中華絨螯蟹Tetraspanin在螺原體感染過程中的功能研究
發(fā)布時間:2021-12-15 23:28
中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)又稱河蟹、毛蟹,是我國重要的淡水養(yǎng)殖品種,具有很高的經濟價值。但是,由于養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大,其病害也越來越嚴重,其中“顫抖病”作為中華絨螯蟹最嚴重的病害之一,已經對其養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴重的經濟損失。王文等通過前期的研究證實了螺原體為中華絨螯蟹“顫抖病”的病原體,并命名為中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma eriocheiris)。前期研究表明,中華絨螯蟹螺原體通過鰓或表皮進入體內,侵染其靶細胞—血淋巴細胞,并通過血液循環(huán)進而侵染結締、神經等組織引起中華絨螯蟹附肢顫抖。Tetraspanin屬于四次跨膜蛋白超家族(TM4SF),參與基本的細胞過程,包括細胞生長、粘附和分化,參與識別某些病原體的感染,在免疫反應中發(fā)揮著重要的作用。本課題組前期利用iTraq技術篩選了中華絨螯蟹螺原體侵染前后中華絨螯蟹血淋巴細胞中差異表達的蛋白,其中Tetraspanin在中華絨螯蟹螺原體感染后表達量顯著降低。本碩士論文在此研究基礎上通過RACE技術擴增得到了中華絨螯蟹Tetraspanin(EsTetraspanin)基因的全長,進而分析了其序列特征、表達...
【文章來源】:南京師范大學江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Tetraspanins富集的微區(qū)
圖 2.1 EsTetraspanin 的核酸序列和對應的氨基酸序列。起始(atg)和終止(tag)密碼子用紅色標記。 跨膜區(qū)域用粗體和斜體表示。 SEL 結構加下劃線,LEL 結構加陰影。 CCG基序用方框標出,9 個潛在的棕櫚;稽c用藍色標出。Fig. 2.1 Nucleotide and deduced amino acid sequences (below) of EsTetraspanin cDNA from E.sinensis. Start (atg) and stop (tag) codon are marked in red. Transmembrane region is bold andindicated in italics. The SEL domain is underlined and the LEL domain is shaded. The CCG motifis boxed and 9 potential palmitoylation sites are in blue.
圖 2.2 EsTetraspanin 的氨基酸序列模型。每個圓圈中的字母代表一個氨基酸,包括 SEL,LEL,跨膜區(qū)和 N-,C-末端片段。保守基序(CCG)和潛在的棕櫚;稽c突出顯示。Fig. 2.2 Model of sequence of EsTetraspanin in single-letter amino acid code of its loop domains,including SEL, LEL, transmembrane region and the N-, C- terminal fragments. Conserved motif(CCG) and potential palmitoylation sites are highlighted.2.3.3 多序列比對和系統(tǒng)進化樹分析BLAST 分析顯示 EsTetraspanin 與其他甲殼類動物之間存在顯著的序列相似性(圖 2.3)。為了分析 EsTetraspanin 與其他 Tetraspanins 之間的進化關系,我們構建了一個系統(tǒng)發(fā)育樹。如圖 2.4 所示,結果顯示 EsTetraspanin 在進化上主要分為兩支。EsTetraspanin 主要與甲殼動物,包括擬穴青蟹(Scyllaparamamosain)、羅氏沼蝦(Macrobrachiumrosenbergii)、南美白對蝦(Penaeusvannamei)和中國對蝦(Penaeuschinensis)等的 Tetraspanins 分為一支,而其他物種的 Tetraspanins則分為另一支。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水生無脊椎動物血淋巴細胞分類及免疫研究進展[J]. 吳芳麗,王月,尚躍勇,嚴桂珍,孔輝,胡夢紅,呂為群,王有基. 大連海洋大學學報. 2016(06)
[2]蝦蟹新型病原螺原體的發(fā)現(xiàn)和研究[J]. 王文. 南京師大學報(自然科學版). 2016(01)
[3]中國明對蝦(Fenneropenaeus chinensis)Tetraspanin-3與WSSV的體外相互作用[J]. 關廣闊,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學進展. 2015(06)
[4]長江水系中華絨螯蟹種質資源研究進展[J]. 李曉暉,許志強,葛家春,朱清順,潘建林. 水產養(yǎng)殖. 2009(10)
[5]中華絨螯蟹顫抖病研究進展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科學. 2005(01)
[6]免疫增強劑對中華絨螯蟹免疫功能的影響[J]. 沈錦玉,劉問,曹錚,尹文林,沈智華,錢冬,吳穎蕾. 浙江農業(yè)學報. 2004(01)
[7]RNA干擾作用(RNAi)研究進展[J]. 陳忠斌,于樂成,王升啟. 中國生物化學與分子生物學報. 2002(05)
[8]甲殼動物細胞及體液免疫機理的研究進展[J]. 徐海圣,徐步進. 大連水產學院學報. 2001(01)
[9]中華絨螯蟹病毒病病原的初步研究[J]. 沈錦玉,錢冬,劉問,尹文林,沈智華,曹錚,吳穎蕾,張念慈. 華中農業(yè)大學學報. 2000(05)
[10]河蟹顫抖病的研究現(xiàn)狀 (上 )[J]. 黃琪琰. 科學養(yǎng)魚. 2000(10)
博士論文
[1]中華絨螯蟹螺原體侵染羅氏沼蝦血細胞過程中互作蛋白的篩選及功能研究[D]. 修云吉.南京師范大學 2015
碩士論文
[1]蜜蜂螺原體幾丁質酶、幾丁質脫乙酰酶基因的研究及螺原體對意蜂抗氧化相關酶的影響[D]. 危蓉萍.南京農業(yè)大學 2016
[2]七鰓鰻CD82的原核表達、抗體制備及相關免疫組織化學研究[D]. 張曉萍.遼寧師范大學 2016
[3]中華絨螯蟹螺原體侵染兩種靶細胞模型的建立及互作相關蛋白的初步篩選[D]. 姚偉.南京師范大學 2013
本文編號:3537341
【文章來源】:南京師范大學江蘇省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
Tetraspanins富集的微區(qū)
圖 2.1 EsTetraspanin 的核酸序列和對應的氨基酸序列。起始(atg)和終止(tag)密碼子用紅色標記。 跨膜區(qū)域用粗體和斜體表示。 SEL 結構加下劃線,LEL 結構加陰影。 CCG基序用方框標出,9 個潛在的棕櫚;稽c用藍色標出。Fig. 2.1 Nucleotide and deduced amino acid sequences (below) of EsTetraspanin cDNA from E.sinensis. Start (atg) and stop (tag) codon are marked in red. Transmembrane region is bold andindicated in italics. The SEL domain is underlined and the LEL domain is shaded. The CCG motifis boxed and 9 potential palmitoylation sites are in blue.
