Toll樣受體（Toll-like receptors,TLRs）作為一類重要的模式識(shí)別受體（pattern-recognition receptors,PRRs）,主要負(fù)責(zé)識(shí)別病原相關(guān)分子模式（pathogen associated molecular patterns,PAMPs）,啟動(dòng)先天免疫系統(tǒng)抵御病原微生物的入侵。TLRs除了啟動(dòng)先天免疫外,還可調(diào)節(jié)適應(yīng)性免疫,是連接先天免疫和適應(yīng)性免疫的橋梁。TLR21和TLR22是TLRs家族的重要成員,主要存在于鳥(niǎo)類、兩棲類或魚類中;TRAF3和IRAK1是TLRs信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中的重要分子,在TLRs信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)級(jí)聯(lián)反應(yīng)中具有重要作用。卵形鯧鲹（Trachinotus ovatus）是我國(guó)南方重要的海水養(yǎng)殖經(jīng)濟(jì)魚類,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大,病害不時(shí)發(fā)生,給卵形鯧鲹養(yǎng)殖業(yè)帶來(lái)巨大經(jīng)濟(jì)損失。鑒于TLR21、TLR22、TRAF3和IRAK1在免疫中具有重要功能,本研究采用RACE-PCR和RT-PCR技術(shù)克隆了卵形鯧鲹TLR21（TrTLR21）、TrTLR22、TrTRAF3和TrIRAK1基因;應(yīng)用生物信息學(xué)分析上述基因的序列特征和蛋白結(jié)構(gòu)... 

【文章來(lái)源】：廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：105 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１?ＴＬＲｓ信號(hào)通路圖［４９］??Ｆｉｇ．?１－１?ＴＬＲｓ?ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙｓ??３?ＴＬＲ２１／ＴＬＲ２２／ＩＲＡＫ１／ＴＲＡＦ３進(jìn)

卵形鯧鰺脾臟總ＲＮＡ的ＯＤ２６０／ＯＤ２８０值１．９８，?ＯＤ２６０／ＯＤ２３０值為２．０９，濃度為??６６５．８?ｎｇ４ｉＬ，?ＲＮＡ濃度和純度符合要求；用１％的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果中，２８Ｓ、??１８Ｓ和５Ｓ核糖體ＲＮＡ的比例符合預(yù)期結(jié)果（如圖２－１）。??Ｍ?Ｒ??２０００ｂｐ?■??ｌＯＯＯｂｐ?—Ｂ??圖２－１卵形鯧鰺脾臟總ＲＮＡ??Ｆｉｇ．２－１?Ｔｏｔａｌ?ＲＮＡ?ｉｓｏｌａｔｅｄ?ｆｒｏｍ?ｓｐｌｅｅｎ?ｏｆ?Ｔｒａｃｈｉｎｏｔｕｓ?ｏｖａｔｕｓ??４．２卵形鯧鰺ＴＬＲ２１和ＴＬＲ２２基因中間和末端片段擴(kuò)增結(jié)果??將測(cè)序結(jié)果拼接后在ＮＣＢＩ的在線軟件ＢｌａｓｔＸ進(jìn)行同源性查找，確定所得基因全長(zhǎng)??為ＴｒＴＬＲ２１和ＴｒＴＬＲ２２。向ＮＣＢＩ提交登錄號(hào)，ＴｒＴＬＲ２１基因的登錄號(hào)為ＭＫ２９９８４２；??ＴｒＴＬＲ２２基因的登錄號(hào)為ＭＫ２３１１６。??２３??

圖Ａ?圖Ｂ??圖２－４ＴｒＴＬＲ２１?３Ｄ結(jié)構(gòu)模型??Ｆｉｇ．２－４?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１??圖Ａ為卵形鯧鰺ＴＬＲ２１－ＬＲＲ?３Ｄ結(jié)構(gòu)圖；圖Ｂ為卵形鯧鰺ＴＬＲ２１－ＴＩＲ?３Ｄ結(jié)構(gòu)圖；??Ａ：?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１－ＬＲＲ；?Ｂ：?Ｔｈｅ?３Ｄ?ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ＴｒＴＬＲ２１－ＴＩＲ；??４．３．２卵形鯧鯪ＴＬＲ２２的序列特征和蛋白結(jié)構(gòu)??ＴｒＴＬＲ２２?ｃＤＮＡ全長(zhǎng)３４５４?ｂｐ，編碼了?９５９個(gè)氨基酸，該ｃＤＮＡ序列包含５＇ＵＴＲ?２０４??ｂｐ、ＯＲＦ２８８０ｂｐ和３＇ＵＴＲ３７０ｂｐ，其中在３＇翻譯區(qū)還有兩個(gè)個(gè)不穩(wěn)定基序（ａｔｔｔａ）和一??個(gè)加尾信號(hào)（ａｔｔａａａ）（圖２－５）。預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為１１０．８０?ＫＤ，等電點(diǎn)為８．７１。ＳＭＡＲＴ??分析顯示，ＴｒＴＬＲ２２胞外域有３個(gè)ＬＲＲ－ＴＹＰ基序，有１３個(gè)ＬＲＲ基序和１個(gè)ＬＲＲ－ＣＴ??基序，跨膜結(jié)構(gòu)域和胞內(nèi)ＴＩＲ結(jié)構(gòu)域（圖２－６）。ＴｒＴＬＲ２２－ＬＲＲ的３Ｄ結(jié)構(gòu)模型和??ＴｒＴＬＲ２２－ＴＩＲ的３Ｄ結(jié)構(gòu)模型如圖２－７所示，ＴｒＴＬＲ２２－ＬＲＲ結(jié)構(gòu)域由２３個(gè)［３－折疊和２０??個(gè)ａ－螺旋以及數(shù)個(gè)無(wú)規(guī)則卷曲形成馬蹄狀結(jié)構(gòu)，ＴｒＴＬＲ２２－ＴＩＲ結(jié)構(gòu)域由５個(gè)ａ－螺旋和４??２７??


本文編號(hào)：3521628