HdSBP1、HdNOS及HdTNF-α基因
4.3 HIF-1 基因干擾后若干靶基因的表達(dá)
第5章 結(jié)論與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]溫度對雜色鮑不同群體生長率與存活率的影響 [J]. 游偉偉,林煥陽,駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺(tái)灣海峽. 2011(04)
[2]雜色鮑對高溫和低鹽耐受力的初步研究 [J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(04)
[3]HIF-1與腫瘤乏氧及其治療中應(yīng)用的研究進(jìn)展 [J]. 潘松旦,馬勝林. 浙江臨床醫(yī)學(xué). 2008(10)
[4]COPD患者治療前后血清hs-CRP、TNF-α、IL-6、IL-8檢測的臨床意義 [J]. 胡蓉. 放射免疫學(xué)雜志. 2007(06)
[5]工廠化養(yǎng)殖雜色鮑致病菌副溶血弧菌的分離鑒定及其生理特性 [J]. 鄧先余,王智學(xué),孫成波,陳曉艷,何建國. 海洋科學(xué). 2007(11)
[6]Caspase Family Proteases and Apoptosis [J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[7]缺氧誘導(dǎo)因子-1在缺氧誘導(dǎo)一氧化氮合成酶基因表達(dá)中的作用 [J]. 潘德順,陳偉強(qiáng),張德興. 解剖學(xué)研究. 2004(02)
[8]養(yǎng)殖對蝦細(xì)菌性紅體病的初步研究 [J]. 周永燦,張本,陳雪芬,錢家英. 海洋科學(xué). 2003(05)
[9]我國鮑養(yǎng)殖病害研究進(jìn)展 [J]. 陳信忠,龔艷清. 福建水產(chǎn). 2002(02)
[10]網(wǎng)箱養(yǎng)殖石斑魚暴發(fā)性潰瘍病病原菌分離、鑒定及致病性研究 [J]. 朱傳華,何建國,黃志堅(jiān). 中山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2000(S1)
本文編號(hào):3539206
【文章來源】: 集美大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【文章目錄】:
摘要
abstract
第1章 引言
1.1 HIF信號(hào)通路相關(guān)基因的結(jié)構(gòu)與功能的研究進(jìn)展
1.1.1 HIF信號(hào)通路核心基因HIF-1
1.1.2 SBP1、NOS及TNF-α基因
1.2 HIF-1 的表達(dá)調(diào)控及靶基因引起的生物學(xué)效應(yīng)研究進(jìn)展
1.2.1 HIF-1 的表達(dá)調(diào)控
1.2.2 HIF-1 的靶基因
1.2.3 紅細(xì)胞生成或鐵代謝
1.2.4 血管生成
1.2.5 葡萄糖代謝
1.2.6 細(xì)胞增殖/生存及細(xì)胞凋亡
1.3 HIF信號(hào)通路相關(guān)基因在水生動(dòng)物中的研究進(jìn)展
1.4 本研究的內(nèi)容和目的意義
1.4.1 研究的內(nèi)容
1.4.2 目的與意義
第2章 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要儀器與試劑
2.1.3 引物
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 總RNA的提。≧DP法)及去除DNA的污染
2.2.2 合成RT-PCR cDNA第一鏈和RT-PCR擴(kuò)增獲取基因片段
2.2.3 SMART-RACE技術(shù)獲取基因全長
2.2.4 割膠純化基因片段
2.2.5 與PET19-T質(zhì)粒載體連接
2.2.6 JM109感受態(tài)細(xì)胞的轉(zhuǎn)化及篩選
2.2.7 質(zhì)粒插入片段的PCR檢測
2.2.8 質(zhì)粒測序
2.2.9 目的基因的生物信息學(xué)分析
2.2.10 缺氧、高溫、缺氧&高溫及弧菌注射的應(yīng)激實(shí)驗(yàn)
2.2.11 dsRNA的合成
2.2.12 雜色鮑血細(xì)胞的培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)
2.2.13 RNA干擾
2.2.14 實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)體系及條件
第3章 結(jié)果
3.1 總RNA的抽提結(jié)果
3.2 RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.3 雜色鮑HIF信號(hào)通路相關(guān)基因的序列分析
3.3.1 HdHIF-1α基因的序列分析
3.3.2 HdHIF-1β基因的序列分析
3.3.3 HdSBP1基因的序列分析
3.4 雜色鮑HdHIF-1α、HdHIF-1β和HdSBP1基因在不同組織器官中的表達(dá)分析
3.5 雜色鮑HIF信號(hào)通路相關(guān)基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.1 雜色鮑HdHIF-1α基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.2 雜色鮑HdHIF-1β基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.3 雜色鮑HdSBP1基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.4 雜色鮑HdNOS基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.5.5 雜色鮑HdTNFα基因在不同應(yīng)激下的表達(dá)分析
3.6 HdHIF-1α基因的RNA干擾之后表達(dá)
第4章 討論
4.1 HdHIF-1 基因
4.2 HdSBP1、HdNOS及HdTNF-α基因
4.3 HIF-1 基因干擾后若干靶基因的表達(dá)
第5章 結(jié)論與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]溫度對雜色鮑不同群體生長率與存活率的影響 [J]. 游偉偉,林煥陽,駱軒,王德祥,林壯炳,柯才煥. 臺(tái)灣海峽. 2011(04)
[2]雜色鮑對高溫和低鹽耐受力的初步研究 [J]. 劉賢德,閆玉華,王志勇,蔡明夷,柯才煥. 集美大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(04)
[3]HIF-1與腫瘤乏氧及其治療中應(yīng)用的研究進(jìn)展 [J]. 潘松旦,馬勝林. 浙江臨床醫(yī)學(xué). 2008(10)
[4]COPD患者治療前后血清hs-CRP、TNF-α、IL-6、IL-8檢測的臨床意義 [J]. 胡蓉. 放射免疫學(xué)雜志. 2007(06)
[5]工廠化養(yǎng)殖雜色鮑致病菌副溶血弧菌的分離鑒定及其生理特性 [J]. 鄧先余,王智學(xué),孫成波,陳曉艷,何建國. 海洋科學(xué). 2007(11)
[6]Caspase Family Proteases and Apoptosis [J]. Ting-Jun FAN Li-Hui HAN Ri-Shan CONG Jin LIANG College of Marine Life Sciences,Division of Life Science and Technology,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;College of Chemistry & Chemical Engineering,Ocean University of China,Qingdao 266003,China. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2005(11)
[7]缺氧誘導(dǎo)因子-1在缺氧誘導(dǎo)一氧化氮合成酶基因表達(dá)中的作用 [J]. 潘德順,陳偉強(qiáng),張德興. 解剖學(xué)研究. 2004(02)
[8]養(yǎng)殖對蝦細(xì)菌性紅體病的初步研究 [J]. 周永燦,張本,陳雪芬,錢家英. 海洋科學(xué). 2003(05)
[9]我國鮑養(yǎng)殖病害研究進(jìn)展 [J]. 陳信忠,龔艷清. 福建水產(chǎn). 2002(02)
[10]網(wǎng)箱養(yǎng)殖石斑魚暴發(fā)性潰瘍病病原菌分離、鑒定及致病性研究 [J]. 朱傳華,何建國,黃志堅(jiān). 中山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2000(S1)
本文編號(hào):3539206
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