圖 2.2 EsTetraspanin 的氨基酸序列模型。每個圓圈中的字母代表一個氨基酸,包括 SEL,LEL,跨膜區(qū)和 N-,C-末端片段。保守基序(CCG)和潛在的棕櫚;稽c突出顯示。Fig. 2.2 Model of sequence of EsTetraspanin in single-letter amino acid code of its loop domains,including SEL, LEL, transmembrane region and the N-, C- terminal fragments. Conserved motif(CCG) and potential palmitoylation sites are highlighted.2.3.3 多序列比對和系統(tǒng)進化樹分析BLAST 分析顯示 EsTetraspanin 與其他甲殼類動物之間存在顯著的序列相似性(圖 2.3)。為了分析 EsTetraspanin 與其他 Tetraspanins 之間的進化關系,我們構建了一個系統(tǒng)發(fā)育樹。如圖 2.4 所示,結果顯示 EsTetraspanin 在進化上主要分為兩支。EsTetraspanin 主要與甲殼動物,包括擬穴青蟹(Scyllaparamamosain)、羅氏沼蝦(Macrobrachiumrosenbergii)、南美白對蝦(Penaeusvannamei)和中國對蝦(Penaeuschinensis)等的 Tetraspanins 分為一支,而其他物種的 Tetraspanins則分為另一支。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]水生無脊椎動物血淋巴細胞分類及免疫研究進展[J]. 吳芳麗,王月,尚躍勇,嚴桂珍,孔輝,胡夢紅,呂為群,王有基. 大連海洋大學學報. 2016(06)
[2]蝦蟹新型病原螺原體的發(fā)現(xiàn)和研究[J]. 王文. 南京師大學報(自然科學版). 2016(01)
[3]中國明對蝦(Fenneropenaeus chinensis)Tetraspanin-3與WSSV的體外相互作用[J]. 關廣闊,劉慶慧,黃倢. 漁業(yè)科學進展. 2015(06)
[4]長江水系中華絨螯蟹種質資源研究進展[J]. 李曉暉,許志強,葛家春,朱清順,潘建林. 水產養(yǎng)殖. 2009(10)
[5]中華絨螯蟹顫抖病研究進展[J]. 方敏,宋林生,崔朝霞. 海洋科學. 2005(01)
[6]免疫增強劑對中華絨螯蟹免疫功能的影響[J]. 沈錦玉,劉問,曹錚,尹文林,沈智華,錢冬,吳穎蕾. 浙江農業(yè)學報. 2004(01)
[7]RNA干擾作用(RNAi)研究進展[J]. 陳忠斌,于樂成,王升啟. 中國生物化學與分子生物學報. 2002(05)
[8]甲殼動物細胞及體液免疫機理的研究進展[J]. 徐海圣,徐步進. 大連水產學院學報. 2001(01)
[9]中華絨螯蟹病毒病病原的初步研究[J]. 沈錦玉,錢冬,劉問,尹文林,沈智華,曹錚,吳穎蕾,張念慈. 華中農業(yè)大學學報. 2000(05)
[10]河蟹顫抖病的研究現(xiàn)狀 (上 )[J]. 黃琪琰. 科學養(yǎng)魚. 2000(10)
博士論文
[1]中華絨螯蟹螺原體侵染羅氏沼蝦血細胞過程中互作蛋白的篩選及功能研究[D]. 修云吉.南京師范大學 2015
碩士論文
[1]蜜蜂螺原體幾丁質酶、幾丁質脫乙酰酶基因的研究及螺原體對意蜂抗氧化相關酶的影響[D]. 危蓉萍.南京農業(yè)大學 2016
[2]七鰓鰻CD82的原核表達、抗體制備及相關免疫組織化學研究[D]. 張曉萍.遼寧師范大學 2016
[3]中華絨螯蟹螺原體侵染兩種靶細胞模型的建立及互作相關蛋白的初步篩選[D]. 姚偉.南京師范大學 2013
本文編號:3537341
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