Toll樣受體（Toll-like receptors,TLRs）作為一類重要的模式識別受體（pattern-recognition receptors,PRRs）,主要負責識別病原相關分子模式（pathogen associated molecular patterns,PAMPs）,啟動先天免疫系統(tǒng)抵御病原微生物的入侵。TLRs除了啟動先天免疫外,還可調節(jié)適應性免疫,是連接先天免疫和適應性免疫的橋梁。TLR21和TLR22是TLRs家族的重要成員,主要存在于鳥類、兩棲類或魚類中;TRAF3和IRAK1是TLRs信號轉導通路中的重要分子,在TLRs信號轉導級聯(lián)反應中具有重要作用。卵形鯧鲹（Trachinotus ovatus）是我國南方重要的海水養(yǎng)殖經濟魚類,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴大,病害不時發(fā)生,給卵形鯧鲹養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大經濟損失。鑒于TLR21、TLR22、TRAF3和IRAK1在免疫中具有重要功能,本研究采用RACE-PCR和RT-PCR技術克隆了卵形鯧鲹TLR21（TrTLR21）、TrTLR22、TrTRAF3和TrIRAK1基因;應用生物信息學分析上述基因的序列特征和蛋白結構... 

【文章來源】：廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１?ＴＬＲｓ信號通路圖［４９］??Ｆｉｇ．?１－１?ＴＬＲｓ?ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ??３?ＴＬＲ２１／ＴＬＲ２２／ＩＲＡＫ１／ＴＲＡＦ３進

卵形鯧鰺脾臟總ＲＮＡ的ＯＤ２６０／ＯＤ２８０值１．９８，?ＯＤ２６０／ＯＤ２３０值為２．０９，濃度為??６６５．８?ｎｇ４ｉＬ，?ＲＮＡ濃度和純度符合要求；用１％的瓊脂糖凝膠電泳檢測結果中，２８Ｓ、??１８Ｓ和５Ｓ核糖體ＲＮＡ的比例符合預期結果（如圖２－１）。??Ｍ?Ｒ??２０００ｂｐ?■??ｌＯＯＯｂｐ?—Ｂ??圖２－１卵形鯧鰺脾臟總ＲＮＡ??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｉｓｏｌａｔｅｄ?ｆｒｏｍ?ｓｐｌｅｅｎ?ｏｆ?Ｔｒａｃｈｉｎｏｔｕｓ?ｏｖａｔｕｓ??４．２卵形鯧鰺ＴＬＲ２１和ＴＬＲ２２基因中間和末端片段擴增結果??將測序結果拼接后在ＮＣＢＩ的在線軟件ＢｌａｓｔＸ進行同源性查找，確定所得基因全長??為ＴｒＴＬＲ２１和ＴｒＴＬＲ２２。向ＮＣＢＩ提交登錄號，ＴｒＴＬＲ２１基因的登錄號為ＭＫ２９９８４２；??ＴｒＴＬＲ２２基因的登錄號為ＭＫ２３１１６。??２３??

圖Ａ?圖Ｂ??圖２－４ＴｒＴＬＲ２１?３Ｄ結構模型??Ｆｉｇ．２－４?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１??圖Ａ為卵形鯧鰺ＴＬＲ２１－ＬＲＲ?３Ｄ結構圖；圖Ｂ為卵形鯧鰺ＴＬＲ２１－ＴＩＲ?３Ｄ結構圖；??Ａ：?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１－ＬＲＲ；?Ｂ：?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１－ＴＩＲ；??４．３．２卵形鯧鯪ＴＬＲ２２的序列特征和蛋白結構??ＴｒＴＬＲ２２?ｃＤＮＡ全長３４５４?ｂｐ，編碼了?９５９個氨基酸，該ｃＤＮＡ序列包含５＇ＵＴＲ?２０４??ｂｐ、ＯＲＦ２８８０ｂｐ和３＇ＵＴＲ３７０ｂｐ，其中在３＇翻譯區(qū)還有兩個個不穩(wěn)定基序（ａｔｔｔａ）和一??個加尾信號（ａｔｔａａａ）（圖２－５）。預測蛋白質分子質量為１１０．８０?ＫＤ，等電點為８．７１。ＳＭＡＲＴ??分析顯示，ＴｒＴＬＲ２２胞外域有３個ＬＲＲ－ＴＹＰ基序，有１３個ＬＲＲ基序和１個ＬＲＲ－ＣＴ??基序，跨膜結構域和胞內ＴＩＲ結構域（圖２－６）。ＴｒＴＬＲ２２－ＬＲＲ的３Ｄ結構模型和??ＴｒＴＬＲ２２－ＴＩＲ的３Ｄ結構模型如圖２－７所示，ＴｒＴＬＲ２２－ＬＲＲ結構域由２３個［３－折疊和２０??個ａ－螺旋以及數(shù)個無規(guī)則卷曲形成馬蹄狀結構，ＴｒＴＬＲ２２－ＴＩＲ結構域由５個ａ－螺旋和４??２７??


本文編號：3521628